63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3089 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3089  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  483  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  27.42 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0373  hypothetical protein  24.62 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0711118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1457  protein of unknown function DUF541  23.12 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.660121  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2545  hypothetical protein  26.34 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394305  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  30.41 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3918  hypothetical protein  24.2 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4070  hypothetical protein  26.19 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3310  hypothetical protein  27.72 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.653743 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3721  protein of unknown function DUF541  23.7 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.914927 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0600  hypothetical protein  23.66 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  26.06 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  26.06 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  26.06 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  26.79 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  26.91 
 
 		 243 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3926  hypothetical protein  28.06 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  26.79 
 
 		 237 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  25.74 
 
 		 266 aa  52.8  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  26.79 
 
 		 237 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2769  protein of unknown function DUF541  26.22 
 
 		 247 aa  53.1  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  26.79 
 
 		 237 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3826  hypothetical protein  23.77 
 
 		 256 aa  52.8  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002478  hypothetical protein  24.34 
 
 		 230 aa  52.8  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.655633  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  25.74 
 
 		 259 aa  52.8  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  29.82 
 
 		 247 aa  52.8  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1341  protein of unknown function DUF541  30.77 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0035  hypothetical protein  25.3 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3685  hypothetical protein  24.32 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  23.81 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03557  hypothetical protein  24.45 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3168  hypothetical protein  26.95 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3820  hypothetical protein  25.32 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.855963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  23.53 
 
 		 245 aa  50.1  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3882  hypothetical protein  25.21 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0683  hypothetical protein  23.81 
 
 		 236 aa  49.3  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2255  hypothetical protein  28.98 
 
 		 241 aa  49.3  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.838126 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  24.58 
 
 		 244 aa  48.9  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13213  hypothetical protein  26.46 
 
 		 229 aa  48.9  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0558  hypothetical protein  22.88 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  25.11 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  25.6 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  24.85 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  24.54 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  22.86 
 
 		 229 aa  46.6  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0793  hypothetical protein  26.14 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4941  hypothetical protein  24.85 
 
 		 238 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.80121  hitchhiker  0.0000379681 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0517  hypothetical protein  25.97 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  24.07 
 
 		 244 aa  45.8  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  22.64 
 
 		 240 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  24.77 
 
 		 238 aa  45.4  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0947  hypothetical protein  26.78 
 
 		 241 aa  45.4  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.328816  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  26.11 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  23.84 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  25.68 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0357  protein of unknown function DUF541  26.03 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00987927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  25.16 
 
 		 281 aa  44.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3335  hypothetical protein  23.71 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.176953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  27.98 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  26.62 
 
 		 248 aa  43.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  20.09 
 
 		 248 aa  42.7  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  25 
 
 		 236 aa  42  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  24.66 
 
 		 250 aa  42  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>