More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2113 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2113  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 359 aa  738    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0135446  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2519  AraC family transcriptional regulator  67.1 
 
 		 383 aa  511  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2205  AraC family transcriptional regulator  66.25 
 
 		 392 aa  511  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2080  AraC family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 407 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1895  AraC family transcriptional regulator  63.88 
 
 		 407 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.375794  normal  0.452206 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2350  AraC family transcriptional regulator  96.92 
 
 		 130 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2125  helix-turn-helix domain-containing protein  95.38 
 
 		 130 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2234  helix-turn-helix domain-containing protein  91.92 
 
 		 99 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.440847  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02396  transcriptional regulator, AraC family protein  29.17 
 
 		 450 aa  130  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.372972  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04940  Transcriptional regulator, AraC family  31.36 
 
 		 344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.543435  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4066  AraC family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 343 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.138885  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3244  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.479288  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3991  AraC family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 353 aa  124  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.628776  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5539  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 364 aa  109  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 345 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0976  transcriptional regulator, AraC family  25.35 
 
 		 341 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2972  AraC family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 364 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.183535 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6270  AraC family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 369 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1559  AraC family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 369 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565202  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 366 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6759  AraC family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 369 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4002  AraC family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 361 aa  96.3  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 366 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6811  AraC family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 366 aa  89.7  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3981  putative transcriptional regulator  26.4 
 
 		 339 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3638  AraC family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 360 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4528  helix-turn-helix domain-containing protein  22.9 
 
 		 345 aa  86.3  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 340 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 339 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29180  AraC family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 339 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  23.82 
 
 		 332 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2336  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49150  transcriptional regulator  29.59 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236586 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3167  AraC family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4197  transcriptional regulator  29.01 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510712  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4600  AraC family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 355 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3760  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 356 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0904423  normal  0.271559 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3763  AraC family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 356 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.570935  normal  0.387809 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5492  AraC family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4967  AraC family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 360 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2577  AraC family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5805  AraC family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597808  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3897  transcriptional regulator, AraC family  25.29 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1759  AraC family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 338 aa  80.5  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.206949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70290  putative transcriptional regulator  22.44 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6100  putative transcriptional regulator  22.73 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177134  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  30.11 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  26.38 
 
 		 339 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 345 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1868  transcriptional regulator, AraC family  30.11 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 382 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  26.91 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  26.91 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  27.06 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2021  transcriptional regulator, AraC family  22.65 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  25.46 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  23.92 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4237  AraC family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339126  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  25.36 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3110  helix-turn-helix domain-containing protein  27.08 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  24.93 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1128  transcriptional regulator, AraC family  27.11 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 348 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  23.92 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  23.92 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3748  transcriptional regulator, AraC family  26.02 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1372  transcriptional regulator, AraC family  23.36 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0658306  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  22.42 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7549  AraC family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0477  AraC family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6019  transcriptional regulator, Fis family  26.98 
 
 		 365 aa  73.2  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5670  transcriptional regulator, AraC family  26.04 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0451  AraC family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 330 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16370  Transcriptional regulator, AraC family  25.07 
 
 		 338 aa  72.4  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  45.68 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1661  AraC family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000279685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0246  AraC family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4692  transcriptional regulator, AraC family  28.34 
 
 		 194 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 347 aa  72  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  21.78 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5855  AraC family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4938  AraC family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0084  helix-turn-helix domain-containing protein  26.15 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2118  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0916318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1439  AraC family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>