38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2539 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1741  Tol-Pal system TolA  99.71 
 
 		 340 aa  656    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057982  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2539  protein TolA  100 
 
 		 340 aa  657    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102859  hitchhiker  0.00000353705 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1745  TolA family protein  96.78 
 
 		 342 aa  532  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000294178  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1784  protein TolA  96.18 
 
 		 341 aa  511  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000349437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2532  TolA family protein  87.94 
 
 		 340 aa  451  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000043804  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2441  TolA family protein  87.65 
 
 		 340 aa  451  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000397376  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2369  TolA family protein  87.65 
 
 		 340 aa  450  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000264795  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2749  tolA protein  87.5 
 
 		 345 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1606  TolA family protein  83.82 
 
 		 329 aa  443  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000895247  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1393  hypothetical protein  61.11 
 
 		 328 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536616  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1856  TolA family protein  61.47 
 
 		 319 aa  332  8e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0299684  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2565  Tol-Pal system TolA  62.35 
 
 		 311 aa  329  4e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000197392  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1461  TolA family protein  59.94 
 
 		 320 aa  297  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00341972  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2087  hypothetical protein  44.41 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2940  hypothetical protein  39.64 
 
 		 298 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000421874  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1526  TolA family protein  66.67 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124316  normal  0.623667 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1730  putative tolA protein  37.42 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2732  protein TolA  67.12 
 
 		 309 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00666488  hitchhiker  0.0000225144 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1897  TolA protein, membrane component  33.23 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02685  TolA-like protein  45.9 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00715679  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003914  TolA protein  31.88 
 
 		 354 aa  116  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0635795  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1430  tolA protein  34.81 
 
 		 356 aa  116  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000458161  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  34.57 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  34.26 
 
 		 332 aa  95.9  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0726  TolA family protein  43.33 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0649134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01609  hypothetical protein  30.7 
 
 		 342 aa  87.4  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  31.68 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  33.49 
 
 		 271 aa  62.4  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2049  colicin uptake-like protein  33.33 
 
 		 146 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1248  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  35.92 
 
 		 395 aa  52  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000169991  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18871  predicted protein  25.37 
 
 		 1682 aa  47  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00445245  hitchhiker  0.0000013419 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0768  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  27.41 
 
 		 432 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263681  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2916  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  26.09 
 
 		 423 aa  44.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000145417  normal  0.52602 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0762  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  26.03 
 
 		 426 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000171784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0473  hypothetical protein  19.41 
 
 		 1104 aa  44.3  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3088  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  43.24 
 
 		 386 aa  43.9  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00644238  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0842  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  29.75 
 
 		 424 aa  43.5  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000389137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0261  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  27.96 
 
 		 351 aa  43.5  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00647443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>