252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2074 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2074  peptidase S15  100 
 
 
524 aa  1040    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419616  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0746  hypothetical protein  50.68 
 
 
532 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.2892  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3626  hydrolase CocE/NonD family protein  47.57 
 
 
561 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0776  peptidase S15  49.7 
 
 
517 aa  423  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2573  peptidase S15  38.04 
 
 
497 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000331981  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1557  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  36.11 
 
 
557 aa  285  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.198824  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0130  hydrolase CocE/NonD family protein subfamily  35.7 
 
 
572 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1638  CocE/NonD family hydrolase  35.7 
 
 
567 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1556  CocE/NonD family hydrolase  35.7 
 
 
572 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1243  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.74 
 
 
572 aa  259  6e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0786  peptidase S15  32.37 
 
 
562 aa  218  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.781394  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04393  hydrolase CocE/NonD family protein subfamily  68.15 
 
 
218 aa  206  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.890391  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04392  hypothetical protein  54.88 
 
 
109 aa  86.3  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  27.11 
 
 
897 aa  83.2  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  24.02 
 
 
868 aa  77.4  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  36.15 
 
 
866 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  36.11 
 
 
1010 aa  72.8  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  40.78 
 
 
876 aa  70.9  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1123  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  28.33 
 
 
678 aa  70.1  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.361162  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4056  peptidase S15  26.83 
 
 
655 aa  69.3  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1356  ABC transporter related protein  25.36 
 
 
814 aa  68.2  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0819  peptidase S15  24.14 
 
 
674 aa  67  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  32.34 
 
 
311 aa  64.7  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  31.54 
 
 
968 aa  64.3  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1067  peptidase S15  25.27 
 
 
775 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0036  TPR repeat-containing protein  36.94 
 
 
514 aa  61.6  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83786  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0778  ABC transporter related protein  44.55 
 
 
976 aa  61.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  31.58 
 
 
286 aa  61.6  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  31.58 
 
 
286 aa  61.6  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5229  peptidase S15  25.71 
 
 
806 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.649793  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1126  peptidase S15  28.62 
 
 
335 aa  60.5  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.96 
 
 
944 aa  60.5  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.128345  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  41.57 
 
 
287 aa  60.1  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  33.9 
 
 
345 aa  60.1  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0377  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.43 
 
 
626 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  31.79 
 
 
318 aa  58.9  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4797  peptidase S15  27.38 
 
 
494 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.88 
 
 
641 aa  58.2  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1796  peptidase S15  21.52 
 
 
569 aa  57.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  34.04 
 
 
368 aa  57.4  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.29 
 
 
626 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.111113 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  36.56 
 
 
295 aa  56.2  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.29 
 
 
626 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1794  hypothetical protein  35.65 
 
 
306 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  33.98 
 
 
309 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01305  predicted hydrolase  40.7 
 
 
310 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2318  conserved hypothetical protein  40.7 
 
 
306 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243417  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1443  hypothetical protein  40.7 
 
 
306 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1975  hypothetical protein  41.86 
 
 
306 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1565  hypothetical protein  40.7 
 
 
306 aa  55.5  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0717  hypothetical protein  32.86 
 
 
378 aa  56.2  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2297  peptidase S15  41.86 
 
 
306 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1041  peptidase S15  36.11 
 
 
778 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1886  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.11 
 
 
636 aa  55.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1540  hypothetical protein  40.7 
 
 
306 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2117  hypothetical protein  32.14 
 
 
378 aa  55.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  35.4 
 
 
326 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01315  hypothetical protein  40.7 
 
 
310 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.224039  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1459  membrane protein  35.71 
 
 
329 aa  55.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0286008 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3063  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.7 
 
 
688 aa  55.1  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0327  hydrolase of the alpha/beta family protein  32.14 
 
 
378 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  0.920722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8147  hypothetical protein  34.09 
 
 
634 aa  54.7  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  30.64 
 
 
316 aa  54.7  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4077  peptidase S15  30.05 
 
 
854 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122952  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  33.09 
 
 
320 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0545  esterase/lipase  37.5 
 
 
311 aa  53.9  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0764  membrane protein  35.71 
 
 
330 aa  53.9  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000138363 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2419  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
295 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal  0.0845077 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.09 
 
 
629 aa  53.9  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.262385  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2869  peptidase S15  23.96 
 
 
644 aa  53.9  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  25.09 
 
 
254 aa  53.5  0.000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.9 
 
 
622 aa  53.5  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0271  membrane protein  36.61 
 
 
320 aa  53.5  0.000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.974828  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  32.41 
 
 
451 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3398  peptidase S15  31.72 
 
 
362 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62942  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4772  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.33 
 
 
632 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2277  peptidase S15  29.71 
 
 
336 aa  52.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6730  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.7 
 
 
632 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.907657  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1772  putative esterase  22.65 
 
 
598 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0442239  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.11 
 
 
644 aa  52.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1693  putative signal peptide protein  37.5 
 
 
305 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0722  hypothetical protein  34.96 
 
 
368 aa  52.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5192  peptidase S15  36 
 
 
813 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606479  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  35.61 
 
 
342 aa  52  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3114  peptidase S15  24.6 
 
 
560 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.976266  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  29.81 
 
 
309 aa  52  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.09 
 
 
642 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  31.46 
 
 
292 aa  51.2  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3981  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  27 
 
 
529 aa  51.6  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1770  peptidase S15  24.79 
 
 
668 aa  50.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000424  hydrolase of the alpha/beta superfamily  30.71 
 
 
367 aa  50.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712062  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  35.04 
 
 
302 aa  51.2  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  29.33 
 
 
306 aa  51.2  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3908  Xaa-Pro dipeptidyl-peptidase  24.92 
 
 
667 aa  50.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.135659  normal  0.218311 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0078  prolyl oligopeptidase family protein  27.33 
 
 
665 aa  50.8  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1306  hypothetical protein  22.81 
 
 
306 aa  50.8  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0753003  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0702  hypothetical protein  27.27 
 
 
294 aa  50.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00518069  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1669  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.69 
 
 
629 aa  50.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1978  hypothetical protein  30.34 
 
 
304 aa  50.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0892878  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00920  alpha/beta superfamily hydrolase  33.33 
 
 
333 aa  50.4  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.340226 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>