213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8119 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8119  L-amino-acid oxidase  100 
 
 
520 aa  1053    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.922273  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3201  L-amino-acid oxidase  59.25 
 
 
535 aa  618  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00292344  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0085  L-amino-acid oxidase  53.63 
 
 
536 aa  504  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0068  amine oxidase  44.73 
 
 
557 aa  441  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  41.48 
 
 
527 aa  379  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6128  L-amino-acid oxidase  41.46 
 
 
524 aa  357  2.9999999999999997e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  38.14 
 
 
516 aa  356  5e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  37.95 
 
 
516 aa  355  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  37.92 
 
 
532 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2888  amine oxidase  38.67 
 
 
527 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511968  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3007  amine oxidase, flavin-containing protein  38.36 
 
 
527 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306413  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1780  L-amino acid oxidase  37.2 
 
 
537 aa  307  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0360809 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1131  amine oxidase  36.91 
 
 
533 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.451606  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1152  flavin monoamine oxidase related protein  36.48 
 
 
533 aa  303  6.000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1379  L-amino-acid oxidase  37.73 
 
 
528 aa  298  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115116  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0704  L-amino-acid oxidase  37.45 
 
 
519 aa  286  5e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1827  twin-arginine translocation pathway signal  37.45 
 
 
526 aa  284  3.0000000000000004e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.959499  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1328  L-amino-acid oxidase  39.17 
 
 
531 aa  282  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492445  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0148  amine oxidase  38.17 
 
 
531 aa  281  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1535  putative flavin monoamine oxidase-related protein  36.59 
 
 
530 aa  279  7e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136151  normal  0.956268 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0808  amine oxidase  35.14 
 
 
535 aa  279  9e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2438  amine oxidase, flavin-containing protein  34.67 
 
 
507 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806593  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3888  L-amino-acid oxidase  35.83 
 
 
541 aa  262  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898233  normal  0.195386 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1720  twin-arginine translocation pathway signal  33.52 
 
 
529 aa  251  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3896  amine oxidase  29.78 
 
 
638 aa  210  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.322927  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11801  hypothetical protein  27.82 
 
 
644 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2873  amine oxidase flavin-containing  28.64 
 
 
646 aa  167  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  27.98 
 
 
478 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  27.98 
 
 
478 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  31.13 
 
 
478 aa  149  9e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  30.36 
 
 
478 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  27.63 
 
 
478 aa  144  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  25.76 
 
 
478 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  25.66 
 
 
478 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  25.45 
 
 
478 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  25.35 
 
 
478 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  27.54 
 
 
492 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  25.05 
 
 
478 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  26.53 
 
 
491 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  25.32 
 
 
482 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  25.05 
 
 
478 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  23.91 
 
 
487 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  23.75 
 
 
490 aa  120  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  23.64 
 
 
487 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  22.93 
 
 
490 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  23.14 
 
 
482 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  23.14 
 
 
482 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  23.14 
 
 
482 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  23.14 
 
 
487 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  22.93 
 
 
485 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  22.73 
 
 
490 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  24.42 
 
 
523 aa  99.4  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  24.17 
 
 
564 aa  89.7  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  28.81 
 
 
418 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  24.75 
 
 
495 aa  75.5  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  24.73 
 
 
487 aa  75.1  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1778  amine oxidase  22.62 
 
 
572 aa  65.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  22.51 
 
 
573 aa  64.3  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  25.05 
 
 
503 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  24 
 
 
452 aa  58.5  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  30 
 
 
490 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  26.53 
 
 
449 aa  55.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  27.97 
 
 
474 aa  54.3  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2948  protoporphyrinogen oxidase  22.08 
 
 
463 aa  53.5  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000866681  hitchhiker  0.00000000115848 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  28.9 
 
 
578 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 
494 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2383  protoporphyrinogen oxidase  22.08 
 
 
463 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000492164  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0739  hypothetical protein  30.52 
 
 
570 aa  52.8  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  30.3 
 
 
495 aa  52  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  25.98 
 
 
496 aa  52  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2232  protoporphyrinogen oxidase  22.4 
 
 
466 aa  52  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142231  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  47.69 
 
 
469 aa  51.6  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0638  hypothetical protein  25.95 
 
 
426 aa  52  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000186691  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  56.1 
 
 
353 aa  51.6  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  28.28 
 
 
498 aa  51.2  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  27.58 
 
 
532 aa  50.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  49.18 
 
 
463 aa  50.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  24.64 
 
 
472 aa  50.8  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  25.58 
 
 
447 aa  50.8  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  20.18 
 
 
495 aa  50.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  48.21 
 
 
492 aa  50.4  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  69.44 
 
 
438 aa  50.4  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  32.43 
 
 
647 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  32.43 
 
 
647 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  58.54 
 
 
451 aa  50.1  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  25.64 
 
 
482 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  30 
 
 
493 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2837  amine oxidase  28.81 
 
 
448 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00868437  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  23.51 
 
 
441 aa  49.7  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  41.77 
 
 
433 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  25.81 
 
 
435 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7142  L-amino-acid oxidase  29.01 
 
 
624 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574825  normal  0.291351 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  34 
 
 
454 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  28.32 
 
 
494 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3587  amine oxidase  26.94 
 
 
461 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  24.93 
 
 
464 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0728  FAD dependent oxidoreductase  28.67 
 
 
570 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0404381  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  46.3 
 
 
431 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1068  amine oxidase  27.68 
 
 
415 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0264  glutamate synthase (NADH) small subunit  30.29 
 
 
478 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  0.0665114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>