93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2743 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2743  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter MnhD subunit-like protein  100 
 
 		 433 aa  856    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1399  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter MnhD subunit-like protein  63.46 
 
 		 437 aa  487  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1279  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.21 
 
 		 565 aa  117  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2661  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.65 
 
 		 556 aa  82.4  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1023  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30 
 
 		 555 aa  81.3  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.057602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01540  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  29.07 
 
 		 587 aa  79  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0999  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.2 
 
 		 574 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0811  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.84 
 
 		 558 aa  62.8  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.65371  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1581  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.78 
 
 		 563 aa  60.5  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4288  NADH dehydrogenase (quinone)  26.5 
 
 		 637 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277072  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0790  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  25.09 
 
 		 500 aa  55.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1205  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.82 
 
 		 471 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425489  normal  0.0100074 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3855  hydrogenase 4 subunit B  31.64 
 
 		 672 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1287  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.57 
 
 		 576 aa  54.7  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.592615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1691  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  24.14 
 
 		 688 aa  55.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000143823  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1356  NADH dehydrogenase subunit N  25.4 
 
 		 490 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00252031  normal  0.0117379 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1000  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  26.78 
 
 		 507 aa  53.9  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.827251 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5079  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.33 
 
 		 551 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.793582 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5154  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.33 
 
 		 534 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4614  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.33 
 
 		 561 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.354108  hitchhiker  0.00768927 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2808  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  35.07 
 
 		 539 aa  52.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.333483 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3201  NADH dehydrogenase subunit N  26 
 
 		 490 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319113  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1731  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  26.92 
 
 		 505 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.494392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  24.29 
 
 		 473 aa  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11070  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.82 
 
 		 556 aa  52.4  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1398  NADH dehydrogenase (quinone)  30.94 
 
 		 498 aa  52.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3695  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  26.59 
 
 		 782 aa  51.6  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.983526 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2288  NADH dehydrogenase (quinone)  23.47 
 
 		 488 aa  50.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2742  NADH dehydrogenase (quinone)  30.3 
 
 		 497 aa  50.4  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0891  NADH dehydrogenase (quinone)  22.7 
 
 		 493 aa  50.1  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.158004  normal  0.070736 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0890  NADH dehydrogenase subunit M  20.58 
 
 		 613 aa  50.4  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.514114  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  28.63 
 
 		 500 aa  50.1  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30370  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 4 (chain M)  30.47 
 
 		 470 aa  50.1  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4731  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.05 
 
 		 598 aa  49.3  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840154 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0751  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28 
 
 		 542 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0375  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  26.67 
 
 		 669 aa  49.7  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.044448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0892  NADH dehydrogenase (quinone)  25.44 
 
 		 669 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1038  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  27.94 
 
 		 544 aa  48.5  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0466413 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1260  hydrogenase 4 subunit B  29.94 
 
 		 672 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0751084 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1589  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.08 
 
 		 554 aa  48.9  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1041  NADH dehydrogenase subunit N  28.49 
 
 		 491 aa  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327315 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2865  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.46 
 
 		 588 aa  48.5  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.643493  normal  0.225438 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0671  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  24.81 
 
 		 525 aa  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3816  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.89 
 
 		 505 aa  47.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19533  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1280  NADH dehydrogenase (quinone)  26.32 
 
 		 499 aa  47.8  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2586  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  23.13 
 
 		 522 aa  47  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  27.47 
 
 		 554 aa  46.6  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1217  NADH dehydrogenase subunit M  24.81 
 
 		 614 aa  46.2  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0943  NADH dehydrogenase (quinone)  27.93 
 
 		 723 aa  45.8  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.730208  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3713  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.81 
 
 		 540 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0640  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  24.42 
 
 		 534 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1635  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  24.42 
 
 		 534 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.515485  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5266  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.74 
 
 		 543 aa  46.6  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3181  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  24.42 
 
 		 534 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3447  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.81 
 
 		 540 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.471673 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1603  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.83 
 
 		 568 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0753  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  21.16 
 
 		 592 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3145  NADH dehydrogenase (quinone)  27.82 
 
 		 462 aa  45.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0694322  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2474  hydrogenase 4 subunit B  26.19 
 
 		 669 aa  45.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1996  NADH dehydrogenase subunit N  25.42 
 
 		 492 aa  45.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638246  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3512  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.88 
 
 		 559 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.523861  hitchhiker  0.00169463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3130  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.54 
 
 		 544 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0563  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase family protein  27.53 
 
 		 475 aa  45.8  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1851  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.61 
 
 		 559 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.059579 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4493  NADH dehydrogenase subunit M  25.87 
 
 		 511 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.803352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1285  hydrogenase 4 subunit B  23.53 
 
 		 673 aa  45.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.488809  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1632  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  22.65 
 
 		 565 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5564  NADH dehydrogenase subunit N  28.65 
 
 		 489 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2228  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.88 
 
 		 559 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1624  NADH dehydrogenase subunit N  26.29 
 
 		 488 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2236  NADH dehydrogenase subunit N  26.29 
 
 		 488 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2260  NADH dehydrogenase subunit N  26.29 
 
 		 488 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.664069 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2153  NADH dehydrogenase subunit N  25.96 
 
 		 488 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175496  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3628  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.42 
 
 		 487 aa  44.3  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0929  hydrogenase 4 subunit B  29.07 
 
 		 687 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3948  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  26.4 
 
 		 545 aa  44.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.147624 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2102  NADH dehydrogenase (quinone)  25.08 
 
 		 793 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2274  NADH dehydrogenase subunit N  28.31 
 
 		 488 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3623  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.25 
 
 		 539 aa  44.3  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0168629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0772  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  24.71 
 
 		 496 aa  43.9  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.256181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1357  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  25.75 
 
 		 688 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592157  normal  0.205396 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1074  NADH dehydrogenase subunit N  25 
 
 		 485 aa  43.9  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1321  hydrogenase membrane subunit  26.42 
 
 		 644 aa  43.9  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1336  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  26.01 
 
 		 690 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4506  NADH dehydrogenase (quinone)  28.1 
 
 		 1265 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105233 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5412  NADH dehydrogenase subunit M  25.77 
 
 		 500 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4834  NADH dehydrogenase (quinone)  28.77 
 
 		 585 aa  43.5  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0400  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  25.13 
 
 		 768 aa  43.5  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2656  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32 
 
 		 535 aa  43.5  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0955  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  25.61 
 
 		 523 aa  43.1  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00424687  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0714  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  28.4 
 
 		 496 aa  43.1  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0167768  decreased coverage  0.000183119 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1775  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  25.13 
 
 		 768 aa  43.1  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.671135  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3312  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.5 
 
 		 559 aa  43.1  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>