More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3430 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
184 aa  372  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  56.98 
 
 
181 aa  220  7e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  55.87 
 
 
187 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  55.87 
 
 
187 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  55.87 
 
 
181 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  54.19 
 
 
187 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  54.19 
 
 
187 aa  217  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  54.19 
 
 
187 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  54.19 
 
 
187 aa  216  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  53.63 
 
 
187 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  53.63 
 
 
181 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  53.63 
 
 
181 aa  208  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  54.4 
 
 
187 aa  206  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  51.1 
 
 
186 aa  199  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  52 
 
 
193 aa  197  7e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  49.72 
 
 
185 aa  192  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  50.28 
 
 
185 aa  192  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  50.29 
 
 
193 aa  191  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  54.02 
 
 
199 aa  189  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  44.2 
 
 
181 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  47.75 
 
 
182 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  45 
 
 
210 aa  154  7e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  44.97 
 
 
182 aa  150  8.999999999999999e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  47.73 
 
 
184 aa  149  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  42.46 
 
 
181 aa  145  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  41.44 
 
 
182 aa  144  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  46.89 
 
 
182 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  40 
 
 
180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  48.5 
 
 
190 aa  136  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  39.77 
 
 
181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  46.89 
 
 
182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  46.33 
 
 
182 aa  131  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  44.94 
 
 
182 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  36.87 
 
 
207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0384  isochorismatase hydrolase  37.08 
 
 
313 aa  124  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  43.09 
 
 
223 aa  122  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0771  isochorismatase family protein  39.58 
 
 
316 aa  119  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1247  isochorismatase hydrolase  45.45 
 
 
190 aa  118  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.127255  normal  0.527652 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  41.24 
 
 
198 aa  117  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0235  isochorismatase hydrolase  36.87 
 
 
316 aa  118  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.809907 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  41.24 
 
 
200 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  36.93 
 
 
196 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  36.93 
 
 
196 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  36.93 
 
 
196 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  35.8 
 
 
196 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 
201 aa  105  5e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  38.25 
 
 
190 aa  104  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 
201 aa  100  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5247  isochorismatase hydrolase  41.48 
 
 
196 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  33.7 
 
 
182 aa  99  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  36.16 
 
 
202 aa  97.4  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  32.24 
 
 
342 aa  97.4  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4420  isochorismatase hydrolase  42.08 
 
 
199 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  40.11 
 
 
199 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3001  isochorismatase hydrolase  35.45 
 
 
185 aa  96.3  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439517  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  39.55 
 
 
199 aa  95.5  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  32.8 
 
 
185 aa  94.7  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  38.24 
 
 
199 aa  94.7  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  39.01 
 
 
199 aa  94.7  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  39.01 
 
 
199 aa  94.7  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  39.01 
 
 
199 aa  94.7  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  36.52 
 
 
203 aa  93.6  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  34.88 
 
 
218 aa  94  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  32 
 
 
196 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  35.03 
 
 
203 aa  91.7  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3945  isochorismatase hydrolase  42.97 
 
 
200 aa  91.3  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  33.53 
 
 
198 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  32.94 
 
 
228 aa  91.3  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  37.16 
 
 
193 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  33.15 
 
 
359 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  32.58 
 
 
196 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  32.61 
 
 
184 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
203 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  33.7 
 
 
185 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  35.06 
 
 
198 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  36.61 
 
 
193 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  33.7 
 
 
184 aa  89.4  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23720  Isochorismatase hydrolase protein  35.2 
 
 
197 aa  89  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  33.71 
 
 
203 aa  89.4  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  33.7 
 
 
184 aa  89.4  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  37.36 
 
 
191 aa  89  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 
187 aa  89.4  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  32.77 
 
 
211 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  32.77 
 
 
211 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2098  isochorismatase family protein  35.14 
 
 
188 aa  89  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  33.9 
 
 
289 aa  88.6  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  33.15 
 
 
184 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  30.59 
 
 
231 aa  88.6  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  30.59 
 
 
231 aa  88.2  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  30.59 
 
 
231 aa  88.2  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  31.11 
 
 
216 aa  88.2  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  33.71 
 
 
176 aa  87.8  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  33.15 
 
 
176 aa  87  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 
196 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  34.25 
 
 
184 aa  87  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0688  isochorismatase hydrolase  34.3 
 
 
184 aa  87  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870626  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  33.15 
 
 
176 aa  87  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  33.15 
 
 
176 aa  87  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  32.78 
 
 
184 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  32.58 
 
 
359 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>