224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3626 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3626  protein of unknown function DUF179  100 
 
 		 186 aa  384  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4074  protein of unknown function DUF179  59.78 
 
 		 186 aa  241  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499752  hitchhiker  0.00807045 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7071  protein of unknown function DUF179  44.94 
 
 		 184 aa  171  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1773  transcriptional regulator  44.2 
 
 		 182 aa  169  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.728608  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0197  protein of unknown function DUF179  44.81 
 
 		 183 aa  169  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09628  putative transcriptional regulator  41.3 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.770481  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0637  hypothetical protein  40 
 
 		 189 aa  157  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0140  hypothetical protein  40.22 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0777  protein of unknown function DUF179  39.89 
 
 		 187 aa  154  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0885  hypothetical protein  37.57 
 
 		 187 aa  153  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1896  protein of unknown function DUF179  40.45 
 
 		 187 aa  152  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.56007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0776  protein of unknown function DUF179  36.67 
 
 		 187 aa  150  7e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1601  hypothetical protein  39.55 
 
 		 188 aa  148  5e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0943857  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2142  protein of unknown function DUF179  35.36 
 
 		 187 aa  147  9e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1688  protein of unknown function DUF179  36.72 
 
 		 187 aa  145  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0090  protein of unknown function DUF179  33.7 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7076  hypothetical protein  33.51 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0723  hypothetical protein  33.52 
 
 		 196 aa  104  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3631  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5633  protein of unknown function DUF179  40.31 
 
 		 146 aa  101  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591685  normal  0.939371 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  31.58 
 
 		 189 aa  101  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  34.29 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  34.97 
 
 		 188 aa  99  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0483  hypothetical protein  33.16 
 
 		 190 aa  99  4e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.195339  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2389  hypothetical protein  33.33 
 
 		 198 aa  98.6  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.468382  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2406  protein of unknown function DUF179  32 
 
 		 192 aa  98.6  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.802635  normal  0.951535 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  31.34 
 
 		 200 aa  98.6  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002461  hypothetical protein  30.49 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  30.99 
 
 		 200 aa  97.1  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0923  hypothetical protein  33.68 
 
 		 196 aa  97.1  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0987  hypothetical protein  34.22 
 
 		 196 aa  97.1  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39570  hypothetical protein  31.49 
 
 		 198 aa  95.9  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.336935 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1704  hypothetical protein  29.12 
 
 		 208 aa  95.5  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.77077  hitchhiker  0.00529814 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3343  hypothetical protein  32.35 
 
 		 187 aa  94.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.329323 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3335  hypothetical protein  32.35 
 
 		 187 aa  94.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.288189 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  32.8 
 
 		 187 aa  94.7  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3259  hypothetical protein  32.35 
 
 		 187 aa  94.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0107487  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3439  hypothetical protein  32.35 
 
 		 187 aa  94.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.623694  hitchhiker  0.00691193 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3712  hypothetical protein  31.52 
 
 		 187 aa  94.4  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.081023  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3270  hypothetical protein  32.35 
 
 		 187 aa  94.7  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.552102  normal  0.0744312 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0636  hypothetical protein  33.96 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0620  hypothetical protein  33.96 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3090  hypothetical protein  31.76 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132976  decreased coverage  0.00000221223 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02778  hypothetical protein  31.18 
 
 		 187 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.551052  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0747  protein of unknown function DUF179  31.07 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4251  hypothetical protein  31.18 
 
 		 187 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.390045  normal  0.313475 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3106  hypothetical protein  31.18 
 
 		 187 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0766  hypothetical protein  31.07 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155835  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3291  hypothetical protein  31.18 
 
 		 187 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3380  hypothetical protein  31.18 
 
 		 187 aa  93.6  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966977  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  32 
 
 		 192 aa  93.2  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02741  hypothetical protein  31.18 
 
 		 187 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1710  hypothetical protein  35.23 
 
 		 192 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0331  protein of unknown function DUF179  31.35 
 
 		 198 aa  92.8  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502019  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  30.85 
 
 		 197 aa  92.4  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  32.12 
 
 		 191 aa  91.3  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5076  protein of unknown function DUF179  31.41 
 
 		 187 aa  90.9  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  29.24 
 
 		 188 aa  90.9  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  28.16 
 
 		 186 aa  90.5  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2223  hypothetical protein  31.58 
 
 		 195 aa  90.9  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440526  decreased coverage  0.00358368 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0924  hypothetical protein  32.68 
 
 		 193 aa  90.5  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.127262  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  30.56 
 
 		 190 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0547  hypothetical protein  31.98 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0367  protein of unknown function DUF179  31.09 
 
 		 192 aa  89.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4617  protein of unknown function DUF179  33.33 
 
 		 199 aa  89.4  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0436  hypothetical protein  32.57 
 
 		 190 aa  89  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2896  protein of unknown function DUF179  32.56 
 
 		 199 aa  88.6  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3774  hypothetical protein  31.44 
 
 		 198 aa  89  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3573  hypothetical protein  32.56 
 
 		 199 aa  88.6  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.425942 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0501  hypothetical protein  30.43 
 
 		 187 aa  88.2  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1471  hypothetical protein  34.76 
 
 		 205 aa  88.6  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3910  hypothetical protein  31.52 
 
 		 187 aa  88.6  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0230557  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3882  protein of unknown function DUF179  31.91 
 
 		 191 aa  88.6  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  31.98 
 
 		 193 aa  88.2  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  29.69 
 
 		 201 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  30.95 
 
 		 216 aa  88.2  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  31.98 
 
 		 190 aa  87  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  31.28 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  32.4 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1179  protein of unknown function DUF179  32.04 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0188247  normal  0.235234 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  30.18 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  29.65 
 
 		 186 aa  86.3  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0683  hypothetical protein  31.03 
 
 		 186 aa  86.3  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1069  hypothetical protein  31.48 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  28.11 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6933  protein of unknown function DUF179  31.11 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6268  hypothetical protein  29.95 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.383786  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3352  hypothetical protein  29.51 
 
 		 212 aa  86.3  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0115365  decreased coverage  0.00224252 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1517  hypothetical protein  31.46 
 
 		 200 aa  85.9  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5037  hypothetical protein  29.05 
 
 		 190 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0485  hypothetical protein  28.49 
 
 		 190 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  30.3 
 
 		 193 aa  85.1  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  33.14 
 
 		 189 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  29.31 
 
 		 198 aa  84.7  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0940  hypothetical protein  30.65 
 
 		 188 aa  84.7  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.335136  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4833  protein of unknown function DUF179  27.86 
 
 		 225 aa  84.7  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0922435  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  29.61 
 
 		 208 aa  84.7  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1428  hypothetical protein  30.12 
 
 		 188 aa  84.7  7e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3348  hypothetical protein  29.65 
 
 		 196 aa  84.7  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.142843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  32.56 
 
 		 190 aa  84.3  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>