More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0489 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3398  FAD dependent oxidoreductase  77.8 
 
 		 442 aa  729    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2235  FAD dependent oxidoreductase  69.37 
 
 		 447 aa  655    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.622258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0489  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 446 aa  927    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2389  FAD dependent oxidoreductase  65.84 
 
 		 446 aa  625  1e-178  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.986344 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2005  FAD dependent oxidoreductase  65.54 
 
 		 443 aa  620  1e-176  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.343798  normal  0.360324 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2458  FAD dependent oxidoreductase  58.92 
 
 		 442 aa  541  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1461  putative oxidoreductase  46.29 
 
 		 454 aa  405  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6224  FAD dependent oxidoreductase  39.73 
 
 		 473 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01621  putative oxidoreductase  39.08 
 
 		 452 aa  309  6.999999999999999e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4363  FAD dependent oxidoreductase  38.62 
 
 		 471 aa  299  7e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4526  FAD dependent oxidoreductase  38.55 
 
 		 469 aa  297  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.719592  normal  0.292372 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4012  FAD dependent oxidoreductase  39.25 
 
 		 462 aa  297  3e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0139  FAD dependent oxidoreductase  38.98 
 
 		 464 aa  295  8e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2003  FAD dependent oxidoreductase  38.44 
 
 		 471 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0685  putative taurine dehydrogenase, large subunit  38.39 
 
 		 472 aa  294  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0118  FAD dependent oxidoreductase  37.42 
 
 		 464 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1829  putative FAD-dependent oxidoreductase  36.36 
 
 		 464 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.226522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1643  FAD dependent oxidoreductase  36.89 
 
 		 463 aa  285  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2019  FAD dependent oxidoreductase  37.25 
 
 		 473 aa  284  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3750  FAD dependent oxidoreductase  37.25 
 
 		 479 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4863  FAD dependent oxidoreductase  34.81 
 
 		 466 aa  272  7e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4289  FAD dependent oxidoreductase  36.44 
 
 		 499 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0106855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3850  FAD dependent oxidoreductase  34.71 
 
 		 482 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.885926  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3503  FAD dependent oxidoreductase  34.22 
 
 		 466 aa  259  6e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4759  FAD dependent oxidoreductase  36.1 
 
 		 462 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0954  FAD dependent oxidoreductase  32.72 
 
 		 445 aa  210  4e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.650756  normal  0.921941 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2980  FAD dependent oxidoreductase  32.31 
 
 		 435 aa  189  5.999999999999999e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.104228  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  31.79 
 
 		 435 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  32.2 
 
 		 430 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  31.37 
 
 		 432 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 		 430 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 426 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  30.24 
 
 		 424 aa  172  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  31.07 
 
 		 424 aa  172  7.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 		 425 aa  170  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  31.29 
 
 		 434 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0887  putative FAD-binding oxidoreductase  33.76 
 
 		 426 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  29.85 
 
 		 424 aa  166  6.9999999999999995e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 		 427 aa  166  6.9999999999999995e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 		 425 aa  162  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  31.35 
 
 		 433 aa  161  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  29.7 
 
 		 424 aa  160  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  31.97 
 
 		 426 aa  158  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.97 
 
 		 426 aa  158  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  31.97 
 
 		 426 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  31.97 
 
 		 426 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 		 426 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.97 
 
 		 426 aa  157  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  30.41 
 
 		 424 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  31.97 
 
 		 426 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.97 
 
 		 426 aa  157  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 		 428 aa  157  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  31.9 
 
 		 428 aa  157  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6580  FAD dependent oxidoreductase  30.25 
 
 		 442 aa  156  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.785564  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  29.57 
 
 		 427 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  29.83 
 
 		 425 aa  155  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 435 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.75 
 
 		 426 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  31.9 
 
 		 428 aa  153  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 		 435 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.52 
 
 		 426 aa  152  8.999999999999999e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  30.65 
 
 		 430 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  29.13 
 
 		 425 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  30.79 
 
 		 437 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  33.41 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 		 444 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3597  FAD dependent oxidoreductase  32.32 
 
 		 425 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 		 435 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 		 425 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 		 435 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 		 435 aa  151  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 		 425 aa  151  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 		 440 aa  151  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  27.8 
 
 		 444 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0153  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 		 436 aa  150  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185015  hitchhiker  0.000196001 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  31.38 
 
 		 433 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  31.38 
 
 		 433 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  31.56 
 
 		 434 aa  150  5e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 		 435 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 444 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5016  FAD dependent oxidoreductase  29.51 
 
 		 424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.208645  normal  0.555113 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  28.85 
 
 		 425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  30.92 
 
 		 423 aa  149  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 		 427 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  30.52 
 
 		 428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  30.67 
 
 		 428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  31.39 
 
 		 427 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 		 427 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  31.39 
 
 		 427 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 		 435 aa  147  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6151  FAD dependent oxidoreductase  30.2 
 
 		 445 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 		 427 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6592  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 		 424 aa  147  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  31.38 
 
 		 427 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 437 aa  146  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  30.15 
 
 		 430 aa  146  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4421  FAD dependent oxidoreductase  30.07 
 
 		 425 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1494  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 424 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250769  hitchhiker  0.00298171 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 		 435 aa  145  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>