43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2404 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2900  hypothetical protein  83.47 
 
 		 880 aa  1498    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000339287  hitchhiker  0.00411804 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1658  hypothetical protein  79.89 
 
 		 884 aa  1465    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2930  hypothetical protein  77.53 
 
 		 907 aa  1389    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2404  hypothetical protein  100 
 
 		 883 aa  1819    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.647298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2116  hypothetical protein  77.21 
 
 		 882 aa  1368    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1474  hypothetical protein  78.45 
 
 		 911 aa  1407    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1533  hypothetical protein  78.22 
 
 		 911 aa  1412    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000671911 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1539  hypothetical protein  77.99 
 
 		 911 aa  1409    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.57335  hitchhiker  0.0040034 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2901  hypothetical protein  43.6 
 
 		 393 aa  313  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00324052  normal  0.0158775 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2405  hypothetical protein  45.68 
 
 		 411 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.774074  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2931  hypothetical protein  43.92 
 
 		 390 aa  308  3e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1657  hypothetical protein  44.23 
 
 		 395 aa  308  3e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.646777  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1532  hypothetical protein  43.38 
 
 		 394 aa  303  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.159244  unclonable  0.000000000103674 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1473  hypothetical protein  43.25 
 
 		 394 aa  303  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00637009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1538  hypothetical protein  43.38 
 
 		 394 aa  302  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0374559  hitchhiker  0.00216399 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2117  hypothetical protein  41.48 
 
 		 396 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2707  hypothetical protein  42.13 
 
 		 367 aa  262  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2621  hypothetical protein  41.57 
 
 		 366 aa  262  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.928291  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2802  hypothetical protein  41.85 
 
 		 367 aa  257  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0654  hypothetical protein  44.24 
 
 		 368 aa  255  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000736898 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1980  hypothetical protein  42.64 
 
 		 374 aa  252  3e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3273  hypothetical protein  43.03 
 
 		 345 aa  249  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3272  Parallel beta-helix repeat protein  38.96 
 
 		 402 aa  230  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1979  parallel beta-helix repeat-containing protein  38.28 
 
 		 411 aa  223  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1377  hypothetical protein  40.13 
 
 		 343 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2706  parallel beta-helix repeat protein  35.68 
 
 		 413 aa  215  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2801  parallel beta-helix repeat protein  35.68 
 
 		 413 aa  214  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0653  hypothetical protein  36.95 
 
 		 415 aa  213  9e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000140192 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2620  parallel beta-helix repeat-containing protein  35.66 
 
 		 413 aa  213  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1378  hypothetical protein  38.38 
 
 		 400 aa  207  7e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.895761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00205  hypothetical protein  35.21 
 
 		 383 aa  192  2.9999999999999997e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1644  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.45 
 
 		 423 aa  172  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.202542  normal  0.498245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  33.61 
 
 		 768 aa  158  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1106  hypothetical protein  29.88 
 
 		 509 aa  110  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.875896 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3850  hypothetical protein  28.96 
 
 		 359 aa  98.2  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0639053  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2914  hypothetical protein  25.66 
 
 		 386 aa  83.2  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.292842  normal  0.0819402 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  29.15 
 
 		 2172 aa  74.3  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2283  hypothetical protein  27.27 
 
 		 427 aa  70.5  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2966  hypothetical protein  24.13 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0581802  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3162  hypothetical protein  23.22 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374745  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3054  hypothetical protein  23.22 
 
 		 366 aa  63.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.837847  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3553  hypothetical protein  23.02 
 
 		 453 aa  52.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2594  hypothetical protein  23.11 
 
 		 683 aa  45.8  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.397172 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>