More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_20420 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_20420  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 492 aa  915    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1084  major facilitator transporter  38.14 
 
 		 469 aa  224  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.471807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3797  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 461 aa  224  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1717  MFS transporter  36.62 
 
 		 462 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0361  multidrug resistance efflux protein  32.62 
 
 		 468 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26743  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4819  major facilitator superfamily MFS_1  36.4 
 
 		 489 aa  211  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4090  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 		 464 aa  206  9e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6047  major facilitator superfamily MFS_1  34.76 
 
 		 515 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1216  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 462 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0290926  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3895  major facilitator transporter  37.67 
 
 		 483 aa  177  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.373107  hitchhiker  0.00809284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6463  MFS transporter  34.64 
 
 		 462 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0844216 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0925  major facilitator superfamily MFS_1  33.62 
 
 		 445 aa  168  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0793679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26390  arabinose efflux permease family protein  32.31 
 
 		 495 aa  162  9e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.095972 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1560  major facilitator superfamily MFS_1  36.96 
 
 		 498 aa  160  5e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.64499  hitchhiker  0.00932539 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08610  arabinose efflux permease family protein  36.65 
 
 		 471 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3501  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 		 461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0294154 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3939  major facilitator superfamily MFS_1  37.06 
 
 		 465 aa  147  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.116564  hitchhiker  0.00194225 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0739  major facilitator superfamily MFS_1  35.16 
 
 		 504 aa  145  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.184033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3774  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 465 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0209  major facilitator superfamily MFS_1  31.87 
 
 		 452 aa  137  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0436  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1278  major facilitator superfamily protein superfamily  31.55 
 
 		 467 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0634379  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1623  major facilitator transporter  31.23 
 
 		 467 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.374459  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1591  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 467 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0742  major facilitator transporter  22.8 
 
 		 474 aa  102  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.368035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3297  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 477 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  35.42 
 
 		 486 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0847  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 458 aa  97.8  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362439  normal  0.458775 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0895  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 479 aa  97.8  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.915282 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  36.63 
 
 		 501 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1223  major facilitator transporter  33 
 
 		 478 aa  97.1  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0088  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 467 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1508  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 467 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.52 
 
 		 495 aa  95.5  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.9 
 
 		 495 aa  95.5  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  35.4 
 
 		 500 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2558  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 548 aa  94.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573295  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  36.05 
 
 		 515 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.76 
 
 		 500 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.52 
 
 		 682 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2150  major facilitator superfamily MFS_1  37.74 
 
 		 480 aa  92.4  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.308405  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0270  major facilitator transporter  36.25 
 
 		 497 aa  92.4  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.52 
 
 		 682 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1028  MFS permease  32.81 
 
 		 484 aa  91.7  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1252  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  32.5 
 
 		 517 aa  91.3  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  23.27 
 
 		 448 aa  90.9  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.08 
 
 		 495 aa  90.5  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.01 
 
 		 682 aa  90.5  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0169  major facilitator superfamily MFS_1  34.18 
 
 		 496 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3850  major facilitator superfamily MFS_1  35.33 
 
 		 491 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.330919  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3767  major facilitator superfamily MFS_1  35.33 
 
 		 491 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.952675  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3844  major facilitator transporter  36.31 
 
 		 481 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.50058  normal  0.461173 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3710  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.52 
 
 		 489 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.6 
 
 		 697 aa  89  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 685 aa  89  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1959  major facilitator transporter  32.62 
 
 		 488 aa  88.2  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.789773  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1358  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 		 489 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.5787  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1453  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 484 aa  87.4  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  26.87 
 
 		 535 aa  87.4  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2685  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.33 
 
 		 511 aa  87  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0846353  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3679  major facilitator superfamily MFS_1  33.74 
 
 		 523 aa  87  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5357  major facilitator superfamily MFS_1  31.87 
 
 		 497 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.987143 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0668  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 490 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0411  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.38 
 
 		 531 aa  84.7  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1220  major facilitator superfamily MFS_1  24.18 
 
 		 450 aa  84  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3267  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 487 aa  84  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309977  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0485  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 		 486 aa  83.6  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.53 
 
 		 685 aa  83.6  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 539 aa  83.6  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2880  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.33 
 
 		 511 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104329 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 494 aa  83.6  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.67 
 
 		 511 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2632  multidrug resistance protein B  25.33 
 
 		 511 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000173688  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1255  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 492 aa  83.6  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269509  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0528  major facilitator superfamily MFS_1  24.22 
 
 		 484 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000187583  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2608  multidrug resistance protein B  24.33 
 
 		 511 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000057385  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0751  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.44 
 
 		 491 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0160  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 		 496 aa  83.2  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.74 
 
 		 650 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  24.84 
 
 		 507 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3186  drug transport protein, putative  31.07 
 
 		 507 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.95 
 
 		 511 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000215764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2877  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.95 
 
 		 511 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363154  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.75 
 
 		 502 aa  82.4  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2894  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.42 
 
 		 511 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0578631  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2387  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 511 aa  82.4  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2928  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.42 
 
 		 511 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000585053  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.35 
 
 		 501 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  24.61 
 
 		 487 aa  81.6  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2351  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.42 
 
 		 504 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500074  normal  0.144653 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2100  major facilitator superfamily MFS_1  24.92 
 
 		 449 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2050  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.89 
 
 		 516 aa  80.5  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.851205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.62 
 
 		 528 aa  80.5  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.88 
 
 		 569 aa  80.5  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.67 
 
 		 525 aa  79.7  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2919  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.3 
 
 		 508 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2939  major facilitator superfamily MFS_1  33.74 
 
 		 500 aa  79  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0041  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.25 
 
 		 530 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3936  putative drug resistance transporter  31.34 
 
 		 548 aa  78.2  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.37 
 
 		 511 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>