More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_23530 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_23530  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  100 
 
 		 893 aa  1783    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875217 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26210  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  30.58 
 
 		 919 aa  372  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.443044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  28.65 
 
 		 885 aa  346  1e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27320  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  29.7 
 
 		 888 aa  313  7.999999999999999e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0377  ABC transporter related  31.46 
 
 		 1130 aa  307  6e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.339238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  32.64 
 
 		 1090 aa  296  1e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0478  ABC transporter related  25.89 
 
 		 903 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0114283  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0236  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  30.98 
 
 		 950 aa  239  1e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3722  ABC transporter related  27.21 
 
 		 779 aa  220  8.999999999999998e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1840  peptide ABC transporter ATPase  26.87 
 
 		 779 aa  219  2e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0302017 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  36.79 
 
 		 643 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.65 
 
 		 664 aa  180  9e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01070  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.29 
 
 		 1207 aa  177  5e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1856  ABC transporter related  36.78 
 
 		 660 aa  173  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  43.6 
 
 		 266 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  41.82 
 
 		 225 aa  172  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  39.13 
 
 		 667 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  39.13 
 
 		 667 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  32.64 
 
 		 662 aa  169  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0894  ABC transporter related  43.72 
 
 		 224 aa  169  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.552759  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  48.86 
 
 		 255 aa  169  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  38.08 
 
 		 648 aa  167  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  39.33 
 
 		 682 aa  167  9e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  40 
 
 		 682 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  37.68 
 
 		 648 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  37.68 
 
 		 648 aa  167  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  41.81 
 
 		 234 aa  167  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0205  ABC transporter related  42.15 
 
 		 233 aa  167  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8051  ABC transporter-related protein  47.25 
 
 		 235 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3176  ABC transporter related  45.57 
 
 		 269 aa  166  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0415179 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  46.54 
 
 		 244 aa  166  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1629  ABC transporter related  43.03 
 
 		 315 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  44.98 
 
 		 225 aa  165  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7810  ABC transporter related  46.12 
 
 		 261 aa  165  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  44.98 
 
 		 225 aa  165  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  44.21 
 
 		 565 aa  164  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2170  ABC transporter related  47.27 
 
 		 247 aa  164  7e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  44.91 
 
 		 255 aa  164  8.000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  37.86 
 
 		 648 aa  164  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  39.27 
 
 		 220 aa  163  1e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  35.25 
 
 		 648 aa  163  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  39.92 
 
 		 249 aa  163  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  46.7 
 
 		 277 aa  163  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0829  ABC transporter related  45.37 
 
 		 245 aa  163  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.848546 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  41.01 
 
 		 252 aa  163  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2730  ABC transporter related  43.06 
 
 		 225 aa  163  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  37.46 
 
 		 648 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  41.48 
 
 		 238 aa  162  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0563  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  40.95 
 
 		 356 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  40.81 
 
 		 239 aa  162  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  39.47 
 
 		 233 aa  162  2e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  43.84 
 
 		 259 aa  162  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  44.07 
 
 		 255 aa  162  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  47.75 
 
 		 249 aa  162  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3149  ABC transporter related  44.2 
 
 		 563 aa  162  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  44.09 
 
 		 252 aa  162  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.56 
 
 		 648 aa  162  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  44.05 
 
 		 279 aa  162  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  39.73 
 
 		 233 aa  162  3e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3339  ABC transporter related  41.63 
 
 		 249 aa  161  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  36.01 
 
 		 648 aa  161  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  36.01 
 
 		 648 aa  161  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.01 
 
 		 648 aa  161  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.01 
 
 		 648 aa  161  5e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.01 
 
 		 648 aa  161  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  39.91 
 
 		 388 aa  161  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.13 
 
 		 646 aa  161  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  40.37 
 
 		 224 aa  160  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  44.04 
 
 		 248 aa  160  7e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0217  ABC transporter related protein  44.34 
 
 		 234 aa  160  8e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.941766  normal  0.16938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  42.6 
 
 		 252 aa  160  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 		 224 aa  160  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 		 224 aa  160  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  40.35 
 
 		 260 aa  160  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1610  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.45 
 
 		 368 aa  160  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  35.27 
 
 		 648 aa  160  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  39.91 
 
 		 224 aa  160  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  35.27 
 
 		 648 aa  160  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1377  ABC transporter related  44.95 
 
 		 232 aa  160  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.757456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  44.34 
 
 		 291 aa  160  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 		 224 aa  160  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  37.77 
 
 		 241 aa  160  1e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  44.81 
 
 		 232 aa  159  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.92 
 
 		 648 aa  160  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4805  ABC transporter related  43.61 
 
 		 245 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  40 
 
 		 234 aa  159  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2966  ABC transporter-like protein  43.38 
 
 		 234 aa  159  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 		 228 aa  159  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2113  ABC transporter related  40.27 
 
 		 240 aa  159  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000000136112  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  35.84 
 
 		 648 aa  159  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  40.85 
 
 		 237 aa  159  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  39.45 
 
 		 224 aa  159  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  39.45 
 
 		 224 aa  159  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  39.45 
 
 		 224 aa  159  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1614  ABC transporter related  47.83 
 
 		 244 aa  158  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.045401 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  31.96 
 
 		 653 aa  159  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  42.13 
 
 		 221 aa  159  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  38.99 
 
 		 224 aa  159  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1176  ABC transporter related  42.11 
 
 		 235 aa  159  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000377551 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  41.01 
 
 		 221 aa  159  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>