48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1315 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1315  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  530  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687545 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2434  hypothetical protein  49.01 
 
 		 276 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355928  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4311  hypothetical protein  43.23 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4656  putative lipoprotein  42.79 
 
 		 287 aa  178  7e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0150127  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4898  hypothetical protein  40.61 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2199  hypothetical protein  41.74 
 
 		 288 aa  170  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.944581  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3606  hypothetical protein  40.87 
 
 		 288 aa  168  7e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3274  putative lipoprotein  40 
 
 		 287 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.896395  normal  0.0865941 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3038  hypothetical protein  35.22 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2852  hypothetical protein  33.2 
 
 		 254 aa  139  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2361  hypothetical protein  36.25 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1495  protein of unknown function DUF1486  29.95 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.692441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3812  putative lipoprotein  33.78 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4378  hypothetical protein  32.5 
 
 		 174 aa  88.6  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.032150000000001e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0951  hypothetical protein  40.32 
 
 		 174 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0282  pyruvate kinase  32.5 
 
 		 174 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788036  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5482  hypothetical protein  36.81 
 
 		 175 aa  85.9  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000608961 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5544  hypothetical protein  35.77 
 
 		 158 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1020  hypothetical protein  37.1 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4739  hypothetical protein  35.48 
 
 		 158 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3628  hypothetical protein  35.48 
 
 		 158 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0708  hypothetical protein  36.61 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0353  putative pyruvate kinase  34.4 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0238  protein of unknown function DUF1486  30.47 
 
 		 157 aa  68.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5599  hypothetical protein  30.47 
 
 		 151 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.0959248 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5094  hypothetical protein  33.83 
 
 		 130 aa  67.4  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2881  hypothetical protein  36.46 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4731  protein of unknown function DUF1486  35.48 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1397  protein of unknown function DUF1486  31.53 
 
 		 155 aa  64.7  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137743  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1476  hypothetical protein  33.61 
 
 		 127 aa  63.9  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4899  hypothetical protein  30.23 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.561738 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5449  hypothetical protein  30.23 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.744205 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2880  hypothetical protein  29.69 
 
 		 129 aa  62  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4608  hypothetical protein  30.33 
 
 		 157 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2163  hitchhiker  0.0000946441 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5237  hypothetical protein  30.33 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0069  hypothetical protein  29.51 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5622  hypothetical protein  30.33 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001568  possible membrane protein  30.95 
 
 		 125 aa  58.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1955  hypothetical protein  36.56 
 
 		 164 aa  55.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.252213  hitchhiker  0.00353589 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2420  hypothetical protein  26.83 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6507  protein of unknown function DUF1486  24.81 
 
 		 133 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199296  normal  0.262757 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10133  hypothetical protein  29.84 
 
 		 125 aa  50.4  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1288  hypothetical protein  33.68 
 
 		 170 aa  50.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5527  protein of unknown function DUF1486  28.12 
 
 		 135 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.848344  hitchhiker  0.000266853 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4696  hypothetical protein  29.27 
 
 		 122 aa  48.9  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0528913  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5064  hypothetical protein  25.49 
 
 		 131 aa  46.6  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5315  hypothetical protein  26.67 
 
 		 139 aa  45.4  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  24.22 
 
 		 142 aa  42.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>