41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0270 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0270  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  495  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2334  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  53.39 
 
 		 658 aa  261  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0217317  normal  0.528208 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2277  Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrF  49.16 
 
 		 639 aa  241  6e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.712445 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0735  hypothetical protein  50.21 
 
 		 256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3634  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  42.26 
 
 		 260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3440  PepSY-associated TM helix domain protein  41.53 
 
 		 258 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3511  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  41.95 
 
 		 258 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0853  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  40.68 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2357  PepSY-associated TM helix  32.13 
 
 		 238 aa  109  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2409  PepSY-associated TM helix  29.75 
 
 		 244 aa  106  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0289711  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0204  hypothetical protein  27.53 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2460  hypothetical protein  31.08 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3754  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.88 
 
 		 359 aa  94  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0303924 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3464  ferredoxin  28.69 
 
 		 375 aa  93.2  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3463  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  33.17 
 
 		 236 aa  92.4  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.234764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.89 
 
 		 359 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0345  PepSY-associated TM helix  32.84 
 
 		 247 aa  86.3  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.965963  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2410  hypothetical protein  25.64 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0940252  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0344  ferredoxin  30.16 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.253262  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2356  hypothetical protein  29.21 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3581  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.71 
 
 		 359 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6817  hypothetical protein  25.51 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2335  hypothetical protein  26.27 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0761845  normal  0.418419 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2276  hypothetical protein  28.43 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0509869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11713  hypothetical protein  27.98 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0343  ferredoxin  28.51 
 
 		 346 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.799415  normal  0.508758 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0271  hypothetical protein  26.56 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6865  hypothetical protein  26.51 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.432634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3580  PepSY-associated TM helix  27.23 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0376  PepSY-associated TM helix  24.66 
 
 		 235 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3510  PepSY-associated TM helix  25.83 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0734  hypothetical protein  28.33 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.611753  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3753  hypothetical protein  24.68 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0289731 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1052  hypothetical protein  26.23 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3439  PepSY-associated TM helix  26.34 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3633  PepSY-associated TM helix  25.86 
 
 		 221 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0854  PepSY-associated TM helix  26.85 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0344  PepSY-associated TM helix  24.88 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.305287 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0536  hypothetical protein  21.61 
 
 		 492 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569284  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05650  hypothetical protein  22.31 
 
 		 492 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  28.71 
 
 		 635 aa  42  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>