More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4364 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4364  manganese and iron superoxide dismutase  100 
 
 		 203 aa  422  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0235641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1781  manganese and iron superoxide dismutase  54.45 
 
 		 239 aa  227  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6201  manganese and iron superoxide dismutase  51.32 
 
 		 197 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555386 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2502  manganese and iron superoxide dismutase  50.26 
 
 		 305 aa  202  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1205  putative superoxide dismutase  49.74 
 
 		 302 aa  201  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0474205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5758  manganese and iron superoxide dismutase  47.03 
 
 		 308 aa  191  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2234  manganese and iron superoxide dismutase  48.66 
 
 		 205 aa  184  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88554  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7990  manganese and iron superoxide dismutase  47.59 
 
 		 205 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0509196  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6159  manganese and iron superoxide dismutase  46.96 
 
 		 204 aa  178  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2529  manganese and iron superoxide dismutase  46.11 
 
 		 197 aa  178  4.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.507658  normal  0.528937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2537  manganese and iron superoxide dismutase  43.39 
 
 		 224 aa  159  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1158  superoxide dismutase  39.34 
 
 		 192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000413259  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2410  manganese and iron superoxide dismutase  38.8 
 
 		 192 aa  122  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000430969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1453  manganese and iron superoxide dismutase  37.36 
 
 		 192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.46198  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0956  superoxide dismutase  37.16 
 
 		 192 aa  116  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2204  manganese and iron superoxide dismutase  35.16 
 
 		 194 aa  115  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000605082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2022  manganese and iron superoxide dismutase  34.62 
 
 		 194 aa  112  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000363607 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2101  manganese and iron superoxide dismutase  37.11 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0840  manganese and iron superoxide dismutase  35.36 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00121294  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1258  Superoxide dismutase  34.65 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.651957  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_827  superoxide dismutase  33.7 
 
 		 192 aa  101  6e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0145605  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5044  superoxide dismutase  33.15 
 
 		 207 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5132  superoxide dismutase  33.15 
 
 		 207 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5423  superoxide dismutase  33.15 
 
 		 207 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1904  manganese and iron superoxide dismutase  32.82 
 
 		 201 aa  99.4  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338856 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13882  superoxide dismutase [Fe] sodA  32.97 
 
 		 207 aa  99  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0075  Superoxide dismutase  32.45 
 
 		 207 aa  95.9  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2012  manganese and iron superoxide dismutase  33.67 
 
 		 201 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1927  manganese and iron superoxide dismutase  33.67 
 
 		 201 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.241942  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1827  Superoxide dismutase  31.22 
 
 		 208 aa  95.5  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000201558 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2086  superoxide dismutase  31.07 
 
 		 226 aa  94.7  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242809  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1952  manganese and iron superoxide dismutase  33.16 
 
 		 201 aa  94.7  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.777519  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01340  superoxide dismutase  29.47 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.345095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1450  Superoxide dismutase  27.18 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.755095  normal  0.0649698 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2079  Superoxide dismutase  29.29 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1650  manganese and iron superoxide dismutase  31.16 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.140081 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11340  superoxide dismutase  29.27 
 
 		 208 aa  89.4  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.551271  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2515  manganese and iron superoxide dismutase  30.15 
 
 		 205 aa  88.2  8e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.24618  normal  0.282222 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1239  superoxide dismutase  29 
 
 		 198 aa  87.8  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0161  Superoxide dismutase  29.38 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0957  superoxide dismutase  29.05 
 
 		 204 aa  85.9  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00270  superoxide dismutase  28.49 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3578  Superoxide dismutase  27.96 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0209455  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19570  superoxide dismutase  28.49 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00440124  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1075  Superoxide dismutase  30.73 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948241 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1292  Superoxide dismutase  27.59 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0365  superoxide dismutase (Fe)  31.75 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00134609  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1574  manganese and iron superoxide dismutase  28.5 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011707 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2817  superoxide dismutase  29.71 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0214  superoxide dismutase  29.35 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0126  Superoxide dismutase  29.51 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1898  superoxide dismutase  28.5 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2542  Superoxide dismutase  29.08 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.796981  normal  0.230493 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2522  Superoxide dismutase  28.36 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2227  Superoxide dismutase  25.77 
 
 		 348 aa  77.8  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000583713  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42832  mutase superoxide dismutase  29.84 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0492  Superoxide dismutase  31.25 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1888  Superoxide dismutase  26.47 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.544416  hitchhiker  0.00197441 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0732  Superoxide dismutase  27.32 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3497  superoxide dismutase  27.08 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.912988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2880  Superoxide dismutase  30.35 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3322  superoxide dismutase  28.37 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2012  Superoxide dismutase  26.4 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5819  Superoxide dismutase  25 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0616  Superoxide dismutase  26.46 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1059  superoxide dismutase  26.02 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000300614  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1236  Superoxide dismutase  28.92 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000554492  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2050  Superoxide dismutase  28.43 
 
 		 262 aa  75.1  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2024  Superoxide dismutase  28.43 
 
 		 262 aa  75.1  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0456  Superoxide dismutase  27.86 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.686075  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2178  Superoxide dismutase  28.06 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.799015  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4937  superoxide dismutase  28.37 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1561  superoxide dismutase  27.04 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000819306 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1593  superoxide dismutase  27.04 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.386764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1378  superoxide dismutase  27.04 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1351  superoxide dismutase  27.04 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1350  superoxide dismutase  27.04 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15670  superoxide dismutase  26.88 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0050  superoxide dismutase (Fe)  37.5 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.408378  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8508  Superoxide dismutase  24.46 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1489  superoxide dismutase  27.04 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1916  superoxide dismutase  26.8 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1889  superoxide dismutase  27.23 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.61793 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1629  superoxide dismutase  27.04 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3234  Superoxide dismutase  27.04 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183398  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0164  superoxide dismutase, Fe  37.6 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4363  superoxide dismutase, Fe  28.37 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4059  superoxide dismutase  27.88 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0328  superoxide dismutase (Fe)  30.77 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.731602  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0205  superoxide dismutase, Fe  37.6 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.570423  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1715  superoxide dismutase  30.81 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.654042 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37820  Fe-Superoxide dismutase  27.88 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41434  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56780  superoxide dismutase  27.88 
 
 		 193 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1592  Superoxide dismutase  32.52 
 
 		 214 aa  72  0.000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1503  superoxide dismutase  30.65 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0226275 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1391  superoxide dismutase  27.27 
 
 		 304 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1711  superoxide dismutase  28.49 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3822  superoxide dismutase  27.27 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000660557 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0184  superoxide dismutase, Fe  36.8 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4473  superoxide dismutase  26.57 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>