73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2127 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  687    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  55.9 
 
 		 329 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  56.52 
 
 		 329 aa  350  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  49.38 
 
 		 338 aa  311  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  55.21 
 
 		 365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  55.21 
 
 		 365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  54.89 
 
 		 365 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  53.8 
 
 		 361 aa  301  9e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  54.89 
 
 		 365 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  54.89 
 
 		 365 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  53.8 
 
 		 361 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  53.8 
 
 		 361 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  54.28 
 
 		 346 aa  289  6e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  52.41 
 
 		 354 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  43.47 
 
 		 372 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  45.37 
 
 		 417 aa  276  5e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  47.6 
 
 		 342 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  35.69 
 
 		 327 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  37.46 
 
 		 318 aa  186  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  34.2 
 
 		 323 aa  183  4.0000000000000006e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  37.86 
 
 		 330 aa  182  9.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  34.37 
 
 		 337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  35.05 
 
 		 318 aa  179  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  34.29 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  35.11 
 
 		 318 aa  162  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  30.32 
 
 		 349 aa  160  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  28.67 
 
 		 339 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  34.33 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  30.84 
 
 		 326 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  30.56 
 
 		 321 aa  125  7e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  28.66 
 
 		 316 aa  122  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  27.14 
 
 		 374 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  28.39 
 
 		 315 aa  119  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  28.25 
 
 		 316 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  26.84 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  24.69 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  27.56 
 
 		 346 aa  107  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  26.48 
 
 		 353 aa  106  5e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  26.98 
 
 		 357 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  26.98 
 
 		 357 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  27.52 
 
 		 317 aa  105  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  24.31 
 
 		 316 aa  104  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  27.36 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  28.89 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  28.89 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  28.53 
 
 		 352 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  26.46 
 
 		 344 aa  99.8  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  28.43 
 
 		 318 aa  97.1  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  27.55 
 
 		 341 aa  91.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  27.24 
 
 		 341 aa  90.9  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  28.23 
 
 		 355 aa  89  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  27.16 
 
 		 372 aa  86.7  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  26.13 
 
 		 341 aa  87  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  27.41 
 
 		 337 aa  85.9  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  26.05 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  26.69 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  25.63 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  27.04 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  25.42 
 
 		 323 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  27.25 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  26.46 
 
 		 339 aa  73.2  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  23.65 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  27.04 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  24.25 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  23.51 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  21.07 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  24.32 
 
 		 943 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1522  protein of unknown function DUF58  20.91 
 
 		 293 aa  54.3  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  23.13 
 
 		 276 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  25.21 
 
 		 428 aa  50.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2053  hypothetical protein  28.69 
 
 		 263 aa  47.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0403432  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  23.14 
 
 		 380 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  21.81 
 
 		 412 aa  42.7  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>