More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0147 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0147  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 1226 aa  2409    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240041 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0601  hypothetical protein  43.36 
 
 		 1275 aa  804    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.1 
 
 		 1263 aa  946    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0209  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  48.57 
 
 		 1260 aa  937    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  37.36 
 
 		 978 aa  429  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.39 
 
 		 1261 aa  427  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  34.98 
 
 		 913 aa  363  1e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.88 
 
 		 1196 aa  349  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  28.67 
 
 		 1059 aa  246  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.39 
 
 		 1012 aa  224  6e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  47.6 
 
 		 1110 aa  212  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  50.67 
 
 		 1086 aa  202  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  45.08 
 
 		 1160 aa  195  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4609  Sel1-like protein  49.54 
 
 		 1105 aa  195  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0738  Sel1  50.47 
 
 		 1105 aa  194  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0801  Sel1  49.51 
 
 		 1134 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.835897  normal  0.855509 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3098  Sel1 domain-containing protein  51.5 
 
 		 1242 aa  179  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.445363  normal  0.0478733 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5759  Sel1 domain-containing protein  46.63 
 
 		 1081 aa  177  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0535  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.79 
 
 		 1072 aa  171  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3442  Sel1 domain protein repeat-containing protein  47.74 
 
 		 1088 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1095  Sel1 domain-containing protein  50.28 
 
 		 1003 aa  160  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3064  Sel1 domain-containing protein  45.45 
 
 		 795 aa  157  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.50136 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5289  Sel1 domain protein repeat-containing protein  50.74 
 
 		 1199 aa  152  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0371933  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0265  Sel1 domain protein repeat-containing protein  51.04 
 
 		 884 aa  140  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0121173 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  37.22 
 
 		 241 aa  125  7e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  41.4 
 
 		 684 aa  122  3e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  34.93 
 
 		 373 aa  122  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  34.93 
 
 		 373 aa  120  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  39.87 
 
 		 831 aa  119  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  43.62 
 
 		 961 aa  116  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  45.83 
 
 		 557 aa  116  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  41.61 
 
 		 1032 aa  113  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  38.93 
 
 		 490 aa  112  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  40.76 
 
 		 416 aa  112  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  38.55 
 
 		 489 aa  112  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  36.97 
 
 		 1037 aa  112  4.0000000000000004e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1450  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.32 
 
 		 997 aa  112  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0762725 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  40.27 
 
 		 789 aa  111  9.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  39.07 
 
 		 305 aa  111  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  39.35 
 
 		 264 aa  109  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  41.38 
 
 		 393 aa  109  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  38.26 
 
 		 490 aa  109  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  38.56 
 
 		 235 aa  108  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  40.52 
 
 		 276 aa  108  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  33.6 
 
 		 1402 aa  108  9e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  37.25 
 
 		 267 aa  106  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.77 
 
 		 318 aa  107  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  40.3 
 
 		 208 aa  104  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  37.18 
 
 		 232 aa  103  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  39.47 
 
 		 329 aa  103  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  37.82 
 
 		 376 aa  103  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 303 aa  102  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  37.65 
 
 		 185 aa  103  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  37.82 
 
 		 376 aa  102  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  40.74 
 
 		 523 aa  101  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  33.14 
 
 		 293 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.91 
 
 		 528 aa  101  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  34.87 
 
 		 838 aa  100  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  37.88 
 
 		 1877 aa  100  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  33.51 
 
 		 1493 aa  100  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.39 
 
 		 346 aa  100  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  33.94 
 
 		 193 aa  100  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.95 
 
 		 392 aa  99.8  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  36.6 
 
 		 2413 aa  99.8  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  40.88 
 
 		 685 aa  99  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  38.79 
 
 		 358 aa  98.6  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  32.93 
 
 		 246 aa  98.2  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  40.94 
 
 		 255 aa  98.2  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 344 aa  97.1  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  36.24 
 
 		 256 aa  96.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  35.06 
 
 		 245 aa  96.3  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  41.18 
 
 		 380 aa  96.3  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  33.54 
 
 		 254 aa  95.9  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.13 
 
 		 316 aa  96.3  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  34.9 
 
 		 425 aa  95.5  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  39.87 
 
 		 384 aa  95.5  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  32.46 
 
 		 274 aa  95.1  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  37.5 
 
 		 303 aa  95.1  7e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  30.73 
 
 		 448 aa  95.1  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  42.36 
 
 		 464 aa  94.4  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.82 
 
 		 341 aa  94.4  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 		 252 aa  94.4  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.91 
 
 		 380 aa  94  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  39.47 
 
 		 1910 aa  94  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  36.6 
 
 		 1002 aa  94  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  40.67 
 
 		 482 aa  93.2  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.09 
 
 		 321 aa  92.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.76 
 
 		 255 aa  92.4  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  34.67 
 
 		 342 aa  92  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.8 
 
 		 343 aa  92  6e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  35.29 
 
 		 348 aa  92  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.72 
 
 		 225 aa  90.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  34.67 
 
 		 271 aa  90.1  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.13 
 
 		 231 aa  90.1  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  40.15 
 
 		 221 aa  89.7  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  37.24 
 
 		 763 aa  89.4  4e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4151  Sel1 domain-containing protein  36.75 
 
 		 365 aa  88.6  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216978  normal  0.586602 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.95 
 
 		 278 aa  89  6e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0727  hypothetical protein  37.25 
 
 		 1366 aa  88.6  6e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.989916 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  39.6 
 
 		 976 aa  88.6  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>