65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2636 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2636  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 463 aa  919    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  25.83 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  21.47 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1497  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.16 
 
 		 407 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.30393  hitchhiker  0.00778895 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2468  secretion protein HlyD family protein  22.4 
 
 		 393 aa  54.7  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.39 
 
 		 496 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0859  secretion protein HlyD  23.53 
 
 		 402 aa  53.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.556695  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.39 
 
 		 496 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  21.43 
 
 		 342 aa  51.6  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2004  secretion protein HlyD family protein  22.98 
 
 		 380 aa  50.4  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  21.45 
 
 		 368 aa  50.1  0.00008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0535  multidrug resistance protein MdtN  21.46 
 
 		 349 aa  50.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1061  multidrug resistance protein MdtN  21.46 
 
 		 349 aa  50.1  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.182652 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0596  multidrug resistance protein MdtN  21.46 
 
 		 349 aa  50.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789434  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  23.18 
 
 		 371 aa  50.1  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2118  RND family efflux transporter MFP subunit  22.93 
 
 		 418 aa  50.1  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  24.36 
 
 		 347 aa  50.1  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  22.55 
 
 		 366 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  23.79 
 
 		 334 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3201  multidrug resistance protein A  21.36 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3460  multidrug resistance protein A  21.36 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3743  efflux pump membrane protein  18.21 
 
 		 390 aa  48.5  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.881561  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  27.2 
 
 		 323 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  22.14 
 
 		 360 aa  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  22.37 
 
 		 359 aa  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  25 
 
 		 471 aa  47  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3338  efflux pump membrane protein  21.36 
 
 		 390 aa  47  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.615616  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1013  secretion protein HlyD  20.77 
 
 		 394 aa  46.6  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.77 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2562  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.92 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0757424  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4577  secretion protein HlyD  26.21 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.231546  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5404  secretion protein HlyD family protein  22.31 
 
 		 324 aa  45.8  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629231 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2518  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  22.26 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1047  RND family efflux transporter subunit MFP  23.75 
 
 		 461 aa  45.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0423833  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0237  RND family efflux transporter MFP subunit  25.44 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  23.58 
 
 		 323 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2530  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.15 
 
 		 430 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.559583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  23.6 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  40.35 
 
 		 360 aa  44.7  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  23.55 
 
 		 463 aa  44.7  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0999  efflux pump membrane protein  19.6 
 
 		 390 aa  44.3  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.486081  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2737  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  22.04 
 
 		 387 aa  44.3  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.778541  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02505  hypothetical protein  19.6 
 
 		 390 aa  43.9  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003317  membrane-fusion protein  25.53 
 
 		 326 aa  43.9  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02540  multidrug efflux system  19.6 
 
 		 390 aa  43.9  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3930  multidrug resistance protein A  19.6 
 
 		 394 aa  43.9  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.725166 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2807  multidrug resistance protein A  19.6 
 
 		 390 aa  43.9  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000414824  hitchhiker  0.00826621 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  21.84 
 
 		 467 aa  43.9  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2821  multidrug resistance protein A  19.6 
 
 		 390 aa  43.9  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2968  multidrug resistance protein A  19.6 
 
 		 390 aa  43.9  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5137  RND family efflux transporter MFP subunit  31.75 
 
 		 427 aa  43.9  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259338 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1022  efflux pump membrane protein  19.6 
 
 		 390 aa  43.9  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.727271  normal  0.0227655 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02239  hypothetical protein  22.04 
 
 		 387 aa  43.5  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.371729  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  21.73 
 
 		 375 aa  43.5  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1301  efflux pump membrane protein  22.04 
 
 		 387 aa  43.5  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.632829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2505  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  22.04 
 
 		 387 aa  43.5  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.012377  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3168  secretion protein HlyD family protein  26.36 
 
 		 299 aa  43.5  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.279775  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  23.46 
 
 		 349 aa  43.9  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1289  efflux pump membrane protein  22.04 
 
 		 387 aa  43.5  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02278  EmrKY-TolC multidrug resistance efflux pump, membrane fusion protein component  22.04 
 
 		 387 aa  43.5  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.29421  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3599  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  21.63 
 
 		 387 aa  43.5  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0273562 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.82 
 
 		 448 aa  43.5  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  22.58 
 
 		 342 aa  43.5  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3163  efflux pump membrane protein  20.6 
 
 		 390 aa  43.1  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0774  RND family efflux transporter MFP subunit  25.75 
 
 		 418 aa  43.1  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.479896  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>