70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0938 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0695  putative lipoprotein  62.48 
 
 		 538 aa  664    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0812  hypothetical protein  75.23 
 
 		 542 aa  838    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0677  hypothetical protein  74.86 
 
 		 543 aa  816    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0593754 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0938  hypothetical protein  100 
 
 		 541 aa  1118    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00230674  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0723  hypothetical protein  75.87 
 
 		 548 aa  850    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324496  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3791  hypothetical protein  75.28 
 
 		 539 aa  831    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0672  hypothetical protein  77.32 
 
 		 551 aa  868    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.230866  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0972  hypothetical protein  98.15 
 
 		 541 aa  1102    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.216526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0792  hypothetical protein  78.11 
 
 		 549 aa  860    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56840  hypothetical protein  39.76 
 
 		 473 aa  321  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4940  hypothetical protein  39.92 
 
 		 473 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2834  hypothetical protein  39.44 
 
 		 469 aa  313  4.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0667  thiol oxidoreductase  41.44 
 
 		 480 aa  313  6.999999999999999e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27219  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0687  thiol oxidoreductase containing 2 cytochrome c heme-binding sites  38.98 
 
 		 491 aa  310  5e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0884  hypothetical protein  38.76 
 
 		 461 aa  310  5.9999999999999995e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.858351  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0642  hypothetical protein  38.95 
 
 		 503 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.798381  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2562  hypothetical protein  39.48 
 
 		 475 aa  302  9e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000435033 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003124  predicted thiol oxidoreductase  37.93 
 
 		 460 aa  301  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02714  hypothetical protein  37.83 
 
 		 443 aa  300  3e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3869  protein of unknown function DUF1111  40.73 
 
 		 471 aa  296  5e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.421634  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1785  hypothetical protein  37.05 
 
 		 462 aa  293  8e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1924  hypothetical protein  39.6 
 
 		 492 aa  291  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360714 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4314  protein of unknown function DUF1111  38.91 
 
 		 512 aa  290  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4063  hypothetical protein  37.27 
 
 		 475 aa  290  6e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0564  protein of unknown function DUF1111  39.08 
 
 		 510 aa  290  6e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0910  hypothetical protein  37.55 
 
 		 475 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0949  hypothetical protein  37.01 
 
 		 475 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3025  hypothetical protein  36.94 
 
 		 502 aa  287  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0498706  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4367  lipoprotein, putative  36.47 
 
 		 475 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4476  hypothetical protein  37.37 
 
 		 475 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236218 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1545  thiol oxidoreductase with 2 cytochrome c heme-binding sites  37.2 
 
 		 502 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1526  hypothetical protein  39.2 
 
 		 503 aa  284  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3296  hypothetical protein  39.63 
 
 		 470 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0196  hypothetical protein  37.2 
 
 		 502 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.943997  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2202  hypothetical protein  38.1 
 
 		 501 aa  281  1e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.719415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1459  hypothetical protein  37.53 
 
 		 479 aa  282  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0639282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52140  thiol oxidoreductase  37.63 
 
 		 452 aa  280  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2144  hypothetical protein  37 
 
 		 541 aa  280  5e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801721 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2085  hypothetical protein  36.44 
 
 		 560 aa  280  7e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.792023  normal  0.948616 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0978  hypothetical protein  36.53 
 
 		 475 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170128 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4577  protein of unknown function DUF1111  38.99 
 
 		 512 aa  278  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0615808 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1461  thiol oxidoreductase-like  36.82 
 
 		 418 aa  276  6e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0454641  normal  0.0102137 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1369  hypothetical protein  37.63 
 
 		 517 aa  274  4.0000000000000004e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.646546 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1803  hypothetical protein  36.38 
 
 		 562 aa  272  1e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4489  hypothetical protein  36.97 
 
 		 475 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2969  hypothetical protein  35.55 
 
 		 456 aa  269  8.999999999999999e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.594784 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2722  protein of unknown function DUF1111  39 
 
 		 427 aa  267  4e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.103047  normal  0.741688 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3528  hypothetical protein  36.07 
 
 		 517 aa  266  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.561681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37850  hypothetical protein  37.32 
 
 		 471 aa  256  6e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0692567  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0334  hypothetical protein  34.4 
 
 		 528 aa  254  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1991  hypothetical protein  35.42 
 
 		 450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2558  hypothetical protein  33.2 
 
 		 459 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0187724  hitchhiker  0.000000017904 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  34.66 
 
 		 879 aa  222  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  33.96 
 
 		 1028 aa  209  7e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1574  protein of unknown function DUF1111  43.16 
 
 		 970 aa  204  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  39.6 
 
 		 1707 aa  201  3.9999999999999996e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3195  hypothetical protein  31.11 
 
 		 421 aa  156  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.889412 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1933  protein of unknown function DUF1111  28.74 
 
 		 472 aa  145  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.242314  normal  0.0976167 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2090  protein of unknown function DUF1111  37.58 
 
 		 794 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1997  protein of unknown function DUF1111  47.8 
 
 		 737 aa  127  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107987  normal  0.248873 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0795  thiol oxidoreductase-like  28.16 
 
 		 511 aa  89.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3543  thiol oxidoreductase-like  26.44 
 
 		 519 aa  81.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00122263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6445  thiol oxidoreductase-like protein  29.06 
 
 		 564 aa  69.3  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13411  hypothetical protein  36.9 
 
 		 106 aa  57.4  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13401  hypothetical protein  60.98 
 
 		 41 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  27.22 
 
 		 333 aa  47.8  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0577  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.86 
 
 		 652 aa  47.4  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1052  hypothetical protein  28.02 
 
 		 827 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.255534 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  34.26 
 
 		 365 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  25.42 
 
 		 459 aa  45.1  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>