44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3533 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3533  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  586  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.981661 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0992  hypothetical protein  52.23 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0826  alpha/beta hydrolase fold protein  51.25 
 
 		 290 aa  238  9e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.599386  normal  0.0336638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4695  hypothetical protein  42.91 
 
 		 293 aa  205  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.621835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4175  hypothetical protein  37.23 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516461  normal  0.259895 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2171  alpha/beta hydrolase fold  20.43 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  27.35 
 
 		 272 aa  50.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  35.42 
 
 		 296 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3987  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 		 298 aa  49.7  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136743  normal  0.0524037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5789  alpha/beta hydrolase fold protein  30.52 
 
 		 306 aa  49.3  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.0718304 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2661  alpha/beta hydrolase fold protein  30.65 
 
 		 282 aa  49.3  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5547  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 		 297 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093894 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2572  alpha/beta hydrolase fold protein  28.51 
 
 		 263 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4800  hypothetical protein  37.5 
 
 		 101 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  34.16 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1498  alpha/beta fold family hydrolase  30.28 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1108  Alpha/beta hydrolase  35.1 
 
 		 298 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024849  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 		 264 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  28.7 
 
 		 255 aa  46.6  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6084  hydrolase  29.25 
 
 		 278 aa  46.6  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  25.94 
 
 		 275 aa  46.6  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1509  alpha/beta hydrolase fold  25.4 
 
 		 290 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000127113 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3872  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  26.26 
 
 		 301 aa  45.8  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.493691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5584  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.554679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  29.56 
 
 		 581 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0646  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1236  alpha/beta fold family hydrolase  29.31 
 
 		 239 aa  44.3  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000165889  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1827  hydrolase  30.34 
 
 		 270 aa  43.9  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  25.11 
 
 		 317 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4023  alpha/beta hydrolase fold protein  31.62 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  21.05 
 
 		 276 aa  43.5  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17930  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.17 
 
 		 330 aa  43.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.659857  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.68 
 
 		 372 aa  43.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6549  alpha/beta hydrolase fold protein  29.9 
 
 		 281 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.385661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1418  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 		 276 aa  43.5  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.961025  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2211  alpha/beta hydrolase fold  39.62 
 
 		 270 aa  42.7  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  25.4 
 
 		 261 aa  43.1  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  21.65 
 
 		 562 aa  43.1  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2694  alpha/beta fold family hydrolase  20.34 
 
 		 290 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00231525  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4100  alpha/beta hydrolase fold  32.24 
 
 		 303 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3109  Ndr family protein  24.18 
 
 		 281 aa  42.7  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112267  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4565  alpha/beta hydrolase fold  32.24 
 
 		 303 aa  42.7  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0422308  hitchhiker  0.000747551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5387  alpha/beta hydrolase  26.95 
 
 		 290 aa  42.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  26.32 
 
 		 270 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>