48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1991 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1991  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  100 
 
 		 357 aa  731    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2802  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  58.87 
 
 		 387 aa  451  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470067 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3366  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  61.58 
 
 		 375 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3533  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  62.82 
 
 		 352 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.292009 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3346  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  56.65 
 
 		 354 aa  404  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0979105  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1052  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  58.23 
 
 		 355 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.61821 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1229  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  57.88 
 
 		 359 aa  394  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1048  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  55.91 
 
 		 355 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.785467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1113  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  55.91 
 
 		 355 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3216  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  57.88 
 
 		 363 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3355  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  54.47 
 
 		 364 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1151  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  54.04 
 
 		 359 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.451598 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3216  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  57.58 
 
 		 363 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0984  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  48.43 
 
 		 345 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2132  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  36.96 
 
 		 331 aa  205  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.201877  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3254  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  32.65 
 
 		 356 aa  204  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00636832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000318  periplasmic protein TorT precursor  37.08 
 
 		 334 aa  200  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.393901  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0649  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  35.88 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2440  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  31.32 
 
 		 353 aa  195  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.725548  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1827  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  36.67 
 
 		 356 aa  193  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0125  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  30.59 
 
 		 356 aa  187  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209333  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1112  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  33.33 
 
 		 342 aa  183  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00670153  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1231  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  33.01 
 
 		 342 aa  181  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2129  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  33.33 
 
 		 342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2648  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  32.68 
 
 		 342 aa  178  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.058876  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2601  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  32.68 
 
 		 342 aa  178  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.429826 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1105  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  32.68 
 
 		 342 aa  178  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00997  periplasmic sensory protein associated with the TorRS two-component regulatory system  32.68 
 
 		 342 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01004  hypothetical protein  32.68 
 
 		 342 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3243  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.89 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4108  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  31.64 
 
 		 346 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4157  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  31.64 
 
 		 346 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4036  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  31.92 
 
 		 346 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2050  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.39 
 
 		 357 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285756  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4053  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  31.92 
 
 		 346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06120  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  37.68 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4215  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  31.92 
 
 		 346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2281  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  33.22 
 
 		 321 aa  150  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2211  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  27.3 
 
 		 379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0668352  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3890  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  30.12 
 
 		 360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3816  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  29.19 
 
 		 360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0443  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  28.57 
 
 		 360 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0421  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  26.77 
 
 		 361 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.553546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4012  hypothetical protein  49.02 
 
 		 109 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3274  putative ABC transporter, periplasmic-binding protein y4mI-like protein  22.74 
 
 		 329 aa  50.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501296  normal  0.467676 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3044  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  20.21 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4013  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.37 
 
 		 199 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3307  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  20.71 
 
 		 337 aa  42.7  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>