More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0976 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0976  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 195 aa  391  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0194348 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1420  50S ribosomal protein L10  88.37 
 
 		 172 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1322  50S ribosomal protein L10  88.37 
 
 		 172 aa  312  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.850894  normal  0.161771 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1822  50S ribosomal protein L10  87.21 
 
 		 172 aa  308  4e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1207  50S ribosomal protein L10  71.81 
 
 		 194 aa  281  6.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1821  50S ribosomal protein L10  73.84 
 
 		 172 aa  263  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0871653  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1246  50S ribosomal protein L10  72.67 
 
 		 172 aa  261  3e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.208748  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1945  50S ribosomal protein L10  71.51 
 
 		 172 aa  259  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.137242  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0569  50S ribosomal protein L10  69.19 
 
 		 172 aa  249  2e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000818206  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  65.12 
 
 		 172 aa  236  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4497  50S ribosomal protein L10  65.12 
 
 		 172 aa  224  9e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1345  50S ribosomal protein L10  61.63 
 
 		 172 aa  219  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0320244  normal  0.100348 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  62.79 
 
 		 172 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1898  50S ribosomal protein L10  62.86 
 
 		 175 aa  215  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0362  50S ribosomal protein L10  62.86 
 
 		 175 aa  214  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  61.63 
 
 		 172 aa  213  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1348  50S ribosomal protein L10  59.88 
 
 		 172 aa  211  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1529  50S ribosomal protein L10  60.47 
 
 		 172 aa  211  5.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5083  50S ribosomal protein L10  58.72 
 
 		 172 aa  211  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3689  50S ribosomal protein L10  58.72 
 
 		 172 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2283  50S ribosomal protein L10  59.3 
 
 		 172 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0400383  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4015  50S ribosomal protein L10  65.12 
 
 		 172 aa  209  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.866731  normal  0.631329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4384  50S ribosomal protein L10  65.12 
 
 		 172 aa  209  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.313613 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3197  50S ribosomal protein L10  58.72 
 
 		 172 aa  207  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3866  ribosomal protein L10  65.5 
 
 		 171 aa  207  7e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0292685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3460  50S ribosomal protein L10  58.14 
 
 		 172 aa  204  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  54.65 
 
 		 172 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2958  50S ribosomal protein L10  58.72 
 
 		 172 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0648852 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  56.73 
 
 		 174 aa  192  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  54.97 
 
 		 171 aa  189  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1701  50S ribosomal protein L10  57.31 
 
 		 171 aa  187  7e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  51.16 
 
 		 172 aa  184  6e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1701  50S ribosomal protein L10  53.8 
 
 		 171 aa  177  8e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0337  50S ribosomal protein L10  53.8 
 
 		 171 aa  177  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.635722  normal  0.581622 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0351  50S ribosomal protein L10  53.8 
 
 		 171 aa  177  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.703447 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  50.29 
 
 		 171 aa  176  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2544  50S ribosomal protein L10  53.8 
 
 		 171 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0265  50S ribosomal protein L10  52.91 
 
 		 172 aa  173  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0789  50S ribosomal protein L10  51.16 
 
 		 172 aa  171  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0029  50S ribosomal protein L10  54.76 
 
 		 170 aa  171  9e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167833  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0566  50S ribosomal protein L10  51.79 
 
 		 170 aa  170  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1804  50S ribosomal protein L10P  47.95 
 
 		 171 aa  156  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.160084 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  45.35 
 
 		 172 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0586  50S ribosomal protein L10  44.3 
 
 		 177 aa  118  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3642  50S ribosomal protein L10  44.94 
 
 		 183 aa  118  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.279713 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  41.14 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3594  50S ribosomal protein L10  43.04 
 
 		 178 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0508  50S ribosomal protein L10  42.41 
 
 		 175 aa  114  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  38.1 
 
 		 174 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4533  50S ribosomal protein L10  41.77 
 
 		 168 aa  112  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3869  50S ribosomal protein L10  44.2 
 
 		 182 aa  111  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3899  50S ribosomal protein L10  41.14 
 
 		 168 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3248  50S ribosomal protein L10  41.14 
 
 		 168 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  37.87 
 
 		 174 aa  110  9e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  41.13 
 
 		 173 aa  109  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  39.46 
 
 		 215 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  39.46 
 
 		 179 aa  108  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4444  50S ribosomal protein L10  41.77 
 
 		 176 aa  107  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.651473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  38.56 
 
 		 173 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  36.81 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0867  50S ribosomal protein L10  38.46 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2262  50S ribosomal protein L10  39.87 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168271  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1590  50S ribosomal protein L10  36.69 
 
 		 174 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2273  50S ribosomal protein L10  36.81 
 
 		 174 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  37.06 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0710  50S ribosomal protein L10  39.75 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.303715  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0385  50S ribosomal protein L10  36.47 
 
 		 177 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0360  50S ribosomal protein L10  36.47 
 
 		 177 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  35.67 
 
 		 173 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  34.32 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  38.56 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  39.01 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0171  50S ribosomal protein L10  41.21 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0111095  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  36.53 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  37.28 
 
 		 174 aa  102  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  35.33 
 
 		 175 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  38.79 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3448  ribosomal protein L10  38.92 
 
 		 167 aa  101  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000199113  hitchhiker  0.00604494 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06150  50S ribosomal protein L10  40.26 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  39.58 
 
 		 173 aa  99.8  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  37.25 
 
 		 168 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  33.73 
 
 		 172 aa  99.8  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  39.58 
 
 		 173 aa  99.8  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  37.25 
 
 		 168 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  39.22 
 
 		 166 aa  99.4  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0286  ribosomal protein L10  38.62 
 
 		 166 aa  99.4  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0147275  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  39.22 
 
 		 166 aa  99.4  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4758  50S ribosomal protein L10  39.61 
 
 		 166 aa  99  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00494482  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0445  50S ribosomal protein L10  39.61 
 
 		 166 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.470652  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0478  50S ribosomal protein L10  39.61 
 
 		 195 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00597987  hitchhiker  0.00527924 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 176 aa  98.6  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0475  50S ribosomal protein L10  39.61 
 
 		 166 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  37.89 
 
 		 179 aa  98.6  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  36.6 
 
 		 166 aa  98.2  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4285  ribosomal protein L10  40.26 
 
 		 166 aa  98.2  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000716484  hitchhiker  0.000000472968 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0828  50S ribosomal protein L10  38.31 
 
 		 166 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08740  50S ribosomal protein L10  38.31 
 
 		 166 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037754 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  37.25 
 
 		 166 aa  98.2  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  35.03 
 
 		 165 aa  97.8  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  34.39 
 
 		 165 aa  98.2  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>