68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2271 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2271  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  785    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.223417  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4593  hypothetical protein  68.03 
 
 		 394 aa  544  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0348  major facilitator superfamily MFS_1  67.59 
 
 		 393 aa  535  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4675  hypothetical protein  67.59 
 
 		 393 aa  536  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.398829 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3740  hypothetical protein  67.85 
 
 		 393 aa  537  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3646  hypothetical protein  67.85 
 
 		 393 aa  536  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.865659  hitchhiker  0.000149858 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3833  hypothetical protein  67.59 
 
 		 393 aa  535  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03215  hypothetical protein  67.59 
 
 		 393 aa  533  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3841  hypothetical protein  67.34 
 
 		 393 aa  531  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3670  hypothetical protein  67.85 
 
 		 393 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.279689  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3670  hypothetical protein  67.59 
 
 		 393 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3778  hypothetical protein  67.59 
 
 		 393 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.974681 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3743  hypothetical protein  67.85 
 
 		 393 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0396479 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0348  hypothetical protein  67.59 
 
 		 393 aa  534  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3560  hypothetical protein  67.59 
 
 		 393 aa  534  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03167  hypothetical protein  67.59 
 
 		 393 aa  533  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0238  hypothetical protein  66.5 
 
 		 394 aa  529  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3954  hypothetical protein  66.5 
 
 		 394 aa  529  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3791  hypothetical protein  66.67 
 
 		 394 aa  528  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3713  hypothetical protein  66.31 
 
 		 380 aa  508  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0509  hypothetical protein  62.53 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0551  hypothetical protein  61.27 
 
 		 398 aa  493  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2681  hypothetical protein  23.45 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.433082  hitchhiker  0.00146512 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2502  hypothetical protein  24.16 
 
 		 394 aa  137  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.156303  hitchhiker  0.000706101 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3272  hypothetical protein  25.64 
 
 		 392 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.388567  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1839  hypothetical protein  25.96 
 
 		 391 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157174  normal  0.968592 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09450  major facilitator superfamily MFS_1  24.69 
 
 		 422 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00253075  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3785  hypothetical protein  25.07 
 
 		 390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1658  hypothetical protein  25.27 
 
 		 384 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0600351  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3423  hypothetical protein  23.8 
 
 		 392 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2718  hypothetical protein  25 
 
 		 384 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  24.21 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  23.68 
 
 		 405 aa  57  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1983  major facilitator family transporter  25 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000795412 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1812  transporter, major facilitator family  25 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1456  transporter major facilitator family  25 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0765913  normal  0.139077 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1491  major facilitator family transporter  25 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0164303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1472  major facilitator family protein  25 
 
 		 411 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286209 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 415 aa  53.1  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  19.17 
 
 		 425 aa  52.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  22.64 
 
 		 406 aa  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  24.91 
 
 		 428 aa  51.6  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  23.64 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  24.83 
 
 		 425 aa  50.8  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  25.28 
 
 		 389 aa  50.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  24.49 
 
 		 428 aa  49.7  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  23.93 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  23.93 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 420 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  23.15 
 
 		 424 aa  47.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2189  putative transport system permease protein  20.41 
 
 		 408 aa  47.8  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  19.83 
 
 		 395 aa  47  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4661  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 468 aa  46.6  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  21.2 
 
 		 393 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  19.15 
 
 		 407 aa  47  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000523123  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  21.2 
 
 		 393 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  26.37 
 
 		 391 aa  46.6  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  26.37 
 
 		 388 aa  46.6  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  23.81 
 
 		 388 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  21.57 
 
 		 402 aa  45.1  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  25.4 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1384  major facilitator superfamily MFS_1  23.22 
 
 		 422 aa  43.5  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  21.4 
 
 		 395 aa  43.5  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2184  permease  21.19 
 
 		 422 aa  43.1  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.23848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 406 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  23.76 
 
 		 406 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  23.76 
 
 		 406 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 406 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  0.0000000000855622 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>