More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8212 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8212  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 497 aa  993    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1455  ABC transporter related  60.61 
 
 		 548 aa  572  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.505833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4923  ABC transporter related  61.51 
 
 		 526 aa  564  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.729483  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0638  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  59.36 
 
 		 518 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0828  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  59.36 
 
 		 518 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1792  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  59.36 
 
 		 518 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1609  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  59.03 
 
 		 512 aa  556  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6919  ABC transporter related  57.52 
 
 		 510 aa  556  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0173531  normal  0.1656 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1153  ABC-type sugar transport system, ATPase component  59.07 
 
 		 518 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1076  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  58.95 
 
 		 518 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2369  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  58.75 
 
 		 518 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4301  ABC transporter related  56.34 
 
 		 508 aa  550  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2963  ABC sugar transporter, ATPase subunit  57.03 
 
 		 506 aa  545  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.945359  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4739  ABC transporter related  39.09 
 
 		 497 aa  323  5e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.383875  hitchhiker  0.00325994 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  39.33 
 
 		 522 aa  323  5e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  39.06 
 
 		 519 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  41.39 
 
 		 505 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  34.9 
 
 		 503 aa  319  7.999999999999999e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.02 
 
 		 516 aa  319  9e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  37.24 
 
 		 497 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  38.41 
 
 		 509 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  40.34 
 
 		 508 aa  315  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  33.13 
 
 		 499 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  36.52 
 
 		 495 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0881  ABC transporter related protein  39.16 
 
 		 499 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.873937  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  39.33 
 
 		 504 aa  312  1e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  38.21 
 
 		 516 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  39.64 
 
 		 500 aa  311  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1920  ABC transporter related  37.79 
 
 		 526 aa  311  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.528555  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2128  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.15 
 
 		 516 aa  310  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  32.49 
 
 		 496 aa  310  4e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  38.51 
 
 		 861 aa  310  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  40.66 
 
 		 499 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  36.86 
 
 		 510 aa  307  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4778  ABC transporter related  36.68 
 
 		 524 aa  307  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2238  ABC transporter related  38.57 
 
 		 504 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  38.1 
 
 		 511 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2211  ABC transporter-related protein  37.88 
 
 		 535 aa  306  6e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.139274 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4172  ABC transporter related  36.18 
 
 		 504 aa  306  6e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1915  ABC transporter related  35.39 
 
 		 502 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.483253  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2215  ABC transporter related  38.36 
 
 		 509 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0215537  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1048  ABC transporter related  34.68 
 
 		 506 aa  304  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4335  ABC transporter related  36.07 
 
 		 511 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.975481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  34.09 
 
 		 501 aa  304  3.0000000000000004e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1224  ABC transporter related  33.68 
 
 		 510 aa  303  6.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2119  ABC transporter related  36.06 
 
 		 504 aa  300  4e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.307687  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1987  ABC transporter related  35.39 
 
 		 499 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.479214  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2447  ABC transporter related protein  34.96 
 
 		 495 aa  298  1e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000548266  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1987  ABC transporter related  35.39 
 
 		 500 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.063033 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0983  ABC transporter related  37.42 
 
 		 501 aa  297  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1188  ABC transporter related  36.86 
 
 		 511 aa  296  5e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.909394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4208  ABC transporter related  36.58 
 
 		 525 aa  296  6e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.577364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4096  ABC transporter related  36.58 
 
 		 525 aa  296  6e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.38 
 
 		 494 aa  296  8e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4365  ABC transporter related  37.18 
 
 		 585 aa  296  8e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  0.0851247 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  36.59 
 
 		 514 aa  295  1e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2074  ABC transporter related  35.18 
 
 		 499 aa  295  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144534  hitchhiker  0.0000031172 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2370  ABC sugar transporter, ATPase subunit  37 
 
 		 518 aa  295  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  34.96 
 
 		 496 aa  295  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  34.08 
 
 		 494 aa  295  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2089  ABC transporter related protein  37.97 
 
 		 504 aa  293  4e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558184  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1721  ABC transporter related  37.69 
 
 		 507 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  38.69 
 
 		 498 aa  293  5e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0413  ABC transporter related  36.33 
 
 		 500 aa  293  5e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  35.17 
 
 		 494 aa  293  6e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.17 
 
 		 494 aa  293  6e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.17 
 
 		 494 aa  293  6e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5197  ABC transporter related  36.31 
 
 		 540 aa  292  8e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0887  ABC transporter related  38.16 
 
 		 497 aa  292  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1905  ABC transporter related  37.28 
 
 		 507 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308353  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4598  ABC transporter related  35.38 
 
 		 506 aa  292  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0392025 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04097  predicted sugar transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  35.92 
 
 		 500 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  32.38 
 
 		 504 aa  291  2e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0249  ABC transporter component  38.03 
 
 		 493 aa  291  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0268324  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3782  ABC transporter related  35.92 
 
 		 500 aa  291  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04061  hypothetical protein  35.92 
 
 		 500 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  35.42 
 
 		 509 aa  291  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2301  ABC transporter component  36.27 
 
 		 521 aa  290  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3534  ABC transporter related  36.53 
 
 		 523 aa  290  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.116696 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2058  ABC transporter related  34.6 
 
 		 499 aa  290  3e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.96 
 
 		 494 aa  290  4e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  34.96 
 
 		 496 aa  290  4e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0708  ABC transporter related  37.01 
 
 		 487 aa  290  4e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2251  ABC transporter-related protein  34.85 
 
 		 511 aa  290  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687423  hitchhiker  0.00000468234 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1792  ABC transporter related  35.52 
 
 		 494 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0113555  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.75 
 
 		 494 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2401  ABC transporter related protein  39.92 
 
 		 505 aa  289  9e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4341  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  35.21 
 
 		 544 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3851  ABC transporter related protein  36.55 
 
 		 521 aa  288  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5049  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  36.29 
 
 		 512 aa  289  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3765  ABC transporter related protein  35.71 
 
 		 500 aa  288  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.75 
 
 		 494 aa  288  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  35.61 
 
 		 512 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5517  ABC transporter related  36.53 
 
 		 516 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422457  normal  0.0683787 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  35.02 
 
 		 500 aa  287  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6482  ABC transporter related  36.6 
 
 		 504 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611957  normal  0.251961 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1398  ABC sugar transporter, ATPase subunit  36.69 
 
 		 539 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00538368  normal  0.128237 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  37.07 
 
 		 506 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4197  ABC transporter-related protein  38.83 
 
 		 521 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2148  ABC transporter related  34.54 
 
 		 499 aa  287  4e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.123365  normal  0.259949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>