More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2663 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2663  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  675    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  0.91255 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3670  hypothetical protein  79.3 
 
 		 343 aa  543  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3551  hypothetical protein  77.55 
 
 		 343 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3254  hypothetical protein  77.55 
 
 		 343 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308178  normal  0.172632 
 
 
-
 
NC_004310  BR1714  hypothetical protein  73.18 
 
 		 343 aa  508  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1203  hypothetical protein  72.3 
 
 		 343 aa  508  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3188  hypothetical protein  73.68 
 
 		 343 aa  507  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1656  hypothetical protein  67.64 
 
 		 314 aa  458  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0991  hypothetical protein  59.18 
 
 		 341 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6939  hypothetical protein  59.18 
 
 		 342 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4338  hypothetical protein  59.18 
 
 		 341 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3542  hypothetical protein  59.18 
 
 		 343 aa  398  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2744  hypothetical protein  58.31 
 
 		 342 aa  392  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0900497 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4488  hypothetical protein  60.06 
 
 		 341 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264247  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0800  hypothetical protein  59.77 
 
 		 341 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.625307 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0846  OmpA/MotB domain-containing protein  58.89 
 
 		 340 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.222157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3075  OmpA/MotB domain-containing protein  58.93 
 
 		 337 aa  375  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925956  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3344  OmpA/MotB domain-containing protein  55.1 
 
 		 345 aa  372  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.773573  normal  0.13321 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4541  OmpA/MotB domain protein  57.74 
 
 		 337 aa  359  4e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506849  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2160  OmpA/MotB domain protein  54.52 
 
 		 337 aa  345  5e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2316  OmpA/MotB domain protein  55.85 
 
 		 337 aa  344  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313851  normal  0.0895977 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2360  OmpA/MotB domain-containing protein  54.97 
 
 		 337 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.45206 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2637  OmpA/MotB domain protein  54.97 
 
 		 337 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.187978 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5365  OmpA/MotB domain-containing protein  53.8 
 
 		 337 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00131166 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1073  hypothetical protein  47.33 
 
 		 375 aa  325  7e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.273172  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2098  OmpA/MotB domain-containing protein  51.73 
 
 		 338 aa  317  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859782  hitchhiker  0.000615141 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3369  OmpA/MotB domain protein  42.71 
 
 		 374 aa  280  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1710  OmpA/MotB domain-containing protein  44.71 
 
 		 342 aa  276  3e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.590071  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2584  OmpA/MotB domain-containing protein  47.27 
 
 		 329 aa  275  7e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0322  OmpA/MotB domain-containing protein  43.27 
 
 		 348 aa  270  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2831  OmpA/MotB domain-containing protein  44.57 
 
 		 362 aa  265  8e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1504  hypothetical protein  40.94 
 
 		 326 aa  265  8.999999999999999e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.415101 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2289  hypothetical protein  51.07 
 
 		 525 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0965  hypothetical protein  51.07 
 
 		 525 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.238986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2261  OmpA/MotB domain-containing protein  36.08 
 
 		 427 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2208  hypothetical protein  48.5 
 
 		 525 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2940  hypothetical protein  49.57 
 
 		 648 aa  223  4e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1040  hypothetical protein  49.38 
 
 		 799 aa  218  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2095  hypothetical protein  45.71 
 
 		 784 aa  215  9e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1404  hypothetical protein  41.97 
 
 		 463 aa  213  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  32.95 
 
 		 289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  40.71 
 
 		 179 aa  106  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  44.92 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2629  OmpA family outer membrane protein  30 
 
 		 323 aa  99.4  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  27.54 
 
 		 287 aa  99  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  30.19 
 
 		 292 aa  99  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0325  OmpA/MotB domain protein  42.98 
 
 		 280 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 256 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  32.38 
 
 		 245 aa  95.9  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  42.11 
 
 		 249 aa  92  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  34.55 
 
 		 290 aa  91.7  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6481  OmpA/MotB domain protein  31.28 
 
 		 291 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0819  OmpA/MotB domain protein  41.03 
 
 		 244 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.912264 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  41.03 
 
 		 257 aa  90.5  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  41.67 
 
 		 290 aa  90.5  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  42.02 
 
 		 272 aa  90.1  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0231  flagellar MotB protein  43.59 
 
 		 366 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1874  OmpA/MotB domain-containing protein  43.59 
 
 		 366 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0773204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 246 aa  89  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  40.65 
 
 		 266 aa  88.2  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  40.34 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1148  hypothetical protein  40.77 
 
 		 215 aa  88.2  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.384763  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  39.84 
 
 		 267 aa  88.6  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1788  hypothetical protein  40 
 
 		 215 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1115  hypothetical protein  40 
 
 		 215 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0267  hypothetical protein  40 
 
 		 215 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  38.6 
 
 		 268 aa  87.4  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0116  hypothetical protein  40 
 
 		 215 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.56852  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1285  hypothetical protein  40 
 
 		 215 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426387  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1702  hypothetical protein  40 
 
 		 215 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0310  hypothetical protein  40 
 
 		 215 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  40.83 
 
 		 269 aa  86.7  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 288 aa  85.9  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  37.29 
 
 		 275 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.54 
 
 		 263 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2266  hypothetical protein  40 
 
 		 212 aa  85.5  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  33.06 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  40.5 
 
 		 242 aa  85.1  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  41.53 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3527  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.237024 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  41.32 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04090  hypothetical protein  36.97 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1016  OmpA/MotB  41.6 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.436254  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  36.44 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  38.24 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6427  hypothetical protein  34.15 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188529 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1013  OmpA/MotB domain-containing protein  40.68 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01765  putative flagellar motor protein MotB  29.33 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  34.44 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2103  hypothetical protein  37.04 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  45.45 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  39.71 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  37.96 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4485  hypothetical protein  39.37 
 
 		 215 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.593276  normal  0.69449 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  39.6 
 
 		 271 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  37.93 
 
 		 256 aa  82.4  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0804  hypothetical protein  38.58 
 
 		 215 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  35.77 
 
 		 281 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  35.37 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3239  hypothetical protein  39.53 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>