More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_29380 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2614  ABC transporter related protein  74.02 
 
 		 558 aa  767    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0525  ABC transporter related  63.41 
 
 		 560 aa  690    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0719  ABC transporter related  65.42 
 
 		 569 aa  720    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9185  ABC transporter related protein  59.5 
 
 		 536 aa  662    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0938  ABC transporter related protein  61.21 
 
 		 539 aa  650    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1338  ABC transporter related protein  60.68 
 
 		 539 aa  643    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02910  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  63.24 
 
 		 571 aa  696    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3918  ABC transporter related  65.19 
 
 		 564 aa  712    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29380  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  100 
 
 		 562 aa  1124    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186742  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1465  ABC transporter related protein  60.5 
 
 		 544 aa  644    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3891  ABC transporter related  60.9 
 
 		 554 aa  649    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4144  ABC transporter related  64.83 
 
 		 560 aa  734    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0882  ABC transporter related  64.98 
 
 		 574 aa  713    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.743322  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2749  ABC transporter related protein  62.63 
 
 		 561 aa  682    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.308133  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1325  ABC transporter related  67.2 
 
 		 572 aa  743    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0902  ABC transporter related protein  57.42 
 
 		 555 aa  629  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.118594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4282  ABC transporter related  60.14 
 
 		 559 aa  625  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184754  hitchhiker  0.00727726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0969  ABC transporter related  58.02 
 
 		 553 aa  603  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350056  normal  0.122999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1583  ABC transporter related  56.76 
 
 		 542 aa  591  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7235  ABC transporter related protein  57.8 
 
 		 543 aa  575  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.602341  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0413  ABC transporter related protein  42.6 
 
 		 488 aa  335  1e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.630834  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  29.36 
 
 		 645 aa  197  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  28.21 
 
 		 643 aa  196  9e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  28.26 
 
 		 767 aa  194  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  28.76 
 
 		 690 aa  194  4e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  29.04 
 
 		 668 aa  193  9e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4130  ABC transporter related  30.36 
 
 		 533 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3988  ABC transporter, ATPase subunit  30.17 
 
 		 533 aa  190  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  30.13 
 
 		 544 aa  189  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4100  ABC transporter-related protein  29.98 
 
 		 533 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0619  ABC transporter ATP-binding protein uup  27.49 
 
 		 646 aa  188  2e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.828103  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  28.78 
 
 		 672 aa  188  3e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  29.27 
 
 		 543 aa  188  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0013  ABC transporter related  28.73 
 
 		 540 aa  187  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0433  ABC transporter related  29.68 
 
 		 532 aa  187  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.893812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  28.73 
 
 		 709 aa  186  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  30.39 
 
 		 641 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3479  ABC transporter, ATPase subunit  30.67 
 
 		 535 aa  184  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0481507  normal  0.481436 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  30 
 
 		 540 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  30.17 
 
 		 540 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  30.06 
 
 		 549 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  30.06 
 
 		 543 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1811  ABC transporter related  27.22 
 
 		 557 aa  183  9.000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  28.28 
 
 		 641 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1795  ABC transporter related  29.87 
 
 		 530 aa  181  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.348279 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49454  ABC(ATP-binding) family transporter  29.33 
 
 		 649 aa  181  4e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00209815  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  28.83 
 
 		 649 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  26.16 
 
 		 622 aa  180  5.999999999999999e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0493  ATPase  27.89 
 
 		 653 aa  180  7e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.521292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1127  ABC transporter, ATP-binding protein  27.36 
 
 		 530 aa  179  8e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  29.96 
 
 		 545 aa  179  9e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6309  ABC transporter related  29.32 
 
 		 530 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  29.6 
 
 		 533 aa  179  1e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1770  ABC transporter related  29.32 
 
 		 530 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210956  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0151  ABC transporter, ATP-binding protein  28.07 
 
 		 530 aa  179  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.175992  normal  0.980614 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2269  ABC transporter, ATP-binding protein  29.83 
 
 		 530 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  28.88 
 
 		 636 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1709  ABC transporter related  29.89 
 
 		 530 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1681  ABC transporter related  29.89 
 
 		 522 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0540  ABC transporter ATP-binding protein uup  28.06 
 
 		 644 aa  179  2e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.692263  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  27.73 
 
 		 636 aa  177  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  25.83 
 
 		 632 aa  177  4e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  28.23 
 
 		 581 aa  177  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1500  ABC transporter related  29.61 
 
 		 530 aa  176  7e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0377572 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02269  hypothetical protein  27.36 
 
 		 530 aa  176  8e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  27.86 
 
 		 631 aa  176  9e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  28.28 
 
 		 649 aa  176  9e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0100  ABC transporter, ATP-binding protein  29.7 
 
 		 599 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.388339  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1308  ABC transporter, ATP-binding protein  29.7 
 
 		 530 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  29.7 
 
 		 599 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58247  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2318  putative ABC transport system, ATP-binding protein  29.7 
 
 		 555 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1606  ABC transporter related  27.76 
 
 		 528 aa  176  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2480  ABC transporter related  29.14 
 
 		 529 aa  176  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2186  ABC transporter, ATP-binding protein  29.7 
 
 		 555 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1795  ABC transporter, ATP-binding protein  29.7 
 
 		 599 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0657845  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  29.13 
 
 		 645 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2072  ABC transporter related protein  31.13 
 
 		 533 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  30.36 
 
 		 620 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  28.57 
 
 		 640 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2150  ABC transporter ATPase  29.7 
 
 		 599 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911921  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1747  ABC transporter related  31.07 
 
 		 615 aa  175  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219257  normal  0.123618 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  26.99 
 
 		 663 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  28.21 
 
 		 637 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  28.21 
 
 		 637 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  27.59 
 
 		 651 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  25.92 
 
 		 631 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003501  ABC transporter ATP-binding protein  27.36 
 
 		 530 aa  174  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  28.21 
 
 		 637 aa  174  3.9999999999999995e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0945  ABC transporter, ATP-binding protein  29.92 
 
 		 530 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.638605  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1063  ABC transporter related  29.92 
 
 		 530 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0954  ABC transporter related  29.37 
 
 		 633 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  26.88 
 
 		 663 aa  174  5e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  31.02 
 
 		 532 aa  174  5e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00577413  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  27.71 
 
 		 644 aa  174  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1943  ABC transporter, fused ATPase subunits  28.39 
 
 		 530 aa  174  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.002693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2315  ABC transporter related  28.57 
 
 		 530 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.751632  normal  0.0855999 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3204  ABC transporter, ATP-binding protein  27.36 
 
 		 530 aa  173  7.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.305557  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1950  ABC transporter related  27.85 
 
 		 653 aa  173  7.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5068  ABC transporter, fused ATPase subunits  29.51 
 
 		 530 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.882741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  28.65 
 
 		 649 aa  173  7.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>