More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1796 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1796  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  100 
 
 
135 aa  283  4e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.461798  normal  0.880254 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2946  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  66.67 
 
 
135 aa  203  7e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.750797  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2790  molybdopterin oxidoreductase  58.27 
 
 
668 aa  167  7e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2799  molybdopterin oxidoreductase  58.27 
 
 
668 aa  167  7e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0785  NADH dehydrogenase I chain G  58.65 
 
 
353 aa  164  5e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  56.72 
 
 
893 aa  162  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  52.59 
 
 
745 aa  162  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  55.22 
 
 
676 aa  159  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  54.48 
 
 
676 aa  157  5e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  53.73 
 
 
677 aa  157  5e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0472  formate dehydrogenase-like protein  57.58 
 
 
133 aa  155  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  54.48 
 
 
676 aa  156  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.63 
 
 
893 aa  155  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.63 
 
 
900 aa  154  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  56.3 
 
 
686 aa  154  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  54.26 
 
 
893 aa  154  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  54.81 
 
 
674 aa  154  6e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  53.33 
 
 
674 aa  153  9e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  53.03 
 
 
688 aa  152  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1831  NADH dehydrogenase I chain G  52.63 
 
 
363 aa  152  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.59 
 
 
688 aa  152  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.59 
 
 
688 aa  152  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  53.33 
 
 
674 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4642  formate dehydrogenase, alpha subunit  53.91 
 
 
886 aa  149  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0800652  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3566  formate dehydrogenase, alpha subunit  53.91 
 
 
886 aa  149  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0757584 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.11 
 
 
674 aa  148  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.59 
 
 
687 aa  148  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2705  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  54.07 
 
 
355 aa  149  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.11 
 
 
688 aa  146  7e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  52.59 
 
 
695 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  53.73 
 
 
879 aa  145  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.35 
 
 
1421 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.74 
 
 
1410 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.82 
 
 
906 aa  144  6e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  53.73 
 
 
886 aa  143  8.000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.47 
 
 
1428 aa  143  9e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.06 
 
 
917 aa  142  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.49 
 
 
898 aa  142  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0843  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.38 
 
 
994 aa  142  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0845  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  49.25 
 
 
376 aa  142  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1029  NADH dehydrogenase I chain G  51.94 
 
 
358 aa  141  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.24 
 
 
900 aa  141  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.38 
 
 
668 aa  141  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  49.25 
 
 
689 aa  142  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4523  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.34 
 
 
886 aa  141  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.195662  normal  0.224956 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4391  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.34 
 
 
886 aa  141  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.410335  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1925  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.39 
 
 
986 aa  140  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.63 
 
 
686 aa  140  7e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  47.83 
 
 
899 aa  140  8e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  53.08 
 
 
1406 aa  140  8e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  53.08 
 
 
1426 aa  139  9e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.25 
 
 
1440 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0030  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  46.62 
 
 
359 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00062453  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  53.12 
 
 
904 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.73 
 
 
685 aa  137  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  49.63 
 
 
687 aa  137  6e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.27 
 
 
689 aa  136  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1856  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  47.76 
 
 
351 aa  135  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.01 
 
 
905 aa  136  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3660  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.73 
 
 
888 aa  135  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  48.15 
 
 
1387 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.18 
 
 
1440 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.51 
 
 
901 aa  133  7.000000000000001e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4160  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.76 
 
 
1110 aa  133  8e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.129392  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.25 
 
 
724 aa  133  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1544  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  48.85 
 
 
374 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  47.41 
 
 
1412 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0557  molybdopterin oxidoreductase family protein  47.24 
 
 
978 aa  130  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0499  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  47.24 
 
 
978 aa  130  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0589  molybdopterin oxidoreductase family protein  47.24 
 
 
978 aa  130  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0645  molybdopterin oxidoreductase family protein  47.24 
 
 
978 aa  130  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.293395 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1636  molybdopterin oxidoreductase family protein  45.67 
 
 
979 aa  130  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.632493  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0505  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.04 
 
 
980 aa  130  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3588  molybdopterin oxidoreductase family protein  45.67 
 
 
1012 aa  130  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  50 
 
 
1424 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3598  molybdopterin oxidoreductase family protein  45.67 
 
 
979 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3681  molybdopterin oxidoreductase family protein  45.67 
 
 
979 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.725199  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.74 
 
 
1432 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0655  molybdopterin oxidoreductase family protein  46.46 
 
 
978 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3367  molybdopterin oxidoreductase family protein  44.88 
 
 
979 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3331  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.88 
 
 
979 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.291632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0501  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  46.46 
 
 
978 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3631  molybdopterin oxidoreductase family protein  44.88 
 
 
979 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461158  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1833  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.04 
 
 
687 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00515495  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1318  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.11 
 
 
973 aa  129  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.65 
 
 
1425 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.65 
 
 
1425 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0201  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 subunit  47.45 
 
 
140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2333  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.04 
 
 
984 aa  129  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0716  molybdopterin oxidoreductase family protein  46.46 
 
 
978 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.74 
 
 
1432 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2376  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.04 
 
 
984 aa  129  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.74 
 
 
1432 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3281  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.88 
 
 
979 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0502  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.46 
 
 
980 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3581  molybdopterin oxidoreductase family protein  44.88 
 
 
979 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0627  molybdopterin oxidoreductase family protein  46.46 
 
 
978 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4710  molybdopterin oxidoreductase family protein  46.46 
 
 
978 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.65 
 
 
1425 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2746  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.03 
 
 
1004 aa  128  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>