77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2510 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2510  tetraheme cytochrome c  100 
 
 		 122 aa  254  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3370  tetraheme cytochrome c  35.77 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.656549  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0342  tetraheme cytochrome c  37.6 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2279  tetraheme cytochrome c  40.19 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0855381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4179  tetraheme cytochrome c  37.39 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.717177 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0274  tetraheme cytochrome c  36.04 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3535  tetraheme cytochrome c  38.98 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2430  tetraheme cytochrome c  36.44 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.439789  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3056  tetraheme cytochrome c  36.67 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1491  tetraheme cytochrome c  32.54 
 
 		 127 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3623  tetraheme cytochrome c  36.97 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0276  tetraheme cytochrome c  37.93 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2402  tetraheme cytochrome c, putative  40.7 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3938  tetraheme cytochrome c  37.5 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2152  tetraheme cytochrome c  37.84 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738839  normal  0.0741814 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2229  tetraheme cytochrome c  36.7 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  34.15 
 
 		 589 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3300  cytochrome c  37.1 
 
 		 126 aa  67  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0339  cytochrome c  37.17 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  34.4 
 
 		 588 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0257  tetraheme cytochrome c  47.37 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3896  tetraheme cytochrome c  42.17 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486536  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0509  tetraheme cytochrome c  41.67 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0255  tetraheme cytochrome c  40.59 
 
 		 101 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  32.65 
 
 		 589 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  38.37 
 
 		 596 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  26.61 
 
 		 596 aa  60.5  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  32.2 
 
 		 589 aa  60.5  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  40.7 
 
 		 598 aa  60.1  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  29.6 
 
 		 596 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1781  hypothetical protein  37.38 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.531778  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  39.53 
 
 		 598 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1158  hypothetical protein  31.58 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2535  tetraheme cytochrome c, putative  30.33 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.091656  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0946  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  32.76 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  28.33 
 
 		 596 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  34.74 
 
 		 591 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1860  hypothetical protein  36.45 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  32.23 
 
 		 596 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  32.23 
 
 		 596 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  32.23 
 
 		 596 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  32.23 
 
 		 596 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3693  hypothetical protein  33.61 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.799168  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1004  hypothetical protein  34.41 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  31.4 
 
 		 597 aa  57  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2097  hypothetical protein  34.29 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206741  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  31.4 
 
 		 596 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  31.4 
 
 		 596 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  31.4 
 
 		 596 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0297  flavocytochrome c  33.33 
 
 		 112 aa  57  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000730502 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  31.4 
 
 		 596 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4185  tetraheme cytochrome c, putative  36.59 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.17754 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  27.78 
 
 		 583 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3769  hypothetical protein  36.26 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0300  tetraheme cytochrome c, putative  35.58 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42786  normal  0.0669072 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3617  hypothetical protein  32.95 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0942  hypothetical protein  32.98 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  26.85 
 
 		 596 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  29.17 
 
 		 593 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0324  tetraheme cytochrome c, putative  38.1 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0275  tetraheme cytochrome c, putative  36.25 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173309 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1413  tetraheme cytochrome c, putative  36.25 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0137  fumarate reductase flavoprotein subunit  32.5 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100425  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1444  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  32.2 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000626372 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1830  flavocytochrome c heme subunit  33.04 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3182  hypothetical protein  26.67 
 
 		 118 aa  51.2  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2085  flavocytochrome c heme subunit  37.11 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.952774  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2786  hypothetical protein  27.93 
 
 		 113 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.12053 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3683  hypothetical protein  31.82 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3388  hypothetical protein  25.21 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0887  hypothetical protein  29.73 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.590211  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1445  flavocytochrome c heme subunit  31.52 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0515  hypothetical protein  25.93 
 
 		 96 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0244  hypothetical protein  32.46 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1504  cytochrome c3  29.51 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3051  cytochrome c, putative  22.33 
 
 		 650 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.315453  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3159  cytochrome c, putative  22.33 
 
 		 652 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>