288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0188 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 360 aa  731    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  29.44 
 
 		 362 aa  189  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  30.64 
 
 		 359 aa  188  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  27.27 
 
 		 358 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  26.42 
 
 		 359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  30.25 
 
 		 359 aa  162  9e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  28.29 
 
 		 359 aa  157  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  27.68 
 
 		 360 aa  155  9e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  27.73 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  29.41 
 
 		 792 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  25.14 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  26.58 
 
 		 358 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  23.97 
 
 		 360 aa  126  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  24.8 
 
 		 387 aa  124  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  25.97 
 
 		 371 aa  123  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  23.96 
 
 		 356 aa  122  7e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  23.53 
 
 		 360 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  26.84 
 
 		 356 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  25.63 
 
 		 359 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1424  permease YjgP/YjgQ family protein  24.86 
 
 		 360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  22.65 
 
 		 365 aa  112  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  24.93 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  25.07 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1803  permease YjgP/YjgQ family protein  26.74 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1395  permease YjgP/YjgQ family protein  27.25 
 
 		 360 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4195  permease YjgP/YjgQ family protein  27.68 
 
 		 358 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1491  permease YjgP/YjgQ family protein  26.97 
 
 		 360 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269853  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  24.72 
 
 		 359 aa  103  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2464  permease YjgP/YjgQ  26.4 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0984614  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  20.81 
 
 		 360 aa  100  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1429  permease YjgP/YjgQ family protein  24.61 
 
 		 367 aa  98.2  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398459  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  22.1 
 
 		 434 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  22.28 
 
 		 359 aa  96.7  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2837  permease YjgP/YjgQ family protein  24.71 
 
 		 364 aa  97.1  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240939  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2956  permease YjgP/YjgQ family protein  23.69 
 
 		 358 aa  96.3  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199366  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0027  permease YjgP/YjgQ family protein  22.22 
 
 		 357 aa  95.5  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  23.87 
 
 		 391 aa  94.4  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  23.54 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  21.33 
 
 		 360 aa  94.4  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  22.31 
 
 		 394 aa  94  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0375  permease YjgP/YjgQ family protein  23.76 
 
 		 361 aa  94  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0887769 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  21.49 
 
 		 362 aa  93.2  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1403  permease YjgP/YjgQ family protein  27.48 
 
 		 360 aa  92.8  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1141  putative permease  21.69 
 
 		 355 aa  92.8  8e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  21.28 
 
 		 395 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  24.34 
 
 		 400 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3339  permease YjgP/YjgQ family protein  23.65 
 
 		 363 aa  91.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465141 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  23.35 
 
 		 358 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  22.88 
 
 		 352 aa  90.9  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  22.07 
 
 		 361 aa  90.5  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  21.01 
 
 		 395 aa  89.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  21.58 
 
 		 401 aa  90.1  6e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  20.54 
 
 		 392 aa  89.7  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0876  hypothetical membrane spanning protein  21.41 
 
 		 355 aa  88.2  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  23.1 
 
 		 355 aa  87  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  21.93 
 
 		 401 aa  87  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  21.98 
 
 		 374 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  23.03 
 
 		 353 aa  87  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5099  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 362 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.624296  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  20.17 
 
 		 357 aa  85.9  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  19.33 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6917  permease YjgP/YjgQ family protein  20.26 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  normal  0.723746 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  22.34 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0106  permease YjgP/YjgQ family protein  21.08 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1678  permease YjgP/YjgQ  23.5 
 
 		 365 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.626554 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  25.06 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  21.93 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  24.72 
 
 		 364 aa  83.6  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  24.17 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  0.00000329056 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  21.61 
 
 		 386 aa  83.2  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  22.38 
 
 		 370 aa  83.2  0.000000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2222  permease YjgP/YjgQ family protein  23.99 
 
 		 361 aa  83.2  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.225398 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 389 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5837  permease YjgP/YjgQ family protein  23.55 
 
 		 362 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0941  permease YjgP/YjgQ family protein  22.84 
 
 		 352 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00480022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  23.62 
 
 		 364 aa  81.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  22.95 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  23.32 
 
 		 423 aa  80.9  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00860  hypothetical protein  23.27 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  20.94 
 
 		 1040 aa  80.1  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2685  permease YjgP/YjgQ  22.38 
 
 		 383 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283535  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  23.45 
 
 		 357 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02662  putative permease, YjgP/YjgQ family  25.35 
 
 		 368 aa  79.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  22.28 
 
 		 1061 aa  78.2  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  22.32 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  22.01 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0397  permease YjgP/YjgQ family protein  22.51 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0180892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1510  permease YjgP/YjgQ family protein  22.77 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161428 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  22.03 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2341  permease YjgP/YjgQ  22.66 
 
 		 365 aa  76.3  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231587  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3260  permease YjgP/YjgQ family protein  21.19 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000329017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  22.55 
 
 		 384 aa  76.3  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3117  permease YjgP/YjgQ family protein  21.19 
 
 		 352 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000809981  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3107  permease YjgP/YjgQ family protein  21.19 
 
 		 352 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000202116  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  24.4 
 
 		 418 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  21.61 
 
 		 1061 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1259  permease YjgP/YjgQ family protein  21.19 
 
 		 352 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0237317  hitchhiker  0.000314396 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  22.53 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2825  permease YjgP/YjgQ family protein  21.57 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0282438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2907  permease YjgP/YjgQ family protein  21.57 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000245216  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>