More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0375 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  75.18 
 
 
557 aa  795    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  100 
 
 
569 aa  1139    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  45.92 
 
 
575 aa  333  7.000000000000001e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  46.15 
 
 
564 aa  321  3e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27990  glycosyltransferase  42.66 
 
 
603 aa  278  3e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08820  glycosyltransferase  40.67 
 
 
1188 aa  263  4.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.338698  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08970  glycosyltransferase  43.56 
 
 
601 aa  246  6.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26850  glycosyltransferase  40.62 
 
 
573 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  36.88 
 
 
405 aa  209  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  33.5 
 
 
406 aa  200  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  33 
 
 
416 aa  191  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  35.18 
 
 
411 aa  191  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  32.59 
 
 
405 aa  191  4e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  33.25 
 
 
405 aa  189  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  31.05 
 
 
723 aa  185  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  33.67 
 
 
405 aa  181  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  32.85 
 
 
406 aa  178  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  34.64 
 
 
401 aa  170  5e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3178  glycosyl transferase, group 1  31.81 
 
 
402 aa  144  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4821  glycosyl transferase, group 1  32.33 
 
 
401 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.726751  normal  0.695392 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0635  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 
403 aa  130  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 
768 aa  121  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4282  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 
396 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  34.44 
 
 
517 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1851  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.06 
 
 
400 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  28.37 
 
 
416 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3878  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 
535 aa  107  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
390 aa  107  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
390 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  33.94 
 
 
415 aa  105  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 
402 aa  105  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
374 aa  101  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  28.13 
 
 
434 aa  102  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  28.53 
 
 
414 aa  101  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
414 aa  101  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  27.1 
 
 
409 aa  100  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  27.53 
 
 
394 aa  99.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 
409 aa  99  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 
412 aa  99  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  31.71 
 
 
420 aa  97.4  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 
386 aa  96.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 
417 aa  95.5  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 
426 aa  95.9  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 
394 aa  95.1  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1098  glycosyl transferase, group 1  29.1 
 
 
399 aa  95.1  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000174452 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 
393 aa  94.7  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 
360 aa  93.6  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5018  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.73 
 
 
377 aa  92.8  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.437821  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 
392 aa  92.4  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  25.61 
 
 
371 aa  92.4  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
379 aa  92  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  27.2 
 
 
404 aa  92  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 
399 aa  90.9  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 
387 aa  90.5  7e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 
394 aa  90.5  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3833  glycosyl transferase, group 1  24.55 
 
 
397 aa  90.1  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  33.77 
 
 
411 aa  90.1  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 
407 aa  89.7  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
390 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 
394 aa  89  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  30.89 
 
 
433 aa  89.4  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 
390 aa  89  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  23.16 
 
 
392 aa  88.2  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 
379 aa  87.8  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  22.22 
 
 
408 aa  87.8  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0206  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 
399 aa  87.4  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.2 
 
 
419 aa  87.4  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  35.94 
 
 
350 aa  87.4  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
904 aa  87.4  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  27.36 
 
 
401 aa  87.4  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  27.02 
 
 
383 aa  87  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 
374 aa  87  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2473  glycosyl transferase group 1  34.57 
 
 
403 aa  86.7  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 
430 aa  86.3  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
364 aa  86.3  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 
355 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  22.34 
 
 
365 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  32.44 
 
 
441 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  33.2 
 
 
389 aa  84.7  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 
388 aa  85.1  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  24.58 
 
 
402 aa  84.3  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 
422 aa  84.3  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 
415 aa  84.3  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0297  glycosyl transferase group 1  30.31 
 
 
416 aa  84  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 
405 aa  84  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 
404 aa  84  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0624  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.13 
 
 
383 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  21.08 
 
 
372 aa  83.6  0.000000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  27.6 
 
 
411 aa  83.6  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  30.53 
 
 
382 aa  82.8  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0411  glycosyl transferase group 1  23.17 
 
 
370 aa  83.2  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.482672  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3120  glycosyl transferase, group 1  33.87 
 
 
366 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0017817  unclonable  0.0000176244 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
364 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
405 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
378 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  32.57 
 
 
467 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 
418 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 
405 aa  82  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  22.16 
 
 
745 aa  82  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 
377 aa  81.6  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>