63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0826 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0826  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
290 aa  546  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.599386  normal  0.0336638 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3533  hypothetical protein  51.25 
 
 
293 aa  252  5.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.981661 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0992  hypothetical protein  50.18 
 
 
297 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4695  hypothetical protein  43.93 
 
 
293 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.621835  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4175  hypothetical protein  32.4 
 
 
280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516461  normal  0.259895 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.22 
 
 
369 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 
271 aa  50.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2661  alpha/beta hydrolase fold protein  41.05 
 
 
282 aa  50.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3170  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 
291 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.702233  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  23.64 
 
 
253 aa  48.1  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.97 
 
 
370 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  21.74 
 
 
253 aa  48.1  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3872  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  30.61 
 
 
301 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.493691  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4100  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 
303 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0147  alpha/beta hydrolase  26.92 
 
 
282 aa  47  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  23.13 
 
 
299 aa  47  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 
296 aa  47  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4565  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 
303 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0422308  hitchhiker  0.000747551 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  39.64 
 
 
296 aa  46.6  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.36 
 
 
371 aa  46.2  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  33.09 
 
 
581 aa  45.8  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04395  hydrolase, alpha/beta fold family protein  24.06 
 
 
263 aa  45.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.681804  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0675  alpha/beta hydrolase fold  24.57 
 
 
290 aa  45.4  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0467323 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.53 
 
 
370 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0269  alpha/beta fold family hydrolase  28.89 
 
 
265 aa  45.4  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.699859  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1801  alpha/beta hydrolase fold  21.09 
 
 
254 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4236  alpha/beta hydrolase fold protein  38.1 
 
 
301 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 
283 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  29.05 
 
 
302 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3987  alpha/beta hydrolase fold  36.7 
 
 
298 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136743  normal  0.0524037 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1108  Alpha/beta hydrolase  41.51 
 
 
298 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024849  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3194  hydrolase, alpha/beta fold family  35.14 
 
 
294 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5863  alpha/beta hydrolase fold protein  37.04 
 
 
265 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 
340 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0829  alpha/beta hydrolase fold  25.33 
 
 
290 aa  43.5  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.41609  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 
340 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  25.81 
 
 
321 aa  43.5  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 
340 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2497  alpha/beta fold family hydrolase  30.56 
 
 
301 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1237  alpha/beta fold family hydrolase  30.56 
 
 
301 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4206  alpha/beta hydrolase fold  35.4 
 
 
275 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381827  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  33.33 
 
 
271 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1941  alpha/beta hydrolase fold  39.19 
 
 
291 aa  43.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0494053  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4433  alpha/beta hydrolase fold  35.4 
 
 
275 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4272  alpha/beta hydrolase fold  35.4 
 
 
275 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.328456  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1310  alpha/beta fold family hydrolase  30.56 
 
 
303 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0918705  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5547  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 
297 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.093894 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1333  alpha/beta fold family hydrolase  30.56 
 
 
301 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0975  alpha/beta fold family hydrolase  30.56 
 
 
301 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2211  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 
270 aa  42.7  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356847  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3669  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
306 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0316  alpha/beta fold family hydrolase  30.56 
 
 
301 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271899  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0592  alpha/beta fold family hydrolase  30.56 
 
 
301 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438744  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6821  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 
300 aa  42.7  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2954  hydrolase  30.97 
 
 
294 aa  42.7  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000251178  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
288 aa  42.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0537  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  31.3 
 
 
292 aa  42.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.169084  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.61 
 
 
374 aa  42.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2136  alpha/beta hydrolase fold  23.85 
 
 
266 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000406984  decreased coverage  0.00000741326 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.85 
 
 
371 aa  42.4  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4281  lysophospholipase  27.02 
 
 
330 aa  42.4  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.85 
 
 
371 aa  42.4  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.85 
 
 
371 aa  42.4  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>