More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3482 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3482  zinc ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 271 aa  495  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100167  hitchhiker  0.00906276 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2096  ABC-3 protein  55.19 
 
 		 270 aa  266  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  38 
 
 		 289 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  28.95 
 
 		 264 aa  99.8  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  31.6 
 
 		 277 aa  96.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  33.64 
 
 		 265 aa  94  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  30.49 
 
 		 261 aa  89.7  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01830  high-affinity zinc transporter membrane component  30.04 
 
 		 261 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395688  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1781  ABC-3 protein  30.04 
 
 		 261 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666084  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2089  high-affinity zinc transporter membrane component  30.04 
 
 		 261 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234028  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1327  high-affinity zinc transporter membrane component  30.04 
 
 		 261 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0274583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1952  high-affinity zinc transporter membrane component  30.04 
 
 		 261 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0398109  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01818  hypothetical protein  30.04 
 
 		 261 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0233663  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1773  high-affinity zinc transporter membrane component  30.04 
 
 		 261 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2049  ABC-3 protein  31.4 
 
 		 283 aa  87  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0502  ABC-3 protein  29.06 
 
 		 266 aa  87  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.24311  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  29.2 
 
 		 266 aa  86.7  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1231  high-affinity zinc transporter membrane component  29.15 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0480731  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2052  high-affinity zinc transporter membrane component  29.15 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00746645  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2107  high-affinity zinc transporter membrane component  29.15 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.378427 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2595  high-affinity zinc transporter membrane component  29.6 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1355  high-affinity zinc transporter membrane component  29.15 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  hitchhiker  0.00410518 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2047  high-affinity zinc transporter membrane component  29.15 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  29.25 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  30.17 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  30.92 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  32.13 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7036  ABC-3 protein  34.8 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  28.7 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0822  ABC-3 protein  29.3 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0799  ABC-3 protein  29.3 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  30.4 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  28.05 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0435  ABC-3 protein  27.31 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.149069  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  27.9 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  27.9 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3593  ABC-3 protein  34.23 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.234025 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3816  ABC-3 protein  30.65 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  30.52 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3180  ABC-3 protein  34.73 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.114587 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  31.44 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0857  ABC zinc/manganese transport system permease protein  35.25 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.405285  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1913  ABC-3 protein  31.33 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  26.5 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  29.06 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  28.68 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  28.68 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  28.68 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  28.68 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0062  hypothetical protein  32.22 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  28.68 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1444  hypothetical protein  28.26 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00097924  normal  0.0494808 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  26.77 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  30.23 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1104  ABC-3 protein  27.69 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.310242  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2432  ABC-3 protein  22.73 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000347054  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  29.06 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0633  cation ABC transporter, permease protein  29.07 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0463  ABC-3 protein  25.48 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.826396  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  28.68 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  28.68 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  31.87 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  28.79 
 
 		 277 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0156  zinc ABC transporter, permease protein  27.31 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.202162  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  27.86 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  27.94 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_574  cation ABC transporter, permease protein  28.63 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0575  hypothetical protein  30 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  28.68 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4498  ABC-3 protein  31.38 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  32.3 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  25.59 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  28.77 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2315  ABC-3 protein  29.84 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0235  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  27.02 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000286144  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1149  ABC-3 protein  29.5 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0606  ABC-3 protein  30.17 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5265  zinc ABC transporter, permease protein  30.96 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  27.13 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2775  high-affinity zinc transporter membrane component  26.05 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000664264  hitchhiker  0.0068137 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1647  ABC-3 protein  28.97 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1613  ABC-3 protein  28.97 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.478598  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1676  ABC 3 transport family protein  33.06 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397302  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  30.43 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1710  ABC-3 protein  31.8 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.793327  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  26.21 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  29.72 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2170  ABC-3 protein  31.56 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0264712  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0187  ABC-3 protein  29.07 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  24.11 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0596  ABC-3 protein  25 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2417  zinc ABC transporter permease  28.25 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0517  putative cation ABC transporter, permease protein  25.49 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.879269  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5111  ABC-3 protein  31.38 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.156764 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72590  permease of ABC zinc transporter ZnuB  30.96 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6302  permease of ABC zinc transporter ZnuB  30.96 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  24.22 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0362  cation ABC transporter, permease protein, putative  25.23 
 
 		 266 aa  67  0.0000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  23.48 
 
 		 272 aa  67  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0132  ABC-3 protein  31.38 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493035  normal  0.654734 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>