More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1612 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  42.41 
 
 		 928 aa  693    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  42.41 
 
 		 928 aa  693    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  39.84 
 
 		 903 aa  643    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  46.56 
 
 		 891 aa  771    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  43.91 
 
 		 915 aa  699    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  41.43 
 
 		 926 aa  655    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1637  DNA polymerase I  40.06 
 
 		 936 aa  637    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  38.91 
 
 		 876 aa  635    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  45.26 
 
 		 906 aa  707    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2546  DNA polymerase I  42.33 
 
 		 923 aa  665    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.809446  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2230  DNA polymerase I  43.19 
 
 		 946 aa  700    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  40.69 
 
 		 877 aa  661    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  42.3 
 
 		 976 aa  687    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1478  DNA polymerase I  41.84 
 
 		 941 aa  666    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.495398 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3714  DNA polymerase I  41.68 
 
 		 930 aa  657    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250516  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  42.48 
 
 		 979 aa  694    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4669  DNA polymerase I  42.5 
 
 		 922 aa  677    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0344  DNA polymerase I  42.02 
 
 		 925 aa  663    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  40.58 
 
 		 891 aa  660    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  40.58 
 
 		 891 aa  660    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  40.47 
 
 		 891 aa  661    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0319  DNA polymerase I  42.19 
 
 		 926 aa  664    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  42.52 
 
 		 896 aa  691    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  42.3 
 
 		 896 aa  690    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0270  DNA polymerase I  41.91 
 
 		 921 aa  660    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  43.69 
 
 		 915 aa  693    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0163  DNA polymerase A  42.59 
 
 		 906 aa  671    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  42.38 
 
 		 938 aa  699    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  43.57 
 
 		 904 aa  682    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  41.74 
 
 		 941 aa  681    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  41.48 
 
 		 943 aa  656    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2453  DNA polymerase I  42.26 
 
 		 907 aa  638    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  38.91 
 
 		 876 aa  635    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1500  DNA polymerase I  42.19 
 
 		 926 aa  664    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530484  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0851  DNA polymerase I  42.44 
 
 		 923 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  43.38 
 
 		 903 aa  709    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0056  DNA polymerase I  43.62 
 
 		 935 aa  673    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1028  DNA polymerase I  41.21 
 
 		 937 aa  642    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447207  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  48.5 
 
 		 891 aa  814    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2218  DNA polymerase I  42.08 
 
 		 917 aa  638    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  41.38 
 
 		 945 aa  647    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0179  DNA polymerase A  40.49 
 
 		 924 aa  641    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  42.12 
 
 		 923 aa  687    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  46.5 
 
 		 892 aa  756    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  39.87 
 
 		 939 aa  670    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  40.58 
 
 		 877 aa  659    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  43 
 
 		 908 aa  689    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2689  DNA polymerase I  41.21 
 
 		 937 aa  642    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.26219 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  41.95 
 
 		 922 aa  679    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  42.75 
 
 		 905 aa  683    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3514  DNA polymerase A  43.16 
 
 		 924 aa  637    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  42.01 
 
 		 885 aa  643    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0605  DNA polymerase I  42.19 
 
 		 926 aa  664    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.503998  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  43.11 
 
 		 897 aa  644    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1841  DNA polymerase I  41.2 
 
 		 936 aa  642    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721717  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0278  DNA polymerase I  41.73 
 
 		 945 aa  637    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  42.03 
 
 		 916 aa  682    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1325  DNA polymerase I  40.99 
 
 		 957 aa  642    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  43.1 
 
 		 926 aa  717    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  43.45 
 
 		 910 aa  691    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1729  DNA polymerase I  41.64 
 
 		 944 aa  657    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2834  DNA polymerase I  42.28 
 
 		 913 aa  639    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3620  DNA polymerase I  42.54 
 
 		 921 aa  689    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00307404  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  44.06 
 
 		 928 aa  705    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  42.52 
 
 		 978 aa  694    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0154  DNA polymerase I  43.63 
 
 		 931 aa  691    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2624  DNA polymerase I  42.8 
 
 		 934 aa  686    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.972131  normal  0.775806 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  40.47 
 
 		 894 aa  676    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  40.55 
 
 		 890 aa  653    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  43.61 
 
 		 917 aa  676    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1930  DNA polymerase I  42.63 
 
 		 927 aa  664    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173956  normal  0.0298694 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1696  DNA polymerase I  42.19 
 
 		 926 aa  664    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  41.59 
 
 		 928 aa  692    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3945  DNA polymerase I  42.05 
 
 		 978 aa  651    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0200  DNA polymerase I  41 
 
 		 937 aa  640    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  43.36 
 
 		 893 aa  682    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  46.29 
 
 		 892 aa  781    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  41.33 
 
 		 951 aa  697    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3905  DNA polymerase I  42.5 
 
 		 922 aa  684    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001632  normal  0.292845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3997  DNA polymerase I  42.39 
 
 		 922 aa  681    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00125715  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  42.75 
 
 		 912 aa  699    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  42.46 
 
 		 918 aa  681    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  40.31 
 
 		 866 aa  645    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  41.04 
 
 		 928 aa  655    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3243  DNA polymerase I  42.34 
 
 		 917 aa  637    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0154529 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  43.36 
 
 		 913 aa  671    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3317  DNA polymerase I  42.21 
 
 		 922 aa  656    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397865  normal  0.106648 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0353  DNA polymerase I  42.19 
 
 		 926 aa  664    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  41.54 
 
 		 930 aa  684    Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2403  DNA polymerase I  42.33 
 
 		 923 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  41.9 
 
 		 883 aa  669    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  42.56 
 
 		 935 aa  681    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  100 
 
 		 902 aa  1837    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  44.99 
 
 		 911 aa  748    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  42.61 
 
 		 922 aa  686    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1148  DNA-directed DNA polymerase  41.91 
 
 		 937 aa  649    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  0.433626 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  42.98 
 
 		 921 aa  683    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  46.05 
 
 		 893 aa  745    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  42.49 
 
 		 946 aa  693    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  40.73 
 
 		 934 aa  689    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>