More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3233 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C3967  biotin sulfoxide reductase  50 
 
 
777 aa  776    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01000  trimethylamine N-oxide (TMAO) reductase I, catalytic subunit  45.98 
 
 
848 aa  718    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2165  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  51.74 
 
 
815 aa  837    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01843  trimethylamine N-oxide reductase system III, catalytic subunit  51.87 
 
 
809 aa  833    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03401  biotin sulfoxide reductase  49.93 
 
 
759 aa  746    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0161  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  49.03 
 
 
777 aa  753    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1768  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  51.87 
 
 
809 aa  834    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.876265  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4105  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  45.53 
 
 
850 aa  720    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1760  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  51.87 
 
 
809 aa  833    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2645  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  45.98 
 
 
848 aa  718    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3858  biotin sulfoxide reductase  50.13 
 
 
777 aa  776    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0394  biotin sulfoxide reductase (BDS reductase) (bsoreductase)  46.17 
 
 
839 aa  750    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1108  trimethylamine-N-oxide reductase  45.74 
 
 
848 aa  715    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1232  trimethylamine-N-oxide reductase  40.88 
 
 
829 aa  642    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3360  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  41.21 
 
 
830 aa  662    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1396  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.4 
 
 
835 aa  752    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0361  molybdopterin oxidoreductase  44.68 
 
 
841 aa  711    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3352  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  40.9 
 
 
829 aa  645    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3048  DMSO/TMAO-reductase  50.78 
 
 
822 aa  867    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180176  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1287  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  55.53 
 
 
823 aa  915    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3871  biotin sulfoxide reductase  48.9 
 
 
777 aa  754    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4050  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  45.53 
 
 
850 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3976  biotin sulfoxide reductase  48.84 
 
 
777 aa  751    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1395  radical SAM domain-containing protein  46.77 
 
 
855 aa  783    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4926  biotin sulfoxide reductase  48.9 
 
 
777 aa  753    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0165  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  48.9 
 
 
777 aa  754    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0391  biotin sulfoxide reductase (BDS reductase) (bsoreductase)  47.04 
 
 
837 aa  762    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186908  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0658  twin-arginine translocation pathway signal  47.35 
 
 
817 aa  723    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1751  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  53.13 
 
 
824 aa  893    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1877  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  45.98 
 
 
820 aa  747    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1119  hypothetical protein  42.31 
 
 
813 aa  639    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0685924  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4033  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  45.57 
 
 
850 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1145  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  51.26 
 
 
825 aa  905    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259974  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1154  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  41.02 
 
 
829 aa  645    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3839  biotin sulfoxide reductase  50 
 
 
777 aa  776    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2044  trimethylamine-n-oxide reductase 1 (tmaoreductase 1) (trimethylamine oxidase 1)  41.72 
 
 
816 aa  655    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4212  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  45.82 
 
 
850 aa  723    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01007  hypothetical protein  45.98 
 
 
848 aa  718    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0806  trimethylamine-N-oxide reductase 2, biotin sulfoxide reductase  55.78 
 
 
801 aa  902    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1673  trimethylamine-N-oxide reductase precursor  40.89 
 
 
822 aa  652    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1051  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  41 
 
 
829 aa  644    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2598  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  45.98 
 
 
848 aa  718    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3343  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  41.69 
 
 
830 aa  650    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.922902  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1116  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  41 
 
 
829 aa  644    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.310041  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1994  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  41.69 
 
 
830 aa  660    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0339743  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3233  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  100 
 
 
826 aa  1724    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000820415 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3526  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  40.5 
 
 
830 aa  647    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170885  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1114  trimethylamine-N-oxide reductase  45.86 
 
 
848 aa  717    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1055  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  40.88 
 
 
829 aa  642    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1459  trimethylamine N-oxide reductase, catalytic subunit  46.65 
 
 
839 aa  781    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.278851  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2608  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  51.75 
 
 
809 aa  832    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.022137 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2731  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  41.82 
 
 
838 aa  636    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0987  trimethylamine-N-oxide reductase  42.39 
 
 
829 aa  669    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0772  trimethylamine-N-oxide reductase precursor  40.05 
 
 
820 aa  642    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4154  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  45.7 
 
 
850 aa  722    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.208646  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1233  trimethylamine-N-oxide reductase  45.86 
 
 
848 aa  715    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2127  trimethylamine-N-oxide reductase  45.98 
 
 
848 aa  719    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.600325  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0291  biotin sulfoxide reductase  46.04 
 
 
838 aa  780    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0738  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  45.96 
 
 
822 aa  790    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0392  trimethylamine-n-oxide reductase 2 (tmaoreductase 2) (trimethylamine oxidase 2)  49.02 
 
 
856 aa  811    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03352  hypothetical protein  49.93 
 
 
759 aa  746    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3775  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  50.66 
 
 
822 aa  865    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0227198  normal  0.692951 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2103  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  51.5 
 
 
815 aa  833    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4045  biotin sulfoxide reductase  48.65 
 
 
777 aa  753    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2798  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  41.21 
 
 
828 aa  654    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0178103 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3752  biotin sulfoxide reductase  48.9 
 
 
777 aa  754    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4273  hypothetical protein  51.97 
 
 
827 aa  883    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0173  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  49.94 
 
 
775 aa  771    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3923  biotin sulfoxide reductase  49.87 
 
 
777 aa  774    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.937494  normal  0.611984 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4218  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  44.7 
 
 
837 aa  715    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.216901  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1538  biotin sulfoxide reductase  51.03 
 
 
815 aa  825    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1514  trimethylamine-n-oxide reductase 2 (tmaoreductase 2) (trimethylamine oxidase 2)  49.45 
 
 
828 aa  818    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0894241  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06846  hypothetical protein  51.15 
 
 
815 aa  839    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1967  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  51.62 
 
 
815 aa  836    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0214  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  42.65 
 
 
840 aa  676    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4027  biotin sulfoxide reductase  49.87 
 
 
777 aa  775    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633224  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3213  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  41.02 
 
 
829 aa  646    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000871  biotin sulfoxide reductase  51.75 
 
 
815 aa  842    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1314  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  51.75 
 
 
809 aa  833    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.887927 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1833  trimethylamine-N-oxide reductase  40.17 
 
 
830 aa  634  1e-180  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003825  trimethylamine-N-oxide reductase  40.29 
 
 
820 aa  630  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1296  trimethylamine-N-oxide reductase  39.93 
 
 
820 aa  631  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0661  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  43.32 
 
 
792 aa  628  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0848  molybdopterin oxidoreductase domain-containing protein  41.07 
 
 
816 aa  625  1e-178  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01857  hypothetical protein  40.05 
 
 
820 aa  622  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1942  molybdopterin oxidoreductase  43.92 
 
 
758 aa  619  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.838902 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1389  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  44.18 
 
 
772 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0600897  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3891  molybdopterin oxidoreductase  41.9 
 
 
770 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3605  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  40.52 
 
 
756 aa  609  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0430  biotin sulfoxide reductase  40.29 
 
 
799 aa  611  1e-173  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.559575  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0406  radical SAM domain-containing protein  39.06 
 
 
817 aa  599  1e-170  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3958  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  43.32 
 
 
798 aa  602  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0664262  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0340  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  41.84 
 
 
776 aa  598  1e-169  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.422952  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2438  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  43.25 
 
 
775 aa  589  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156692  normal  0.122475 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2539  molybdopterin oxidoreductase  39.71 
 
 
777 aa  585  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21940  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  41.28 
 
 
756 aa  579  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2166  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  42.07 
 
 
762 aa  579  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2212  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  42.07 
 
 
762 aa  579  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.752976  normal  0.0546044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2155  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  41.81 
 
 
762 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353685 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11470  molybdopterin oxidoreductase  41.86 
 
 
766 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000112103  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>