225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3370 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0685  Alkaline phosphatase  94.78 
 
 		 501 aa  980    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3370  alkaline phosphatase  100 
 
 		 498 aa  1026    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0583  alkaline phosphatase  99.6 
 
 		 498 aa  1023    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0695  alkaline phosphatase  94.78 
 
 		 498 aa  980    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1145  alkaline phosphatase  76.66 
 
 		 499 aa  801    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0664  alkaline phosphatase  94.78 
 
 		 498 aa  980    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3540  peptidoglycan glycosyltransferase  99 
 
 		 498 aa  1018    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1350  alkaline phosphatase  78.23 
 
 		 496 aa  822    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000312808 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3692  alkaline phosphatase  94.78 
 
 		 498 aa  980    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1158  alkaline phosphatase  81.12 
 
 		 502 aa  850    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0069994 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1250  alkaline phosphatase  79.03 
 
 		 496 aa  832    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3932  alkaline phosphatase family protein  57.17 
 
 		 527 aa  566  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3369  alkaline phosphatase  58.11 
 
 		 546 aa  556  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0665  alkaline phosphatase  58.2 
 
 		 545 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0686  Alkaline phosphatase  58.2 
 
 		 545 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0696  alkaline phosphatase  58.2 
 
 		 545 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3691  alkaline phosphatase  58.2 
 
 		 545 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0584  alkaline phosphatase  57.91 
 
 		 546 aa  554  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1249  alkaline phosphatase  57.26 
 
 		 543 aa  549  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.837433  normal  0.877858 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3539  alkaline phosphatase  57.7 
 
 		 546 aa  551  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1157  alkaline phosphatase  57.38 
 
 		 545 aa  548  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798229 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1349  alkaline phosphatase  57.08 
 
 		 543 aa  544  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29054  decreased coverage  0.000000619726 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2542  alkaline phosphatase  52.47 
 
 		 532 aa  522  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22423  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1144  alkaline phosphatase  57.29 
 
 		 535 aa  523  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.342169  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3408  alkaline phosphatase  52.83 
 
 		 527 aa  514  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3933  alkaline phosphatase family protein  51.06 
 
 		 616 aa  508  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2543  alkaline phosphatase  52.42 
 
 		 640 aa  499  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.365989  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3409  alkaline phosphatase  51.88 
 
 		 552 aa  500  1e-140  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3229  alkaline phosphatase  53.48 
 
 		 527 aa  495  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.657228  normal  0.96521 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0655  alkaline phosphatase  49.71 
 
 		 565 aa  476  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0358582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1206  alkaline phosphatase  51.98 
 
 		 505 aa  476  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.43523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33820  Alkaline phosphatase  50.38 
 
 		 548 aa  470  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055185  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2890  Alkaline phosphatase  49.31 
 
 		 568 aa  460  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1602  alkaline phosphatase  48.09 
 
 		 565 aa  420  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01900  alkaline phosphatase, placental type  47.48 
 
 		 568 aa  414  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732479  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1655  alkaline phosphatase  47.69 
 
 		 576 aa  404  1e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.403448  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3027  alkaline phosphatase  47.73 
 
 		 501 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0737.1  alkaline phosphatase  91.53 
 
 		 215 aa  329  9e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3330  Alkaline phosphatase  41.25 
 
 		 464 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0098  putative alkaline phosphatase signal peptide protein  41.9 
 
 		 467 aa  310  4e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3653  Alkaline phosphatase  40.82 
 
 		 464 aa  310  5e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5567  alkaline phosphatase  37.76 
 
 		 518 aa  284  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4085  alkaline phosphatase  39.39 
 
 		 467 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000151439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5568  alkaline phosphatase  38.2 
 
 		 470 aa  278  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2853  alkaline phosphatase  40.72 
 
 		 478 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4084  alkaline phosphatase  38.16 
 
 		 486 aa  269  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795005  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0981  alkaline phosphatase  39.23 
 
 		 471 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.681601  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1040  Alkaline phosphatase  39.57 
 
 		 468 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0332  alkaline phosphatase family protein  40.13 
 
 		 557 aa  259  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3331  Alkaline phosphatase  35.85 
 
 		 485 aa  259  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.971304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3654  Alkaline phosphatase  35.85 
 
 		 485 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2021  alkaline phosphatase family protein  40.3 
 
 		 476 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2265  alkaline phosphatase family protein  40.3 
 
 		 476 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0106  alkaline phosphatase family protein  37.77 
 
 		 467 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115439  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0567  alkaline phosphatase family protein subfamily, putative  39.91 
 
 		 509 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3074  alkaline phosphatase family protein  37.77 
 
 		 467 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2020  alkaline phosphatase family protein  37.77 
 
 		 467 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0384  alkaline phosphatase family protein  39.91 
 
 		 479 aa  258  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2266  alkaline phosphatase family protein  37.77 
 
 		 467 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3073  alkaline phosphatase family protein  40.3 
 
 		 577 aa  257  4e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0385  alkaline phosphatase family protein  37.77 
 
 		 467 aa  257  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0405  alkaline phosphatase family protein  37.77 
 
 		 467 aa  257  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0404  alkaline phosphatase family protein  39.91 
 
 		 476 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0568  alkaline phosphatase family protein  37.55 
 
 		 467 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2852  alkaline phosphatase  37.12 
 
 		 463 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0333  alkaline phosphatase family protein  37.58 
 
 		 466 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0097  putative alkaline phosphatase lipoprotein transmembrane  36.88 
 
 		 483 aa  239  8e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0982  alkaline phosphatase  38.11 
 
 		 480 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1041  Alkaline phosphatase  38.33 
 
 		 478 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0089  alkaline phosphatase  31.85 
 
 		 584 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0396  Alkaline phosphatase  32.58 
 
 		 585 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0714  alkaline phosphatase  32.14 
 
 		 589 aa  171  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.818593 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  35.87 
 
 		 434 aa  169  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1592  alkaline phosphatase  30.41 
 
 		 581 aa  167  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  35.76 
 
 		 434 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  29.93 
 
 		 455 aa  159  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0180  Alkaline phosphatase  30.15 
 
 		 671 aa  159  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245482  normal  0.47349 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4114  Alkaline phosphatase  29.8 
 
 		 581 aa  153  7e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.904627  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3920  Alkaline phosphatase  29.59 
 
 		 581 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6455  alkaline phosphatase  29.88 
 
 		 609 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3906  Alkaline phosphatase  29.92 
 
 		 584 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0030  alkaline phosphatase  31.23 
 
 		 582 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4230  Alkaline phosphatase  29.92 
 
 		 584 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0380845 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0605  alkaline phosphatase  28.35 
 
 		 584 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0260735  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1137  alkaline phosphatase  32.53 
 
 		 436 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1289  alkaline phosphatase  27.72 
 
 		 580 aa  141  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0302462  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2754  Alkaline phosphatase  28.91 
 
 		 547 aa  140  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3156  Alkaline phosphatase  28.77 
 
 		 585 aa  139  7.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.7511  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3306  hypothetical protein  28.77 
 
 		 585 aa  139  7.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0524  Alkaline phosphatase  33.04 
 
 		 676 aa  139  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  32.34 
 
 		 541 aa  139  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0754  alkaline phosphatase  32.62 
 
 		 433 aa  139  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0541  alkaline phosphatase  32.37 
 
 		 506 aa  137  5e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.208558  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1231  alkaline phosphatase  33.93 
 
 		 589 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2364  alkaline phosphatase  27.84 
 
 		 575 aa  135  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0542806  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1200  alkaline phosphatase  29.38 
 
 		 481 aa  133  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3000  alkaline phosphatase  28.19 
 
 		 575 aa  132  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  31.23 
 
 		 525 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1075  Alkaline phosphatase  28.63 
 
 		 635 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4427  alkaline phosphatase  30.53 
 
 		 461 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000511978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>