164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3520 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3520  Citrate transporter  100 
 
 
374 aa  697    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000961964  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2935  transporter  41.95 
 
 
383 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3157  transporter  41.95 
 
 
383 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2909  transporter  42.02 
 
 
383 aa  264  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.204967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3145  putative transporter  40.8 
 
 
383 aa  265  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3166  putative transporter  42.02 
 
 
383 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2095  putative transporter  41.49 
 
 
383 aa  263  3e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3173  putative transporter  41.22 
 
 
383 aa  263  4e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.745852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2859  transporter  41.22 
 
 
409 aa  256  5e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.265572  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1874  citrate transporter  39.89 
 
 
377 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.870467  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3129  citrate transporter  38.33 
 
 
370 aa  210  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.246897  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13780  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  35.6 
 
 
360 aa  205  1e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0236  Citrate transporter  31.5 
 
 
377 aa  180  4.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0595  di- and tricarboxylate transporter  34.29 
 
 
366 aa  179  5.999999999999999e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1042  citrate transporter  30.96 
 
 
398 aa  168  1e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0077  di- and tricarboxylate transporter  32 
 
 
368 aa  157  4e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000154883  normal  0.998926 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0898  putative di-/tri-carboxylate transporter  29.92 
 
 
395 aa  155  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.878085  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1949  di- or tricarboxylate transporter  32.54 
 
 
392 aa  149  1.0000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00031029  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0097  citrate transporter  29.45 
 
 
378 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4885  Citrate transporter  30.84 
 
 
378 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0114  citrate transporter  30.09 
 
 
376 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0088  citrate transporter  30.25 
 
 
377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0648559  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3279  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  28.86 
 
 
376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.362717  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4486  Citrate transporter  28.24 
 
 
385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.333604  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4619  Citrate transporter  28.24 
 
 
385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325279  normal  0.610654 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3035  citrate transporter  31.96 
 
 
382 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0098  citrate transporter  30.55 
 
 
377 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0442697  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2958  citrate transporter  30 
 
 
376 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0097  citrate transporter  30 
 
 
376 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3316  transporter, putative  29.87 
 
 
377 aa  125  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3360  citrate transporter  32.04 
 
 
370 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3977  transporter, putative  31.09 
 
 
377 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108981  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01905  hypothetical protein  29.52 
 
 
408 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1105  transmembrane protein  29.21 
 
 
369 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0186  transporter, putative  30.45 
 
 
383 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0404913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4051  transporter, putative  30.45 
 
 
377 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0904  citrate transporter family protein  27.18 
 
 
370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0934  citrate transporter family protein  27.04 
 
 
370 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0967  citrate transporter family protein  27.04 
 
 
370 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2948  transporter, putative  30.13 
 
 
383 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0876  citrate transporter family protein  27.04 
 
 
370 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3363  putative transporter  30.13 
 
 
377 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431156  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1595  putative transporter  30.13 
 
 
377 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.169606  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3007  putative transporter  30.13 
 
 
377 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1305  citrate transporter  26.25 
 
 
366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00785  predicted transporter  25.85 
 
 
372 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2824  Citrate transporter  25.85 
 
 
372 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00802  hypothetical protein  25.85 
 
 
372 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0842  citrate transporter family protein  26.15 
 
 
372 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.917388  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2825  citrate transporter  25.85 
 
 
372 aa  107  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0875  citrate transporter family protein  25.85 
 
 
372 aa  107  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0888  citrate transporter family protein  25.85 
 
 
372 aa  107  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0807768  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2530  citrate transporter family protein  26.15 
 
 
372 aa  107  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1354  Citrate transporter  31.82 
 
 
367 aa  104  3e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0783517  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0967  citrate transporter family protein  25.54 
 
 
372 aa  104  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276496  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  24.85 
 
 
405 aa  83.6  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  22.69 
 
 
405 aa  81.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  22.57 
 
 
421 aa  75.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  23.48 
 
 
424 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  24.66 
 
 
427 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  24.93 
 
 
422 aa  69.3  0.00000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  26.3 
 
 
408 aa  69.3  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  24.67 
 
 
429 aa  68.6  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  23.02 
 
 
408 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  24.28 
 
 
423 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  23.4 
 
 
427 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1592  citrate transporter  23.14 
 
 
422 aa  67.4  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  21.2 
 
 
414 aa  67  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  24.22 
 
 
419 aa  66.6  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  21.2 
 
 
431 aa  66.2  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  25.84 
 
 
431 aa  66.2  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  23.68 
 
 
404 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  24.01 
 
 
404 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  27.24 
 
 
402 aa  63.9  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  27.33 
 
 
424 aa  63.5  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  24.15 
 
 
427 aa  62.8  0.000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0209  arsenical pump membrane protein, putative  21.01 
 
 
428 aa  62.4  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.144741  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  22.1 
 
 
425 aa  62  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  25.75 
 
 
423 aa  61.2  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  23.4 
 
 
400 aa  60.1  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1546  citrate transporter  24.86 
 
 
429 aa  60.1  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0084311  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  22.84 
 
 
440 aa  59.3  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  23.56 
 
 
415 aa  58.9  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  20.89 
 
 
425 aa  57.8  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  23.35 
 
 
447 aa  57.8  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  24.78 
 
 
419 aa  56.6  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  25.07 
 
 
424 aa  56.6  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2127  citrate transporter  20.63 
 
 
418 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0956182  normal  0.0626222 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  20.47 
 
 
426 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  25.48 
 
 
427 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2179  Citrate transporter  22.14 
 
 
429 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.365057  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  28.7 
 
 
422 aa  54.3  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  23.33 
 
 
440 aa  53.5  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  22.64 
 
 
428 aa  53.5  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0573  arsenite permease  24.32 
 
 
422 aa  53.1  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.77742  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  33.94 
 
 
428 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0803  citrate transporter  26.51 
 
 
397 aa  53.1  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324785  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2268  Citrate transporter  22.14 
 
 
429 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153576  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  22.07 
 
 
577 aa  53.1  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  30.5 
 
 
429 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>