More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1919 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1919  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 301 aa  610  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.659618  hitchhiker  0.00000571338 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2150  extracellular solute-binding protein family 3  74.67 
 
 		 311 aa  454  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2490  extracellular solute-binding protein family 3  75.99 
 
 		 311 aa  442  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0525  extracellular solute-binding protein family 3  69.79 
 
 		 305 aa  415  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2151  extracellular solute-binding protein family 3  70.53 
 
 		 326 aa  407  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2491  extracellular solute-binding protein family 3  69.47 
 
 		 327 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0524  extracellular solute-binding protein family 3  67.21 
 
 		 315 aa  398  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0407  extracellular solute-binding protein family 3  64.59 
 
 		 315 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2085  extracellular solute-binding protein  63.32 
 
 		 295 aa  367  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2089  extracellular solute-binding protein  59.03 
 
 		 310 aa  358  4e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2412  extracellular solute-binding protein  63.83 
 
 		 308 aa  352  5e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3008  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  56.81 
 
 		 309 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.324637  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2889  extracellular solute-binding protein  56.67 
 
 		 309 aa  328  8e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00285086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5206  ABC transporter substrate binding protein  52.5 
 
 		 311 aa  281  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.587678  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5565  extracellular solute-binding protein family 3  47.87 
 
 		 314 aa  279  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5205  ABC transporter substrate binding protein  51.29 
 
 		 312 aa  279  4e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0107  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  47.47 
 
 		 313 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3684  extracellular solute-binding protein family 3  50.18 
 
 		 326 aa  271  7e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5512  extracellular solute-binding protein  47.99 
 
 		 313 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.913196  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5876  extracellular solute-binding protein  47.99 
 
 		 313 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.266759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2504  ABC transporter substrate-binding protein  46.73 
 
 		 313 aa  268  7e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3901  extracellular solute-binding protein  54.44 
 
 		 326 aa  268  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4349  extracellular solute-binding protein  48.57 
 
 		 309 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17246  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6385  extracellular solute-binding protein  47.32 
 
 		 313 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5877  extracellular solute-binding protein  47.31 
 
 		 317 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.280922  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4350  extracellular solute-binding protein  48.14 
 
 		 314 aa  265  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.771986  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2269  cystine-binding periplasmic protein FliY  47.86 
 
 		 328 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0485236  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1691  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  47.86 
 
 		 328 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.401745  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0740  cystine-binding periplasmic protein FliY  47.86 
 
 		 328 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0560  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  47.86 
 
 		 328 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2408  cystine-binding periplasmic protein FliY  47.86 
 
 		 328 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1680  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  47.86 
 
 		 328 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1888  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  47.86 
 
 		 328 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0397  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  49.49 
 
 		 314 aa  262  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4428  extracellular solute-binding protein  46.43 
 
 		 317 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4320  extracellular solute-binding protein  46.43 
 
 		 317 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3860  extracellular solute-binding protein  46.43 
 
 		 317 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1701  extracellular solute-binding protein family 3  48.36 
 
 		 324 aa  260  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3938  extracellular solute-binding protein  46.07 
 
 		 317 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138287  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5566  extracellular solute-binding protein family 3  47.37 
 
 		 311 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5873  extracellular solute-binding protein  46.58 
 
 		 310 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0885292 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1530  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  48.03 
 
 		 311 aa  258  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1534  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  46.59 
 
 		 315 aa  258  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.12119 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3934  twin-arginine translocation pathway signal  46.23 
 
 		 310 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0254446  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4432  extracellular solute-binding protein  46.23 
 
 		 310 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.299599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4191  extracellular solute-binding protein  46.24 
 
 		 347 aa  257  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4187  extracellular solute-binding protein  50.4 
 
 		 312 aa  256  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1686  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  48.57 
 
 		 311 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0603097  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2401  amino acid ABC transporter periplasmic protein  48.57 
 
 		 311 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22921  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1894  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  48.57 
 
 		 397 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3864  extracellular solute-binding protein  47.23 
 
 		 313 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384517  normal  0.625543 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1687  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  48.57 
 
 		 311 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129998  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0566  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  48.57 
 
 		 311 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2264  cystine-binding periplasmic protein FliY  48.57 
 
 		 311 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0734  cystine-binding periplasmic protein FliY  48.57 
 
 		 406 aa  252  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4324  extracellular solute-binding protein  46.86 
 
 		 313 aa  252  6e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0388  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.67 
 
 		 313 aa  248  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  0.56756 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0926  extracellular solute-binding protein family 3  50.38 
 
 		 341 aa  239  4e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00101537  normal  0.0381381 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34650  amino acid-binding protein  47.1 
 
 		 335 aa  231  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2931  extracellular solute-binding protein  45.52 
 
 		 332 aa  218  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3708  extracellular solute-binding protein family 3  42.14 
 
 		 354 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4344  extracellular solute-binding protein family 3  41.43 
 
 		 339 aa  196  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2050  extracellular solute-binding protein family 3  40.21 
 
 		 331 aa  188  8e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02250  amino acid-binding protein  37.14 
 
 		 348 aa  181  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.856046  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  42.34 
 
 		 734 aa  172  6.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3765  extracellular solute-binding protein family 3  36.09 
 
 		 337 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1986  extracellular solute-binding protein family 3  31.92 
 
 		 312 aa  109  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3769  extracellular solute-binding protein family 3  33.8 
 
 		 323 aa  105  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2363  extracellular solute-binding protein  30.97 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1068  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 302 aa  95.5  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0937  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  30.35 
 
 		 313 aa  94  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3383  extracellular solute-binding protein family 3  27.97 
 
 		 320 aa  92.4  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404441  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4595  amino acid ABC transporter  28.86 
 
 		 317 aa  87  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2002  extracellular solute-binding protein family 3  28.7 
 
 		 302 aa  86.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0936  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  27.59 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.019687  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1775  extracellular solute-binding protein family 3  27.65 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848081  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7701  extracellular solute-binding protein family 3  29.36 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal  0.675112 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  31.03 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  26.15 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4320  extracellular solute-binding protein family 3  27.64 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3515  extracellular solute-binding protein family 3  26.69 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.821579  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  27.06 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5578  extracellular solute-binding protein family 3  26.53 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  25.57 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  25.57 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  29.69 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0296  extracellular solute-binding protein  33.58 
 
 		 263 aa  72  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  32.53 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  32.16 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  31.93 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  31.93 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  31.93 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  31.5 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  27.85 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  27.85 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  27.85 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  32.29 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  31.58 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  31.29 
 
 		 266 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  31.29 
 
 		 266 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>