More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4144 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4144  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
527 aa  1070    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.482132  hitchhiker  0.00782841 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4381  extracellular solute-binding protein  39.89 
 
 
543 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000255213 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2462  4-phytase  40.72 
 
 
543 aa  392  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.36886  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5516  extracellular solute-binding protein family 5  42.61 
 
 
528 aa  385  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2461  4-phytase  40.96 
 
 
543 aa  388  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.792128  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4213  extracellular solute-binding protein  39.81 
 
 
543 aa  382  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0562482  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3823  4-phytase  40.91 
 
 
541 aa  381  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0952  4-phytase  35.7 
 
 
554 aa  337  2.9999999999999997e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4176  4-phytase  38.08 
 
 
534 aa  326  7e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3150  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  35.96 
 
 
537 aa  324  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.447408  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1079  extracellular solute-binding protein family 5  35.48 
 
 
552 aa  317  3e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.133059  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3796  4-phytase  37.24 
 
 
533 aa  301  2e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.207613  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8934  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  36.38 
 
 
543 aa  298  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12610  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  35.47 
 
 
586 aa  286  5.999999999999999e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.183632 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0252  oligopeptide ABC transporter periplasmic protein  35.51 
 
 
546 aa  266  5e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.213679  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0676  4-phytase  32.95 
 
 
541 aa  258  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2822  extracellular solute-binding protein  35.26 
 
 
547 aa  258  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.630772  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11050  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  34.71 
 
 
552 aa  257  4e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.273822  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1125  4-phytase  34.16 
 
 
585 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3311  extracellular solute-binding protein family 5  33.85 
 
 
560 aa  254  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2540  4-phytase  32.14 
 
 
561 aa  253  8.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000102543 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0486  extracellular solute-binding protein  33.64 
 
 
542 aa  249  1e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.410451 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3630  extracellular solute-binding protein family 5  31 
 
 
522 aa  233  7.000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0565  oligopeptide ABC transporter periplasmic protein  31.57 
 
 
546 aa  224  4e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13696  periplasmic dipeptide-binding lipoprotein dppA  31.92 
 
 
541 aa  211  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.17104 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3657  4-phytase  28.35 
 
 
536 aa  196  9e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3915  extracellular solute-binding protein family 5  29.67 
 
 
543 aa  194  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26170  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  32.75 
 
 
537 aa  189  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369222  normal  0.443852 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  28.22 
 
 
520 aa  177  6e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  27.51 
 
 
552 aa  176  8e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  28.11 
 
 
544 aa  167  4e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 
535 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  26.71 
 
 
541 aa  159  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  27.01 
 
 
594 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  27.66 
 
 
544 aa  157  4e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0190  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 
533 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  28.85 
 
 
534 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3842  extracellular solute-binding protein family 5  25.78 
 
 
535 aa  146  9e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3843  extracellular solute-binding protein family 5  27.16 
 
 
530 aa  146  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0512301  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0190  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.84 
 
 
536 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0189  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.84 
 
 
536 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3598  extracellular solute-binding protein  28.43 
 
 
525 aa  143  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000427863  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001004  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  28.77 
 
 
541 aa  143  8e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.84 
 
 
536 aa  143  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0214  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.03 
 
 
536 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  25.58 
 
 
532 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.47 
 
 
536 aa  141  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3851  extracellular solute-binding protein family 5  27.54 
 
 
530 aa  141  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000180183  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0547  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 
531 aa  141  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5349  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  29.26 
 
 
539 aa  140  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.60385  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5110  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.66 
 
 
536 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1448  extracellular solute-binding protein family 5  24.4 
 
 
535 aa  140  4.999999999999999e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.76 
 
 
566 aa  140  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70881  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0020  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 
558 aa  139  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0174  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 
536 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0538  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  27.62 
 
 
525 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461639  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0233  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.28 
 
 
536 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 
533 aa  136  9e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.11 
 
 
535 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 
538 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_512  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, periplasmic component  26.86 
 
 
530 aa  134  3e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.135113  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2012  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.95 
 
 
545 aa  134  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  26.19 
 
 
532 aa  134  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 
525 aa  134  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0468  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  27.74 
 
 
525 aa  133  6.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  26.89 
 
 
543 aa  133  7.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02949  hypothetical protein  26.77 
 
 
555 aa  133  9e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  26.99 
 
 
558 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1590  extracellular solute-binding protein family 5  25.81 
 
 
530 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  27.69 
 
 
535 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2890  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 
529 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271762  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0573  oligopeptide-binding protein, putative  26.46 
 
 
530 aa  131  3e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19540  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.89 
 
 
567 aa  131  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.394832  normal  0.058637 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 
533 aa  130  7.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0206  extracellular solute-binding protein family 5  29.08 
 
 
561 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.646254  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  24.81 
 
 
521 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07058  hypothetical protein  26.9 
 
 
559 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  25 
 
 
521 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25 
 
 
521 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  25 
 
 
521 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0699  extracellular solute-binding protein family 5  24.9 
 
 
590 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
521 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 
541 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  26.35 
 
 
525 aa  128  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0334  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 
541 aa  128  3e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.768653  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2031  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.9 
 
 
553 aa  127  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  29.07 
 
 
538 aa  127  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2195  extracellular solute-binding protein family 5  25.98 
 
 
547 aa  127  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1101  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  27.41 
 
 
543 aa  127  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.164329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1083  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.41 
 
 
543 aa  127  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0418  extracellular solute-binding protein family 5  26.28 
 
 
622 aa  127  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1191  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  27.41 
 
 
543 aa  127  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2743  extracellular solute-binding protein family 5  26.2 
 
 
542 aa  127  6e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000076574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1261  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.41 
 
 
543 aa  127  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3278  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.9 
 
 
553 aa  127  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1338  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.41 
 
 
543 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000264584  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0587  extracellular solute-binding protein family 5  26.17 
 
 
534 aa  125  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1077  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.41 
 
 
543 aa  126  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0368563  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  26.52 
 
 
525 aa  126  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1588  extracellular solute-binding protein family 5  25.47 
 
 
533 aa  125  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>