More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1179 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1179  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 		 740 aa  1501    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1273  PAS sensor protein  32.34 
 
 		 728 aa  375  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0744  ATP-binding region ATPase domain protein  52.74 
 
 		 616 aa  270  7e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2005  ATP-binding region ATPase domain protein  50.82 
 
 		 617 aa  262  1e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.144674  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0365  ATP-binding region ATPase domain protein  41.6 
 
 		 553 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000920812  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0449  ATP-binding region ATPase domain protein  38 
 
 		 532 aa  176  9.999999999999999e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000148075  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1546  hypothetical protein  40.73 
 
 		 552 aa  176  9.999999999999999e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3572  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 1341 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 475 aa  172  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2100  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 751 aa  172  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262959 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2118  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 		 751 aa  171  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1018  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 		 441 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00729938  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 666 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3242  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 441 aa  167  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2945  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 		 514 aa  167  9e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 		 933 aa  163  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.493639  hitchhiker  0.0000319453 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1233  PAS sensor protein  30.39 
 
 		 394 aa  163  1e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0290  two component sensor histidine kinase  33.95 
 
 		 689 aa  161  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1876  ATP-binding region ATPase domain protein  39.44 
 
 		 572 aa  161  4e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1804  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 		 592 aa  161  5e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 441 aa  160  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4084  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 441 aa  160  9e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 1171 aa  160  9e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135263 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3595  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 408 aa  159  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000201785  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4378  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 773 aa  159  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 1171 aa  159  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48946  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0595  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 473 aa  158  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2956  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 780 aa  157  9e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.900663 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.68 
 
 		 1306 aa  156  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 839 aa  156  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2534  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 458 aa  155  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0894  ATP-binding region ATPase domain protein  37.83 
 
 		 411 aa  155  4e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0168283  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4041  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 619 aa  154  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 701 aa  154  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000562313  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 1255 aa  153  8.999999999999999e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4132  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 		 619 aa  152  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3536  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 635 aa  151  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1396  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 		 741 aa  151  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540787  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 452 aa  150  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 360 aa  150  9e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2778  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 756 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0687  ATP-binding region ATPase domain protein  34.25 
 
 		 813 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0985  histidine kinase  36.9 
 
 		 394 aa  146  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1118  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 		 452 aa  145  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000972917  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 452 aa  145  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 780 aa  145  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.111266  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2080  ATP-binding region ATPase domain protein  35.15 
 
 		 542 aa  144  5e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 		 660 aa  144  8e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.291882  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  33.08 
 
 		 856 aa  144  8e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 675 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0721  hypothetical protein  38.1 
 
 		 246 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0783179  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0704  ATP-binding region ATPase domain protein  30.35 
 
 		 471 aa  140  7.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00112286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0465  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 469 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.814022  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1040  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  31.47 
 
 		 696 aa  139  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 712 aa  138  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.338238 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0826  histidine kinase  34.32 
 
 		 529 aa  137  5e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0463  histidine kinase  34.27 
 
 		 465 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000902576  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1243  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 403 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 930 aa  134  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.346474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0779  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 434 aa  134  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1921  PAS sensor protein  33.74 
 
 		 407 aa  134  6e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0979  histidine kinase  34.11 
 
 		 687 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0107  ATP-binding region ATPase domain protein  32.5 
 
 		 540 aa  132  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0376  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 		 412 aa  131  5.0000000000000004e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.439809  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0535  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 554 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0900  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 409 aa  130  7.000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1990  histidine kinase  34.73 
 
 		 508 aa  130  8.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.586982  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2138  PAS sensor protein  33.73 
 
 		 516 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2358  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  22.27 
 
 		 916 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0637  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 		 921 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0986  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 487 aa  127  9e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0966  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 556 aa  125  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1665  sensory box sensor histidine kinase, putative  35.92 
 
 		 403 aa  124  6e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1484  sensory box sensor histidine kinase, putative  35.51 
 
 		 403 aa  124  7e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0849  putative two component sensor kinase  27.25 
 
 		 667 aa  123  9.999999999999999e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1041  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.26 
 
 		 1121 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.700011  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0891  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 371 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1363  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 404 aa  120  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1439  histidine kinase  29.89 
 
 		 577 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  22.94 
 
 		 775 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.56 
 
 		 1019 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1870  hypothetical protein  32.68 
 
 		 475 aa  116  2.0000000000000002e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0735  ATP-binding region ATPase domain protein  28.63 
 
 		 682 aa  115  4.0000000000000004e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1379  histidine kinase  28.26 
 
 		 579 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138084  normal  0.0193369 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1858  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.74 
 
 		 1191 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0568  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.2 
 
 		 503 aa  112  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.68 
 
 		 1309 aa  111  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0273  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.45 
 
 		 917 aa  110  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.161492 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0750  histidine kinase  27.73 
 
 		 616 aa  107  9e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.806189  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1222  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 		 686 aa  107  9e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0583301 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  21.79 
 
 		 898 aa  105  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4373  PAS  23.84 
 
 		 907 aa  105  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323082  normal  0.21328 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1442  PAS sensor protein  27.87 
 
 		 669 aa  105  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4833  sensory box histidine kinase  23.99 
 
 		 899 aa  104  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0582  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 587 aa  103  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2012  C4-dicarboxylate transport sensor protein  30.04 
 
 		 611 aa  102  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0911  sensory box histidine kinase  22.31 
 
 		 581 aa  102  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1149  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  18.84 
 
 		 833 aa  101  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355741  normal  0.205094 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1436  histidine kinase  25.94 
 
 		 617 aa  100  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 		 422 aa  98.2  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>