More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1261 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 321 aa  645    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  78.93 
 
 		 319 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  75 
 
 		 318 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  67.09 
 
 		 320 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  64.17 
 
 		 316 aa  403  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27520  UDP-galactose 4-epimerase  68.04 
 
 		 321 aa  402  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  63.72 
 
 		 327 aa  386  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  62.97 
 
 		 320 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  61.73 
 
 		 323 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  59.94 
 
 		 329 aa  348  6e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1769  UDP-glucose 4-epimerase  57.91 
 
 		 320 aa  345  5e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818465  normal  0.0921457 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  58.31 
 
 		 328 aa  344  1e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0893  UDP-glucose 4-epimerase  59.37 
 
 		 321 aa  336  2.9999999999999997e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0932116 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  54.86 
 
 		 328 aa  334  1e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  54.72 
 
 		 328 aa  334  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4862  UDP-glucose 4-epimerase  56.43 
 
 		 322 aa  326  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.997922 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  52.31 
 
 		 328 aa  326  4.0000000000000003e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  52.31 
 
 		 328 aa  325  7e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0739  UDP-glucose 4-epimerase  58.77 
 
 		 327 aa  324  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209358  hitchhiker  0.00614298 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  54.09 
 
 		 354 aa  324  1e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  54.06 
 
 		 324 aa  323  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0795  UDP-glucose 4-epimerase  58.64 
 
 		 327 aa  322  6e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  52.5 
 
 		 328 aa  321  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  51.38 
 
 		 330 aa  316  3e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  52.5 
 
 		 328 aa  315  9.999999999999999e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  50.94 
 
 		 332 aa  311  7.999999999999999e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  53.68 
 
 		 329 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 		 327 aa  306  3e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 		 330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 		 330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 		 330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 		 330 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 		 330 aa  305  7e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 		 330 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 		 330 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 330 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  50.62 
 
 		 332 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  50.78 
 
 		 323 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 		 329 aa  303  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  49.22 
 
 		 333 aa  302  6.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  50.78 
 
 		 332 aa  300  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  47.85 
 
 		 327 aa  300  3e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  52.13 
 
 		 331 aa  299  5e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  52.02 
 
 		 327 aa  298  8e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  49.39 
 
 		 326 aa  298  8e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  49.38 
 
 		 331 aa  298  9e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  50.62 
 
 		 328 aa  298  9e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  50.46 
 
 		 333 aa  298  1e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  47.35 
 
 		 337 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  47.04 
 
 		 337 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  47.08 
 
 		 329 aa  294  1e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  48.59 
 
 		 324 aa  293  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1771  UDP-glucose 4-epimerase  48.01 
 
 		 328 aa  294  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333176  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 		 329 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 		 330 aa  293  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 		 331 aa  292  4e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  46.79 
 
 		 330 aa  290  3e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  45.14 
 
 		 327 aa  288  1e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  46.95 
 
 		 331 aa  287  2e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  47.55 
 
 		 334 aa  287  2e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 		 332 aa  286  4e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  44.83 
 
 		 328 aa  285  8e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  47.24 
 
 		 330 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  48.12 
 
 		 327 aa  282  6.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  46.54 
 
 		 328 aa  280  2e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  46.63 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  45.09 
 
 		 332 aa  280  2e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  47.02 
 
 		 333 aa  280  3e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  48.47 
 
 		 328 aa  277  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  45.09 
 
 		 330 aa  278  1e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  45.09 
 
 		 330 aa  278  1e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  47.77 
 
 		 324 aa  275  6e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  46.44 
 
 		 332 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  46.44 
 
 		 332 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  45.17 
 
 		 325 aa  271  1e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  46.88 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  47.19 
 
 		 330 aa  270  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 356 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  46.56 
 
 		 328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  48.59 
 
 		 351 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  46.91 
 
 		 329 aa  269  4e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  47.98 
 
 		 329 aa  269  5e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  49.09 
 
 		 330 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  43.75 
 
 		 326 aa  268  1e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  43.89 
 
 		 326 aa  267  2e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  47.35 
 
 		 332 aa  267  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  46.54 
 
 		 334 aa  266  4e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  48.48 
 
 		 330 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  48.29 
 
 		 337 aa  263  4e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  45.77 
 
 		 327 aa  262  4.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  46.88 
 
 		 320 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  49.53 
 
 		 327 aa  261  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  42.99 
 
 		 321 aa  261  1e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  48.74 
 
 		 329 aa  261  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  48.28 
 
 		 329 aa  259  6e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  47.02 
 
 		 328 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  45.06 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  47.98 
 
 		 330 aa  256  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  49.38 
 
 		 321 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  46.06 
 
 		 327 aa  255  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>