15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0992 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0992  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  577  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3533  hypothetical protein  52.23 
 
 
293 aa  262  6e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.981661 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0826  alpha/beta hydrolase fold protein  50.18 
 
 
290 aa  206  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.599386  normal  0.0336638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4695  hypothetical protein  42.7 
 
 
293 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.621835  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4175  hypothetical protein  36.75 
 
 
280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516461  normal  0.259895 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5789  alpha/beta hydrolase fold protein  29.92 
 
 
306 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.0718304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4800  hypothetical protein  39.42 
 
 
101 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3872  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  30.25 
 
 
301 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.493691  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3109  Ndr family protein  25.26 
 
 
281 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112267  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2661  alpha/beta hydrolase fold protein  34.17 
 
 
282 aa  46.2  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0831  alpha/beta hydrolase fold  24.8 
 
 
269 aa  45.8  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.37854  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5547  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
297 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.093894 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  31.48 
 
 
296 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  38 
 
 
340 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0162  3-oxoadipate enol-lactonase  30.56 
 
 
261 aa  42.4  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>