More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1687 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0742  tryptophan synthase subunit beta  75.51 
 
 		 403 aa  634    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.782615  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1687  tryptophan synthase, beta subunit  100 
 
 		 403 aa  827    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1700  tryptophan synthase subunit beta  68.77 
 
 		 407 aa  578  1e-164  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.605674  hitchhiker  0.0000000413571 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1954  tryptophan synthase subunit beta  69.21 
 
 		 400 aa  576  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1989  tryptophan synthase subunit beta  67.68 
 
 		 400 aa  558  1e-158  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0603681  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2965  tryptophan synthase subunit beta  67.77 
 
 		 401 aa  555  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.204496  normal  0.0390999 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1513  tryptophan synthase subunit beta  66.33 
 
 		 401 aa  547  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0165  tryptophan synthase subunit beta  66.33 
 
 		 401 aa  547  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.522079  normal  0.230942 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1358  tryptophan synthase, beta subunit  68.02 
 
 		 399 aa  536  1e-151  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.33574 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001499  tryptophan synthase beta chain like protein  67.01 
 
 		 407 aa  512  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.845201  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1244  tryptophan synthase subunit beta  65.38 
 
 		 406 aa  507  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3216  tryptophan synthase subunit beta  61.28 
 
 		 400 aa  499  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.428268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1460  tryptophan synthase subunit beta  62.56 
 
 		 406 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000184995  normal  0.0669492 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3688  tryptophan synthase subunit beta  60.93 
 
 		 400 aa  486  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00755497  normal  0.13811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1800  tryptophan synthase subunit beta  59.55 
 
 		 402 aa  475  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.755305  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2001  tryptophan synthase subunit beta  60.41 
 
 		 393 aa  474  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.642175  normal  0.209824 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0198  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 408 aa  471  1e-132  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0961  tryptophan synthase subunit beta  55.7 
 
 		 402 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0583  tryptophan synthase subunit beta  54.66 
 
 		 403 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000031212  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  54.38 
 
 		 399 aa  434  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  54.38 
 
 		 399 aa  434  1e-120  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_52286  tryptophan synthase, beta chain  55.13 
 
 		 385 aa  431  1e-120  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  53.32 
 
 		 403 aa  432  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  54.26 
 
 		 409 aa  433  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  53.61 
 
 		 418 aa  432  1e-120  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  54.31 
 
 		 391 aa  429  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  55.18 
 
 		 394 aa  429  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  54.08 
 
 		 401 aa  430  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0798  tryptophan synthase subunit beta  53.63 
 
 		 400 aa  429  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  55.41 
 
 		 395 aa  430  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0551  tryptophan synthase subunit beta  58.14 
 
 		 412 aa  431  1e-119  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3599  tryptophan synthase subunit beta  53.47 
 
 		 420 aa  429  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2817  tryptophan synthase subunit beta  53.73 
 
 		 420 aa  428  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.046962  normal  0.771537 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  53.75 
 
 		 409 aa  425  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  53.47 
 
 		 397 aa  425  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  52.55 
 
 		 401 aa  427  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  52.32 
 
 		 424 aa  424  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.826366 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2521  tryptophan synthase subunit beta  54.76 
 
 		 406 aa  426  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0432  tryptophan synthase subunit beta  52.06 
 
 		 424 aa  422  1e-117  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  52.56 
 
 		 402 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  53.35 
 
 		 394 aa  424  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  54.5 
 
 		 398 aa  421  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0063  tryptophan synthase subunit beta  52.14 
 
 		 414 aa  422  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1771  tryptophan synthase subunit beta  53.94 
 
 		 410 aa  424  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  52.7 
 
 		 405 aa  419  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  52.3 
 
 		 396 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3216  tryptophan synthase, beta subunit  50.51 
 
 		 449 aa  421  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0480  tryptophan synthase subunit beta  52.81 
 
 		 405 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  52.19 
 
 		 397 aa  418  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  52.97 
 
 		 397 aa  419  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  52.97 
 
 		 397 aa  420  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2204  tryptophan synthase subunit beta  51.92 
 
 		 406 aa  420  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205862  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  52.45 
 
 		 400 aa  419  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2843  tryptophan synthase subunit beta  52.97 
 
 		 405 aa  419  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  52.84 
 
 		 412 aa  418  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  52.7 
 
 		 397 aa  420  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0118  tryptophan synthase subunit beta  50.37 
 
 		 413 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2237  tryptophan synthase subunit beta  54.57 
 
 		 440 aa  419  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  52.69 
 
 		 406 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  53.11 
 
 		 409 aa  418  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  52.2 
 
 		 414 aa  419  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2876  tryptophan synthase subunit beta  53.35 
 
 		 414 aa  421  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  52.7 
 
 		 403 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  52.82 
 
 		 397 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  51.41 
 
 		 397 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0201  tryptophan synthase subunit beta  50.61 
 
 		 413 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  50.26 
 
 		 404 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3066  tryptophan synthase subunit beta  52.44 
 
 		 420 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.910366  normal  0.238699 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2763  tryptophan synthase subunit beta  53.66 
 
 		 406 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.785331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  54.17 
 
 		 393 aa  417  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  54.4 
 
 		 401 aa  417  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  52.44 
 
 		 397 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  52.06 
 
 		 397 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  52.44 
 
 		 397 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  51.41 
 
 		 397 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0755  tryptophan synthase subunit beta  52.06 
 
 		 415 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000954006  normal  0.692308 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0097  tryptophan synthase subunit beta  52.17 
 
 		 407 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  52.05 
 
 		 397 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  51.93 
 
 		 397 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  51.41 
 
 		 397 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0176  tryptophan synthase subunit beta  50.75 
 
 		 430 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  52.44 
 
 		 397 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  53.73 
 
 		 434 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  53.61 
 
 		 428 aa  414  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  52.71 
 
 		 399 aa  413  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0776  tryptophan synthase subunit beta  51.5 
 
 		 400 aa  412  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  52.05 
 
 		 397 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  50.13 
 
 		 405 aa  414  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  52.17 
 
 		 399 aa  412  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  52.05 
 
 		 397 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  50.89 
 
 		 410 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  50.13 
 
 		 411 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  52.08 
 
 		 394 aa  412  1e-114  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2139  tryptophan synthase subunit beta  52.76 
 
 		 404 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  50.13 
 
 		 406 aa  413  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  52.05 
 
 		 397 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1872  tryptophan synthase subunit beta  50.75 
 
 		 413 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0911585 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1943  tryptophan synthase subunit beta  51.64 
 
 		 399 aa  413  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.233821  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  52.05 
 
 		 397 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3109  tryptophan synthase subunit beta  52.19 
 
 		 420 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284372  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>