More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4060 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4060  ABC transporter related protein  100 
 
 		 570 aa  1115    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.282527  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0419  ABC transporter related protein  54.69 
 
 		 574 aa  595  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.937876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8453  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  46.63 
 
 		 564 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00619084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2082  ABC transporter transmembrane region  45.76 
 
 		 575 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5182  ABC transporter related  46.18 
 
 		 578 aa  412  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.459442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1127  ABC transporter transmembrane region  47.08 
 
 		 580 aa  356  6.999999999999999e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28420  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.05 
 
 		 607 aa  344  2e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.520014 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3041  ABC transporter transmembrane region  36.89 
 
 		 615 aa  330  3e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327338 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2573  ABC transporter related protein  39.22 
 
 		 619 aa  326  6e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0847371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0748  ABC transporter transmembrane region  40.64 
 
 		 593 aa  325  9e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0698  ABC transporter transmembrane region  36.93 
 
 		 612 aa  319  7.999999999999999e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4196  ABC transporter transmembrane region  39.24 
 
 		 580 aa  319  1e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00643785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.73 
 
 		 588 aa  316  7e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3727  ABC transporter related  35.04 
 
 		 578 aa  294  4e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202459  normal  0.0336359 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0647  ABC transporter transmembrane region  32.62 
 
 		 589 aa  281  2e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.415337 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01280  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.54 
 
 		 530 aa  207  4e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3472  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  39.48 
 
 		 564 aa  191  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00244165  hitchhiker  0.00122928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2406  ABC transporter related  34.35 
 
 		 570 aa  177  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5067  ABC transporter related  35.17 
 
 		 549 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  30.49 
 
 		 581 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1593  ABC transporter related protein  34.29 
 
 		 587 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.317799  normal  0.0625099 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3048  ABC transporter related  30.8 
 
 		 584 aa  160  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  31.63 
 
 		 631 aa  160  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  26.43 
 
 		 584 aa  160  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.35 
 
 		 586 aa  160  8e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  27.25 
 
 		 586 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  24.73 
 
 		 587 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  28.25 
 
 		 589 aa  159  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.25 
 
 		 586 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  27.25 
 
 		 586 aa  158  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.25 
 
 		 586 aa  158  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6064  ABC transporter related protein  29.85 
 
 		 575 aa  157  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1925  ABC transporter related  28.55 
 
 		 726 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.25 
 
 		 586 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0809  ABC transporter ATP-binding/permease  27.05 
 
 		 586 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00766142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.05 
 
 		 586 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  24.6 
 
 		 583 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.51 
 
 		 571 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.41 
 
 		 571 aa  154  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4432  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.05 
 
 		 548 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000325117  normal  0.0473884 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.51 
 
 		 571 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  25.51 
 
 		 571 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  25.51 
 
 		 571 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.51 
 
 		 571 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  24.77 
 
 		 585 aa  152  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  25.23 
 
 		 571 aa  152  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  25.23 
 
 		 571 aa  152  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1554  ABC transporter related  26.79 
 
 		 612 aa  152  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.138935  hitchhiker  0.00285078 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  24.79 
 
 		 592 aa  151  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  26.66 
 
 		 601 aa  151  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3689  ABC transporter related protein  31.77 
 
 		 560 aa  151  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  26.47 
 
 		 577 aa  151  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1685  ABC transporter related protein  20.84 
 
 		 574 aa  151  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  25.6 
 
 		 578 aa  150  5e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  24.21 
 
 		 571 aa  150  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0856  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  32.9 
 
 		 566 aa  150  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  28.42 
 
 		 583 aa  150  7e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  25.2 
 
 		 671 aa  150  7e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3033  ABC transporter related  29.66 
 
 		 598 aa  150  9e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.275745  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.14 
 
 		 571 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  26.4 
 
 		 586 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  25.93 
 
 		 585 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  24.02 
 
 		 580 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  26.92 
 
 		 577 aa  148  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  24.96 
 
 		 575 aa  148  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3184  ABC transporter related protein  27.79 
 
 		 671 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0347906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1055  ABC transporter related protein  25.71 
 
 		 571 aa  147  5e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3399  ABC transporter related  26.86 
 
 		 614 aa  146  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  28.2 
 
 		 566 aa  146  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  26.09 
 
 		 606 aa  145  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  25.68 
 
 		 589 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0830  ABC transporter related  30.43 
 
 		 612 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000934514 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  26.48 
 
 		 582 aa  144  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  26.55 
 
 		 1284 aa  145  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  25.15 
 
 		 663 aa  144  4e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  26.46 
 
 		 636 aa  144  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0647  ABC transporter related  26.48 
 
 		 641 aa  144  5e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3034  ABC transporter related  29.77 
 
 		 597 aa  144  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624415  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3344  ABC transporter related  26.23 
 
 		 615 aa  144  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  26.84 
 
 		 579 aa  144  6e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  23.59 
 
 		 738 aa  144  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0519  ABC transporter related  29.3 
 
 		 589 aa  143  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00043092  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003428  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  26.01 
 
 		 554 aa  143  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000488495  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  25.32 
 
 		 594 aa  143  8e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0117  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  21.26 
 
 		 574 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1444  ABC transporter-like protein  30.88 
 
 		 613 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0895961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02349  ABC transporter, ATP-binding protein  25.43 
 
 		 598 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0787  lipid export ABC transport protein  22.34 
 
 		 572 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  26.91 
 
 		 606 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  25.27 
 
 		 588 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  26.33 
 
 		 672 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  26.33 
 
 		 568 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  25.14 
 
 		 598 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.14 
 
 		 598 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  25.14 
 
 		 598 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0319  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  23.89 
 
 		 455 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1747  ABC transporter related  28.85 
 
 		 633 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5527  ABC transporter related protein  29.28 
 
 		 604 aa  140  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  25.14 
 
 		 598 aa  140  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  24.21 
 
 		 644 aa  140  7e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>