More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5026 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5026  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 
482 aa  946    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.998204  normal  0.25897 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.66 
 
 
416 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  30.57 
 
 
831 aa  155  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  42.68 
 
 
599 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  27.82 
 
 
684 aa  145  2e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  31.04 
 
 
557 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0049  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.79 
 
 
503 aa  139  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.492583  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  30.04 
 
 
1402 aa  136  7.000000000000001e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  28.41 
 
 
685 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 
1032 aa  129  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  28.86 
 
 
490 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  28.64 
 
 
490 aa  125  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  30.75 
 
 
489 aa  124  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0025  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 
842 aa  119  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000698246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1521  TPR repeat-domain-containing protein SEL1 subfamily-like protein  31.66 
 
 
471 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479688  hitchhiker  0.000333519 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  30.72 
 
 
393 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  25.47 
 
 
961 aa  107  3e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1505  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.5 
 
 
261 aa  106  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.191468  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  24.38 
 
 
1877 aa  105  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  25.74 
 
 
789 aa  105  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  27.36 
 
 
448 aa  104  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.51 
 
 
528 aa  104  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0338  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.91 
 
 
278 aa  101  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0342  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 
298 aa  98.2  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  26.35 
 
 
1493 aa  97.4  5e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  29.98 
 
 
464 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0823  Sel1 domain-containing protein repeat-containing protein  32.03 
 
 
470 aa  96.3  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.174459  normal  0.603656 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0344  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 
298 aa  95.5  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  25.7 
 
 
1037 aa  95.1  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0340  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.08 
 
 
298 aa  95.1  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  30.59 
 
 
425 aa  94.4  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3726  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 
339 aa  93.6  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000157755  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  30 
 
 
1281 aa  91.7  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 
976 aa  91.7  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0892  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.05 
 
 
330 aa  90.1  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000556598  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  33.03 
 
 
359 aa  89  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  30.39 
 
 
376 aa  87  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  31.21 
 
 
376 aa  86.7  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  29.32 
 
 
2413 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0337  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.46 
 
 
265 aa  86.3  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  28.62 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1896  Sel1 domain-containing protein  31.03 
 
 
591 aa  84.7  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000746321  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4770  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.29 
 
 
383 aa  84.7  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  29.58 
 
 
380 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1217  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.48 
 
 
281 aa  82.4  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0465  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
878 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 
681 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.98 
 
 
318 aa  79  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.2 
 
 
341 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  32.41 
 
 
246 aa  78.6  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5815  Tetratricopeptide TPR_4  32.33 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.12 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.52 
 
 
725 aa  77  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  24.49 
 
 
985 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.79 
 
 
380 aa  76.3  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.18 
 
 
512 aa  75.1  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.62 
 
 
810 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.68 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.92 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 
362 aa  73.9  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1507  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.86 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 
685 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  31.2 
 
 
416 aa  72.4  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.46 
 
 
798 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  28.39 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  31.49 
 
 
838 aa  70.5  0.00000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1680  Sel1 domain-containing protein  28.64 
 
 
940 aa  70.1  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.428252 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  35.05 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  31.17 
 
 
795 aa  69.7  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  30.45 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  33.14 
 
 
235 aa  68.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.36 
 
 
632 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0434  TPR repeat-containing protein  23.32 
 
 
464 aa  68.6  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0837  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.1 
 
 
285 aa  68.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219906  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  30.25 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  24.33 
 
 
750 aa  67.8  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  30 
 
 
232 aa  67.8  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  30.73 
 
 
241 aa  67  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2272  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.16 
 
 
363 aa  66.6  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  26.73 
 
 
816 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  31.54 
 
 
208 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  31.9 
 
 
274 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  33 
 
 
637 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  36.23 
 
 
202 aa  65.1  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 
909 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  29.92 
 
 
271 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.84 
 
 
321 aa  64.7  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.37 
 
 
565 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 
3145 aa  64.7  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  21.53 
 
 
693 aa  63.9  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  33.8 
 
 
348 aa  63.9  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.49 
 
 
278 aa  63.2  0.000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1321  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 
181 aa  63.2  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000464925  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  30.73 
 
 
267 aa  62.8  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  24.91 
 
 
680 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  30.25 
 
 
482 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.5 
 
 
272 aa  63.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0453  hypothetical protein  28.44 
 
 
329 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  29.05 
 
 
328 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>