125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1098 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  62.4 
 
 
507 aa  659    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  62.99 
 
 
507 aa  664    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  66.54 
 
 
508 aa  713    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  75.49 
 
 
508 aa  801    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  100 
 
 
508 aa  1060    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  61.02 
 
 
507 aa  648    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  53.27 
 
 
507 aa  535  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  56.7 
 
 
507 aa  537  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  51.59 
 
 
511 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  51.59 
 
 
510 aa  508  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  50.4 
 
 
515 aa  502  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  47.75 
 
 
537 aa  490  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  47.95 
 
 
513 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  47.75 
 
 
513 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  47.95 
 
 
513 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  43.91 
 
 
524 aa  428  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  42.05 
 
 
517 aa  426  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  42.26 
 
 
526 aa  422  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  42.44 
 
 
508 aa  422  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  41.23 
 
 
522 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  41.38 
 
 
524 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  42.55 
 
 
514 aa  397  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  40.97 
 
 
518 aa  392  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  41.92 
 
 
524 aa  395  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  40.86 
 
 
505 aa  392  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  41 
 
 
524 aa  388  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  39.84 
 
 
514 aa  388  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3276  tryptophan halogenase  41.07 
 
 
520 aa  385  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698237  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  41.99 
 
 
532 aa  385  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  39 
 
 
537 aa  381  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  40.95 
 
 
527 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1964  tryptophan halogenase  40.45 
 
 
531 aa  372  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  38.19 
 
 
513 aa  366  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1105  ATPase  39.12 
 
 
517 aa  366  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  40.35 
 
 
522 aa  368  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  37.74 
 
 
525 aa  363  4e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  37.21 
 
 
528 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1124  tryptophan halogenase  36.9 
 
 
543 aa  355  2e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1179  tryptophan halogenase  37.08 
 
 
543 aa  354  2e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1398  hypothetical protein  39 
 
 
520 aa  352  1e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000535244 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1212  tryptophan halogenase  36.9 
 
 
543 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3178  tryptophan halogenase  36.53 
 
 
543 aa  346  7e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0464622 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  34.35 
 
 
538 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  34.35 
 
 
538 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  34.23 
 
 
538 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  35.39 
 
 
529 aa  263  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  34.03 
 
 
538 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  33.53 
 
 
508 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  35.16 
 
 
529 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  33.79 
 
 
508 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  34.42 
 
 
537 aa  259  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  35.12 
 
 
505 aa  259  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  33.97 
 
 
538 aa  259  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  33.97 
 
 
538 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  35.95 
 
 
492 aa  256  9e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  35.39 
 
 
494 aa  253  6e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  36.98 
 
 
507 aa  248  3e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  35.08 
 
 
498 aa  246  6e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  35.77 
 
 
499 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  36.19 
 
 
504 aa  246  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  39.58 
 
 
499 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  34.9 
 
 
502 aa  243  5e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  39.12 
 
 
499 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  33.66 
 
 
503 aa  243  7e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  37.82 
 
 
501 aa  241  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  34.23 
 
 
511 aa  238  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  33.72 
 
 
510 aa  238  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  33.66 
 
 
496 aa  237  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  37.64 
 
 
507 aa  237  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  35.38 
 
 
502 aa  237  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  34.52 
 
 
497 aa  237  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  34.06 
 
 
498 aa  236  7e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  34.71 
 
 
496 aa  236  8e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  36.65 
 
 
501 aa  236  8e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  36.87 
 
 
501 aa  236  8e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  35.19 
 
 
515 aa  235  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  37.13 
 
 
740 aa  234  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  34.77 
 
 
512 aa  234  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  33.14 
 
 
506 aa  233  6e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  33.78 
 
 
506 aa  233  6e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  32.28 
 
 
504 aa  233  7.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  33.07 
 
 
523 aa  233  8.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  33.26 
 
 
501 aa  232  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  32.68 
 
 
500 aa  231  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  33.98 
 
 
497 aa  229  9e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  32.41 
 
 
503 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  33.54 
 
 
505 aa  228  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  32.48 
 
 
503 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  32.28 
 
 
503 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  32.28 
 
 
503 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  32.75 
 
 
500 aa  226  6e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  33.1 
 
 
502 aa  226  7e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  32.41 
 
 
517 aa  226  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  31.92 
 
 
509 aa  225  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  31.5 
 
 
506 aa  223  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  31.37 
 
 
505 aa  223  7e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  31.96 
 
 
495 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  34.72 
 
 
501 aa  220  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  30.99 
 
 
496 aa  220  6e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  32.75 
 
 
505 aa  218  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>