35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3944 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3944  transposon Tn7 transposition protein TnsD  100 
 
 		 505 aa  1047    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3931  transposition protein  36.57 
 
 		 503 aa  301  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3825  transposition protein  35.74 
 
 		 514 aa  301  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.365927  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4357  transposition protein  33.93 
 
 		 500 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2922  hypothetical protein  30.14 
 
 		 515 aa  241  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0143  hypothetical protein  27.46 
 
 		 533 aa  173  6.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3495  Tn7-like transposition protein D  32.58 
 
 		 636 aa  171  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.178202  normal  0.0885981 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0185  Tn7-like transposition protein D  30.58 
 
 		 582 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156769  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3196  Tn5468, transposition protein D  33.67 
 
 		 609 aa  150  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.480542  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2800  Tn7-like transposition protein D  33.67 
 
 		 609 aa  150  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1204  Tn5468, transposition protein D  34.12 
 
 		 609 aa  147  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1114  Tn7-like transposition protein D  28.04 
 
 		 628 aa  145  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1871  Tn7-like transposition protein D  27.4 
 
 		 625 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0248  Tn7-like transposition protein D  29.13 
 
 		 630 aa  113  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.194632 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0177  Tn7-like transposition protein D  29.64 
 
 		 616 aa  111  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170656  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3953  Tn7-like transposition protein D  34.72 
 
 		 597 aa  94.4  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5192  hypothetical protein  24.16 
 
 		 489 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0178  Tn7-like transposition protein D  24.75 
 
 		 610 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.909766  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2324  Tn7-like transposition protein D  32.61 
 
 		 295 aa  90.5  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.61974e-16 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6940  hypothetical protein  24.81 
 
 		 591 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3950  Tn7-like transposition protein D  30.43 
 
 		 280 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3773  Tn7-like transposition protein  25.61 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6969  hypothetical protein  23.97 
 
 		 617 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3489  Tn7-like transposition protein D  33.33 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155842  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3774  putative transposon transposition protein  24.9 
 
 		 571 aa  71.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5722  hypothetical protein  27.06 
 
 		 569 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5566  transposition protein, TnsD-related protein  29.56 
 
 		 563 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5407  transposition protein, TnsD-related protein  25.32 
 
 		 532 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3105  transposon Tn7 transposition protein D  23.76 
 
 		 535 aa  52.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6968  hypothetical protein  26.67 
 
 		 338 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5721  transposition protein, TnsD-like protein  24.54 
 
 		 561 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90008  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4973  hypothetical protein  21.95 
 
 		 462 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1057  hypothetical protein  27.93 
 
 		 523 aa  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.047918  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2207  hypothetical protein  26.54 
 
 		 579 aa  47.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4321  hypothetical protein  26.36 
 
 		 477 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>