173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3872 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3872  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  100 
 
 		 301 aa  619  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.493691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3109  Ndr family protein  24.51 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112267  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2694  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00231525  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1509  alpha/beta hydrolase fold  20.43 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000127113 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5749  Alpha/beta hydrolase  32.81 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.03491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4695  hypothetical protein  27.92 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.621835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  22.8 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24610  putative hydrolytic enzyme  27.97 
 
 		 333 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.16 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  24.12 
 
 		 288 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  31.68 
 
 		 272 aa  53.5  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1648  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 276 aa  53.1  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.210907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0445  triacylglycerol lipase  23.75 
 
 		 265 aa  52.8  0.000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.193973  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 		 387 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2084  putative hydrolytic enzyme  27.97 
 
 		 333 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0656  Alpha/beta hydrolase fold  24.32 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198236  decreased coverage  0.00768241 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2426  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 408 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278939 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  25.47 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  23.68 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  22.22 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  20.28 
 
 		 333 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2097  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1824  alpha/beta hydrolase fold  26.03 
 
 		 332 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2124  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 		 259 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.46136 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18880  hydrolase, alpha/beta fold family  27.97 
 
 		 341 aa  50.8  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481755  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 309 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 309 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2080  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 		 259 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 309 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3473  alpha/beta hydrolase fold protein  26.19 
 
 		 323 aa  50.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338124  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  21.52 
 
 		 289 aa  50.4  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3787  Alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 274 aa  50.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  25.53 
 
 		 387 aa  50.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2137  alpha/beta hydrolase fold  23.7 
 
 		 353 aa  49.7  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.887771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4565  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 303 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0422308  hitchhiker  0.000747551 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1810  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 408 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424856  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2422  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 408 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00445003  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3929  alpha/beta hydrolase fold  25.89 
 
 		 278 aa  49.7  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.419283  decreased coverage  0.00575896 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3663  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 304 aa  49.3  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30576  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 268 aa  49.3  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  23.83 
 
 		 309 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4244  alpha/beta hydrolase fold  24.67 
 
 		 331 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0679936  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1638  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  26.06 
 
 		 298 aa  48.9  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1154  hydrolase, alpha/beta fold family  30.77 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  24 
 
 		 277 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0992  hypothetical protein  30.25 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3987  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136743  normal  0.0524037 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2513  Alpha/beta hydrolase fold  24.11 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  29.36 
 
 		 339 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0215  alpha/beta family hydrolase  28.57 
 
 		 274 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00842638  normal  0.87662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5789  alpha/beta hydrolase fold protein  21.74 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.0718304 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  20.49 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  31.19 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  24.77 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  20.49 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  31.19 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  31.19 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  22.22 
 
 		 374 aa  47.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  19.74 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1307  alpha/beta hydrolase fold protein  29.59 
 
 		 259 aa  48.1  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.365456  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  22.35 
 
 		 332 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2332  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9504  alpha/beta hydrolase protein  27.84 
 
 		 272 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.932687  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  27.93 
 
 		 381 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4100  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  25.22 
 
 		 277 aa  47.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2213  alpha/beta hydrolase fold protein  21.86 
 
 		 280 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302063 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  19.21 
 
 		 331 aa  47  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  30.09 
 
 		 280 aa  47  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2661  alpha/beta hydrolase fold protein  27.56 
 
 		 282 aa  46.6  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  30.21 
 
 		 259 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  31.53 
 
 		 275 aa  46.6  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3536  alpha/beta hydrolase fold  21.53 
 
 		 332 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 		 345 aa  46.6  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2201  alpha/beta fold family hydrolase  24.66 
 
 		 332 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2856  alpha/beta fold family hydrolase  21.51 
 
 		 441 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1746  alpha/beta fold family hydrolase  21.51 
 
 		 439 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.294927  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  23.39 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  22.84 
 
 		 562 aa  46.2  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0581  alpha/beta fold family hydrolase  21.51 
 
 		 342 aa  46.2  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0996  Alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 		 259 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2147  Alpha/beta hydrolase fold  24.48 
 
 		 350 aa  46.2  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.365847 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  21.31 
 
 		 291 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  20.49 
 
 		 291 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3600  alpha/beta hydrolase fold  23.22 
 
 		 333 aa  46.2  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  21.31 
 
 		 291 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2800  alpha/beta fold family hydrolase  21.51 
 
 		 404 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3264  hydrolase, alpha/beta fold family  25 
 
 		 332 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4280  Alpha/beta hydrolase  21.37 
 
 		 353 aa  45.8  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1248  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  26.64 
 
 		 311 aa  45.8  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2740  alpha/beta fold family hydrolase  21.51 
 
 		 404 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1320  alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 		 345 aa  45.8  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.543574  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  31.9 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  20.24 
 
 		 299 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.27 
 
 		 372 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>