More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1157 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  53.92 
 
 
852 aa  858    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  100 
 
 
869 aa  1725    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3057  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  39.82 
 
 
811 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0118124  decreased coverage  0.000000211627 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  30.61 
 
 
866 aa  333  6e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  30.03 
 
 
891 aa  326  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  28.09 
 
 
868 aa  325  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  28.09 
 
 
868 aa  325  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  28 
 
 
868 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  31.29 
 
 
870 aa  321  3.9999999999999996e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  27.77 
 
 
868 aa  320  5e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  28.01 
 
 
868 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  29.11 
 
 
874 aa  299  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  28.81 
 
 
871 aa  293  8e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  47.59 
 
 
902 aa  276  9e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  28.99 
 
 
884 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  39.25 
 
 
887 aa  275  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  30.66 
 
 
837 aa  275  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  29.23 
 
 
889 aa  264  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  47.01 
 
 
892 aa  263  8e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  45.48 
 
 
781 aa  259  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  44.2 
 
 
769 aa  259  1e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  45.16 
 
 
907 aa  256  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  42.99 
 
 
825 aa  253  9.000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  46.39 
 
 
788 aa  251  3e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  46.25 
 
 
799 aa  250  6e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  42.6 
 
 
762 aa  250  8e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  44.1 
 
 
824 aa  249  1e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  41.44 
 
 
758 aa  249  2e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  42.99 
 
 
782 aa  248  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  40.54 
 
 
758 aa  248  4e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  31.81 
 
 
826 aa  246  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  41.1 
 
 
758 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  47.94 
 
 
971 aa  243  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  46.11 
 
 
840 aa  243  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  36.59 
 
 
891 aa  242  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1613  pyruvate, water dikinase  30.15 
 
 
854 aa  240  8e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  41.38 
 
 
754 aa  239  1e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  34.85 
 
 
869 aa  239  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  48.26 
 
 
873 aa  239  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  42.12 
 
 
810 aa  239  2e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  44.01 
 
 
950 aa  238  4e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  42.04 
 
 
757 aa  238  5.0000000000000005e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  45.31 
 
 
780 aa  237  6e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  35.05 
 
 
869 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  38.42 
 
 
865 aa  234  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  34.42 
 
 
868 aa  233  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  35.31 
 
 
868 aa  232  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  46.44 
 
 
785 aa  231  5e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  40.37 
 
 
890 aa  231  6e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  48.28 
 
 
835 aa  231  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  37.31 
 
 
758 aa  229  2e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  39.09 
 
 
903 aa  228  5.0000000000000005e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  42.32 
 
 
809 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  34.68 
 
 
868 aa  227  6e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  44.27 
 
 
785 aa  227  7e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  39.7 
 
 
761 aa  227  8e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1818  pyruvate, water dikinase  29.96 
 
 
788 aa  226  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0545713 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  39.38 
 
 
764 aa  225  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  40.12 
 
 
761 aa  225  3e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  42.82 
 
 
867 aa  224  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  35.14 
 
 
887 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  40.43 
 
 
762 aa  224  6e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  39.39 
 
 
809 aa  224  6e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2062  phosphoenolpyruvate synthase  45.15 
 
 
796 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224612  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  39.44 
 
 
812 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3805  Pyruvate, water dikinase  31.21 
 
 
842 aa  222  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.294309 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3918  Pyruvate, water dikinase  31.21 
 
 
842 aa  222  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2481  phosphoenolpyruvate synthase  41.52 
 
 
789 aa  220  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0281757  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  41.52 
 
 
789 aa  220  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  41.52 
 
 
789 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  0.0000000630455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  41.52 
 
 
789 aa  220  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  40.61 
 
 
760 aa  218  2.9999999999999998e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1592  phosphoenolpyruvate synthase  41.21 
 
 
789 aa  218  4e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000471516  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1736  phosphoenolpyruvate synthase  41.21 
 
 
789 aa  218  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00335783  normal  0.358822 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2549  phosphoenolpyruvate synthase  40.3 
 
 
789 aa  218  5e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00670387  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2009  phosphoenolpyruvate synthase  40.61 
 
 
791 aa  217  7e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000127973  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1574  pyruvate,water dikinase  40.37 
 
 
366 aa  217  8e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  41.77 
 
 
786 aa  217  8e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0173  phosphoenolpyruvate synthase  38.79 
 
 
812 aa  217  9e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2644  phosphoenolpyruvate synthase  40.91 
 
 
789 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  40.66 
 
 
810 aa  216  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  40.91 
 
 
789 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  44.16 
 
 
760 aa  215  2.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  42.2 
 
 
789 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  41.54 
 
 
791 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1549  phosphoenolpyruvate synthase  40.91 
 
 
789 aa  214  7e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0036639  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  40.66 
 
 
798 aa  213  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  30.5 
 
 
791 aa  213  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2072  phosphoenolpyruvate synthase  40.91 
 
 
789 aa  213  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.908755  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05843  phosphoenolpyruvate synthase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G14790)  41.95 
 
 
911 aa  213  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.775081  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  38.39 
 
 
906 aa  212  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2845  phosphoenolpyruvate synthase  39.78 
 
 
805 aa  212  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000642481  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2090  phosphoenolpyruvate synthase  42.42 
 
 
791 aa  211  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.721181  hitchhiker  0.00522752 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1816  phosphoenolpyruvate synthase  40.3 
 
 
803 aa  211  5e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1949  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  26.12 
 
 
868 aa  211  5e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1493  phosphoenolpyruvate synthase  40.3 
 
 
803 aa  211  5e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.514917  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0339  phosphoenolpyruvate synthase  40.44 
 
 
793 aa  211  6e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  39.13 
 
 
302 aa  209  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1871  phosphoenolpyruvate synthase  36.7 
 
 
790 aa  210  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000196099  hitchhiker  0.000000414181 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2297  phosphoenolpyruvate synthase  37.8 
 
 
808 aa  210  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000505096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>