More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_03390 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_03390  transposase  100 
 
 		 494 aa  1019    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1802  transposase  50.77 
 
 		 464 aa  439  9.999999999999999e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.716345  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1643  transposase  41.13 
 
 		 493 aa  353  5e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.432337  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1657  transposase  41.13 
 
 		 493 aa  353  5e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0995  transposase  41.74 
 
 		 500 aa  316  6e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1412  transposase  41.29 
 
 		 507 aa  315  9.999999999999999e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1799  transposase  41.52 
 
 		 507 aa  315  9.999999999999999e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.161181  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0823  hypothetical protein  38.27 
 
 		 504 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1995  hypothetical protein  38.27 
 
 		 504 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1659  transposase  50.32 
 
 		 323 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0028  transposase  51.56 
 
 		 309 aa  294  2e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.355464  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0314  transposase  51.56 
 
 		 309 aa  294  2e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00173653  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0706  transposase  51.21 
 
 		 309 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.642121  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2749  hypothetical protein  35.56 
 
 		 501 aa  281  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.596289  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0024  transposase (25)  33.55 
 
 		 501 aa  241  2.9999999999999997e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0619695  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0485  transposase (25)  33.55 
 
 		 501 aa  241  2.9999999999999997e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1288  transposase (25)  33.55 
 
 		 501 aa  241  2.9999999999999997e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.540829  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2218  transposase (25)  33.55 
 
 		 501 aa  241  2.9999999999999997e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2200  hypothetical protein  37.5 
 
 		 334 aa  205  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1016  IstA2  31.01 
 
 		 499 aa  194  3e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1175  IstA2  31.01 
 
 		 499 aa  194  3e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0070794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1501  IstA2  31.01 
 
 		 499 aa  194  3e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0307163  hitchhiker  0.000409094 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4458  transposase  32.03 
 
 		 442 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000107543  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2004  transposase  30.34 
 
 		 494 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2198  transposase  30.34 
 
 		 494 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2294  transposase  30.34 
 
 		 494 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2831  transposase  30.34 
 
 		 494 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2738  Integrase catalytic region  33.53 
 
 		 501 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4983  transposase  29.37 
 
 		 497 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3264  transposase  34.08 
 
 		 509 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354242  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4958  transposase  29.37 
 
 		 502 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3067  hypothetical protein  32.53 
 
 		 501 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1227  Integrase catalytic region  31.3 
 
 		 497 aa  151  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3226  transposase  31.39 
 
 		 565 aa  149  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1871  transposase  31.39 
 
 		 565 aa  149  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3017  transposase  31.39 
 
 		 565 aa  149  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0221  transposase  31.39 
 
 		 565 aa  149  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113746  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0704  integrase catalytic region  27.05 
 
 		 498 aa  146  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275152  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0683  transposase  27.35 
 
 		 504 aa  144  3e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1780  transposase  31.42 
 
 		 558 aa  141  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.466747  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0417  integrase catalytic subunit  29.6 
 
 		 509 aa  139  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1251  integrase catalytic subunit  29.6 
 
 		 509 aa  139  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.539956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0707  hypothetical protein  50.68 
 
 		 155 aa  139  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0484002  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1656  hypothetical protein  50.68 
 
 		 155 aa  139  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0315  hypothetical protein  50 
 
 		 155 aa  134  3e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.237775  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0027  hypothetical protein  50 
 
 		 155 aa  134  3e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.15559  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0300  transposase  25.92 
 
 		 529 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5335  IstA2  33.09 
 
 		 534 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3045  IstA2  33.09 
 
 		 534 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000242102  hitchhiker  0.00242323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2079  IstA2  33.09 
 
 		 534 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  hitchhiker  0.00457727 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1791  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 507 aa  129  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1639  IS21 family transposase  27.2 
 
 		 505 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0683  IS21 family transposase  27.2 
 
 		 505 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0315  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 507 aa  129  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.0795408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2677  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 507 aa  129  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3403  IS21 family transposase  27.2 
 
 		 505 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3044  IS21 family transposase  27.2 
 
 		 505 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0675  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 507 aa  129  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.275744  hitchhiker  0.000336572 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4688  Integrase catalytic region  24.9 
 
 		 508 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0458  transposase  29.63 
 
 		 584 aa  126  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1042  Integrase catalytic region  24.9 
 
 		 508 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861303  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0648  Integrase catalytic region  32.97 
 
 		 488 aa  124  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.509934 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2556  integrase catalytic subunit  28.3 
 
 		 501 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2899  integrase catalytic subunit  28.3 
 
 		 501 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4866  integrase catalytic subunit  28.3 
 
 		 501 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4956  integrase catalytic subunit  28.3 
 
 		 501 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0004  integrase catalytic subunit  28.3 
 
 		 501 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3204  integrase catalytic subunit  28.3 
 
 		 501 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3299  integrase catalytic subunit  28.3 
 
 		 501 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0130  transposase  27.38 
 
 		 502 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5400  integrase catalytic region  29.6 
 
 		 502 aa  120  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2255  integrase catalytic region  29.6 
 
 		 502 aa  120  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.659658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4173  integrase catalytic region  29.6 
 
 		 502 aa  120  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2875  integrase catalytic subunit  29.66 
 
 		 506 aa  120  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853486  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2954  hypothetical protein  44.83 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0155  transposase IstA for insertion sequence IS1326  25.23 
 
 		 507 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.791462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3235  integrase catalytic subunit  29.27 
 
 		 508 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4517  IstA2  29.02 
 
 		 555 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0041  Integrase catalytic region  29.07 
 
 		 501 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.456904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0483  integrase catalytic subunit  26.03 
 
 		 508 aa  118  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3365  integrase catalytic subunit  26.03 
 
 		 508 aa  118  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3173  Integrase catalytic region  27.78 
 
 		 496 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5139  hypothetical protein  27.78 
 
 		 468 aa  116  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235994  normal  0.315254 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2530  IstA2  28.86 
 
 		 539 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000787231  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2866  Integrase catalytic region  27.79 
 
 		 503 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00185303  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3053  integrase catalytic subunit  28.9 
 
 		 501 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2463  integrase catalytic subunit  28.9 
 
 		 501 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.587911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3483  integrase catalytic subunit  28.9 
 
 		 501 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3390  integrase catalytic subunit  28.9 
 
 		 501 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0908  integrase catalytic subunit  28.9 
 
 		 501 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5130  integrase catalytic subunit  28.9 
 
 		 501 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.819554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5140  integrase catalytic subunit  28.9 
 
 		 501 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.920886  normal  0.438385 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3656  IstA2  28.95 
 
 		 556 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.165396 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1070  Integrase catalytic region  27.29 
 
 		 496 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.47791  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2408  Integrase catalytic region  27.29 
 
 		 496 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3923  integrase catalytic subunit  27.94 
 
 		 499 aa  111  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6519  integrase catalytic region  27 
 
 		 499 aa  110  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126482 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3045  integrase catalytic subunit  27.81 
 
 		 499 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3056  integrase catalytic subunit  27.81 
 
 		 499 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.278904 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1436  Integrase catalytic region  27.48 
 
 		 504 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>