263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_27300 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_27300  Na+/melibiose symporter-like transporter  100 
 
 		 435 aa  818    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.566046  normal  0.31967 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1213  major facilitator superfamily MFS_1  48.42 
 
 		 405 aa  278  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1780  major facilitator superfamily MFS_1  35.93 
 
 		 403 aa  188  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3741  major facilitator transporter  36.27 
 
 		 426 aa  172  7.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6319  hypothetical protein  37.21 
 
 		 397 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187301  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4122  major facilitator transporter  36.53 
 
 		 423 aa  168  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2187  major facilitator family transporter  33.33 
 
 		 495 aa  77.8  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  24.23 
 
 		 1833 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  27.11 
 
 		 1816 aa  73.2  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  30 
 
 		 1839 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0504  major facilitator family transporter  22.88 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.280977  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4030  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161616 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0376  major facilitator family transporter  22.46 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0390  major facilitator family transporter  22.46 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4868  major facilitator family transporter  22.46 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0434  major facilitator family transporter  22.46 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0456  major facilitator family transporter  22.46 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0890515  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0367  sugar transporter  22.03 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000621781  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  20 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  20 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0364  sugar transporter  22.46 
 
 		 410 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0371  major facilitator transporter  22.03 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0504  major facilitator family transporter  22.03 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1603  putative permease  30.51 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 		 444 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 		 440 aa  63.2  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  31.42 
 
 		 441 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  23.45 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  27.33 
 
 		 1806 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  25.86 
 
 		 1876 aa  60.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  25.72 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2448  major facilitator transporter  23.21 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00172355  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1884  major facilitator transporter  24.36 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.019643  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 		 426 aa  58.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 		 463 aa  57.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 		 429 aa  57  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 415 aa  57  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 410 aa  57  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  22.94 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  24.47 
 
 		 432 aa  56.6  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  27.02 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 438 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  26.68 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  27.79 
 
 		 1769 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  24.31 
 
 		 414 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 448 aa  54.7  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2733  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 424 aa  54.3  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2672  putative permease  22.73 
 
 		 427 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.929224  normal  0.0249328 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 454 aa  53.9  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  26.02 
 
 		 1829 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  23.36 
 
 		 417 aa  53.5  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 406 aa  53.5  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 451 aa  53.5  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  23.36 
 
 		 415 aa  53.5  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 450 aa  53.1  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  24.3 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 424 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3648  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1011  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 		 458 aa  52.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 432 aa  52.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 416 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  23.7 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 461 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  26.29 
 
 		 418 aa  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4889  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 449 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 416 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 416 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 415 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  24.92 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4580  H+ antiporter protein  26.8 
 
 		 443 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  23.7 
 
 		 417 aa  51.6  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 414 aa  51.6  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0377  major facilitator transporter  21.35 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 390 aa  51.6  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  25 
 
 		 399 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 457 aa  51.6  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 390 aa  51.6  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 		 441 aa  51.2  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0309  drug:proton antiporter  26.89 
 
 		 414 aa  50.8  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  23.61 
 
 		 417 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.24 
 
 		 401 aa  51.2  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>